MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 88030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
88001	NC_010001	TCA	2	6	4844903	4844908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160882061
88002	NC_010001	GCTT	2	8	4844912	4844919	0 %	50 %	25 %	25 %	160882061
88003	NC_010001	GCT	2	6	4844941	4844946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160882061
88004	NC_010001	ATT	2	6	4845000	4845005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160882061
88005	NC_010001	AAGTT	2	10	4845083	4845092	40 %	40 %	20 %	0 %	160882061
88006	NC_010001	ATTT	2	8	4845191	4845198	25 %	75 %	0 %	0 %	160882061
88007	NC_010001	TGAATA	2	12	4845304	4845315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	160882061
88008	NC_010001	CAT	2	6	4845332	4845337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160882061
88009	NC_010001	CAT	2	6	4845350	4845355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160882061
88010	NC_010001	TAA	2	6	4845417	4845422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160882061
88011	NC_010001	TGCT	2	8	4845480	4845487	0 %	50 %	25 %	25 %	160882061
88012	NC_010001	T	6	6	4845510	4845515	0 %	100 %	0 %	0 %	160882061
88013	NC_010001	TGC	2	6	4845583	4845588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160882061
88014	NC_010001	AAGCAT	2	12	4845603	4845614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	160882061
88015	NC_010001	AT	3	6	4845684	4845689	50 %	50 %	0 %	0 %	160882061
88016	NC_010001	ATA	2	6	4845700	4845705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160882061
88017	NC_010001	TTC	2	6	4845870	4845875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160882062
88018	NC_010001	CT	3	6	4845969	4845974	0 %	50 %	0 %	50 %	160882062
88019	NC_010001	AT	3	6	4845986	4845991	50 %	50 %	0 %	0 %	160882062
88020	NC_010001	TCA	2	6	4846029	4846034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160882062
88021	NC_010001	TTA	2	6	4846190	4846195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160882063
88022	NC_010001	TACAAT	2	12	4846272	4846283	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	160882063
88023	NC_010001	TAAT	2	8	4846331	4846338	50 %	50 %	0 %	0 %	160882063
88024	NC_010001	TAC	2	6	4846356	4846361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160882063
88025	NC_010001	T	6	6	4846374	4846379	0 %	100 %	0 %	0 %	160882063
88026	NC_010001	ACAT	2	8	4846426	4846433	50 %	25 %	0 %	25 %	160882063
88027	NC_010001	TTA	2	6	4846444	4846449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160882063
88028	NC_010001	TTG	2	6	4846485	4846490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160882063
88029	NC_010001	T	6	6	4846495	4846500	0 %	100 %	0 %	0 %	160882063
88030	NC_010001	T	6	6	4846856	4846861	0 %	100 %	0 %	0 %	160882064

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.