MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 88030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010001	GCA	2	6	313342	313347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878412
5502	NC_010001	GCA	2	6	313387	313392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878412
5503	NC_010001	TA	3	6	314514	314519	50 %	50 %	0 %	0 %	160878413
5504	NC_010001	TTG	2	6	314734	314739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878413
5505	NC_010001	GA	3	6	314751	314756	50 %	0 %	50 %	0 %	160878413
5506	NC_010001	ATCC	2	8	314815	314822	25 %	25 %	0 %	50 %	160878413
5507	NC_010001	T	6	6	314823	314828	0 %	100 %	0 %	0 %	160878413
5508	NC_010001	AGA	2	6	314912	314917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878413
5509	NC_010001	TG	3	6	314922	314927	0 %	50 %	50 %	0 %	160878413
5510	NC_010001	CTT	2	6	314937	314942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878413
5511	NC_010001	TGA	2	6	314978	314983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878413
5512	NC_010001	TAA	2	6	315438	315443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878414
5513	NC_010001	GA	3	6	315471	315476	50 %	0 %	50 %	0 %	160878414
5514	NC_010001	AGATA	2	10	315499	315508	60 %	20 %	20 %	0 %	160878414
5515	NC_010001	ATG	2	6	315527	315532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878414
5516	NC_010001	GAT	2	6	315542	315547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878414
5517	NC_010001	AGT	2	6	315631	315636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878414
5518	NC_010001	TTA	2	6	315673	315678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878414
5519	NC_010001	TTC	2	6	315702	315707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878414
5520	NC_010001	GAA	2	6	315714	315719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5521	NC_010001	TGAGA	2	10	315724	315733	40 %	20 %	40 %	0 %	160878414
5522	NC_010001	AGA	2	6	315920	315925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5523	NC_010001	ACAA	2	8	315956	315963	75 %	0 %	0 %	25 %	160878414
5524	NC_010001	TTAT	2	8	315999	316006	25 %	75 %	0 %	0 %	160878414
5525	NC_010001	GA	3	6	316024	316029	50 %	0 %	50 %	0 %	160878414
5526	NC_010001	ATC	2	6	316043	316048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878414
5527	NC_010001	CTC	2	6	316086	316091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878414
5528	NC_010001	ATC	2	6	316199	316204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878414
5529	NC_010001	AGA	2	6	316210	316215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5530	NC_010001	TGT	2	6	316237	316242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878414
5531	NC_010001	CTT	2	6	316300	316305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878414
5532	NC_010001	ATA	2	6	316350	316355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878414
5533	NC_010001	TAT	2	6	316453	316458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878414
5534	NC_010001	AGA	2	6	316466	316471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5535	NC_010001	GTAAAG	2	12	316514	316525	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	160878414
5536	NC_010001	AG	3	6	316524	316529	50 %	0 %	50 %	0 %	160878414
5537	NC_010001	CTT	2	6	316564	316569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878414
5538	NC_010001	AATA	2	8	316571	316578	75 %	25 %	0 %	0 %	160878414
5539	NC_010001	A	6	6	316583	316588	100 %	0 %	0 %	0 %	160878414
5540	NC_010001	GAA	2	6	316616	316621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5541	NC_010001	ACCA	2	8	316663	316670	50 %	0 %	0 %	50 %	160878414
5542	NC_010001	AG	3	6	316719	316724	50 %	0 %	50 %	0 %	160878414
5543	NC_010001	GAA	2	6	316814	316819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5544	NC_010001	ATT	2	6	316828	316833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878414
5545	NC_010001	AAAGAA	2	12	316834	316845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	160878414
5546	NC_010001	CAAC	2	8	316935	316942	50 %	0 %	0 %	50 %	160878414
5547	NC_010001	GGT	2	6	316994	316999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878414
5548	NC_010001	GTC	2	6	317067	317072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878414
5549	NC_010001	GAT	2	6	317114	317119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878414
5550	NC_010001	GTTT	2	8	317127	317134	0 %	75 %	25 %	0 %	160878414
5551	NC_010001	AGA	2	6	317235	317240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5552	NC_010001	ATA	2	6	317247	317252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878414
5553	NC_010001	TCT	2	6	317272	317277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878414
5554	NC_010001	AAT	2	6	317294	317299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878414
5555	NC_010001	AAG	2	6	317326	317331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5556	NC_010001	GA	3	6	317356	317361	50 %	0 %	50 %	0 %	160878414
5557	NC_010001	GAT	2	6	317374	317379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878414
5558	NC_010001	CGA	2	6	317419	317424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878414
5559	NC_010001	AGA	2	6	317434	317439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5560	NC_010001	ATT	2	6	317477	317482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878414
5561	NC_010001	AATT	2	8	317538	317545	50 %	50 %	0 %	0 %	160878414
5562	NC_010001	AGTTA	2	10	317566	317575	40 %	40 %	20 %	0 %	160878414
5563	NC_010001	GAAG	2	8	317584	317591	50 %	0 %	50 %	0 %	160878414
5564	NC_010001	AGAA	2	8	317604	317611	75 %	0 %	25 %	0 %	160878414
5565	NC_010001	CTT	2	6	317639	317644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878414
5566	NC_010001	ATGG	2	8	317662	317669	25 %	25 %	50 %	0 %	160878414
5567	NC_010001	GAT	2	6	317678	317683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878414
5568	NC_010001	AG	3	6	317727	317732	50 %	0 %	50 %	0 %	160878414
5569	NC_010001	AGA	2	6	317797	317802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878414
5570	NC_010001	TGA	2	6	317884	317889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878414
5571	NC_010001	AG	3	6	317913	317918	50 %	0 %	50 %	0 %	160878414
5572	NC_010001	TCCATG	2	12	317944	317955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	160878414
5573	NC_010001	GGA	2	6	318280	318285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878415
5574	NC_010001	ACA	2	6	318379	318384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878415
5575	NC_010001	ATG	2	6	318387	318392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878415
5576	NC_010001	GAA	2	6	318422	318427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878415
5577	NC_010001	CTGAT	2	10	318435	318444	20 %	40 %	20 %	20 %	160878415
5578	NC_010001	GAG	2	6	318488	318493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878415
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5580	NC_010001	TGCA	2	8	318552	318559	25 %	25 %	25 %	25 %	160878415
5581	NC_010001	GCGG	2	8	318563	318570	0 %	0 %	75 %	25 %	160878415
5582	NC_010001	AG	3	6	318574	318579	50 %	0 %	50 %	0 %	160878415
5583	NC_010001	GTAT	2	8	318606	318613	25 %	50 %	25 %	0 %	160878415
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5586	NC_010001	AGAC	2	8	318794	318801	50 %	0 %	25 %	25 %	160878415
5587	NC_010001	GATATT	2	12	318842	318853	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	160878415
5588	NC_010001	ATG	2	6	318861	318866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878415
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5590	NC_010001	CAT	2	6	318927	318932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878415
5591	NC_010001	ATAAGG	2	12	319005	319016	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	160878415
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5593	NC_010001	GTG	2	6	319089	319094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878415
5594	NC_010001	ATTC	2	8	319250	319257	25 %	50 %	0 %	25 %	160878415
5595	NC_010001	CAA	2	6	319538	319543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878416
5596	NC_010001	AGT	2	6	319548	319553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878416
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5599	NC_010001	ATTG	2	8	319749	319756	25 %	50 %	25 %	0 %	160878416
5600	NC_010001	TGAA	2	8	319835	319842	50 %	25 %	25 %	0 %	160878416
5601	NC_010001	TAG	2	6	319886	319891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878416
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5604	NC_010001	TGA	3	9	319941	319949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878416
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5607	NC_010001	AGC	2	6	320411	320416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878417
5608	NC_010001	TTA	2	6	320477	320482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878417
5609	NC_010001	ATT	2	6	320485	320490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878417
5610	NC_010001	TA	3	6	320526	320531	50 %	50 %	0 %	0 %	160878417
5611	NC_010001	ATG	2	6	320551	320556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878417
5612	NC_010001	GCA	2	6	320586	320591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878417
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5620	NC_010001	TGT	2	6	320951	320956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878417
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5990	NC_010001	TAA	2	6	340308	340313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878430
5991	NC_010001	AAAAT	2	10	340388	340397	80 %	20 %	0 %	0 %	160878430
5992	NC_010001	GAAA	2	8	340398	340405	75 %	0 %	25 %	0 %	160878430
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