MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 88030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	CTT	2	6	165	170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878163
2	NC_010001	ATG	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
3	NC_010001	GAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
4	NC_010001	AATA	2	8	261	268	75 %	25 %	0 %	0 %	160878163
5	NC_010001	CTT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878163
6	NC_010001	AATAA	2	10	381	390	80 %	20 %	0 %	0 %	160878163
7	NC_010001	A	6	6	389	394	100 %	0 %	0 %	0 %	160878163
8	NC_010001	CTTA	2	8	406	413	25 %	50 %	0 %	25 %	160878163
9	NC_010001	GCA	2	6	471	476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878163
10	NC_010001	TATT	2	8	520	527	25 %	75 %	0 %	0 %	160878163
11	NC_010001	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878163
12	NC_010001	TA	3	6	579	584	50 %	50 %	0 %	0 %	160878163
13	NC_010001	TAC	2	6	671	676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878163
14	NC_010001	TTA	2	6	717	722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
15	NC_010001	GAT	2	6	726	731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
16	NC_010001	TAT	2	6	740	745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
17	NC_010001	AGAA	2	8	752	759	75 %	0 %	25 %	0 %	160878163
18	NC_010001	A	7	7	803	809	100 %	0 %	0 %	0 %	160878163
19	NC_010001	ATT	2	6	816	821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
20	NC_010001	GAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
21	NC_010001	A	6	6	945	950	100 %	0 %	0 %	0 %	160878163
22	NC_010001	GAA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
23	NC_010001	TGA	3	9	974	982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
24	NC_010001	AGA	2	6	1072	1077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
25	NC_010001	AAG	2	6	1078	1083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
26	NC_010001	AGA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
27	NC_010001	ATA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
28	NC_010001	TTA	2	6	1159	1164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
29	NC_010001	GTT	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878163
30	NC_010001	TAC	2	6	1187	1192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878163
31	NC_010001	GAT	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
32	NC_010001	TAA	2	6	1349	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
33	NC_010001	AAG	2	6	1371	1376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
34	NC_010001	TCCT	2	8	1379	1386	0 %	50 %	0 %	50 %	160878163
35	NC_010001	ATTA	2	8	1406	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	160878163
36	NC_010001	A	7	7	1413	1419	100 %	0 %	0 %	0 %	160878163
37	NC_010001	ATA	2	6	1433	1438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
38	NC_010001	GAAT	2	8	1869	1876	50 %	25 %	25 %	0 %	160878164
39	NC_010001	TTC	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878164
40	NC_010001	ATTAA	2	10	1972	1981	60 %	40 %	0 %	0 %	160878164
41	NC_010001	T	6	6	2066	2071	0 %	100 %	0 %	0 %	160878164
42	NC_010001	ATA	2	6	2077	2082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
43	NC_010001	AGA	2	6	2184	2189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
44	NC_010001	GAAG	2	8	2217	2224	50 %	0 %	50 %	0 %	160878164
45	NC_010001	AAG	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
46	NC_010001	T	6	6	2273	2278	0 %	100 %	0 %	0 %	160878164
47	NC_010001	TAA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
48	NC_010001	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878164
49	NC_010001	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
50	NC_010001	AAG	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
51	NC_010001	TATTTG	2	12	2519	2530	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	160878164
52	NC_010001	TAA	2	6	2622	2627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
53	NC_010001	A	6	6	2626	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	160878164
54	NC_010001	TAGA	2	8	2648	2655	50 %	25 %	25 %	0 %	160878164
55	NC_010001	TTAA	2	8	2665	2672	50 %	50 %	0 %	0 %	160878164
56	NC_010001	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878164
57	NC_010001	A	6	6	2713	2718	100 %	0 %	0 %	0 %	160878164
58	NC_010001	GATATT	2	12	2761	2772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	160878164
59	NC_010001	TGA	3	9	2841	2849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878164
60	NC_010001	TTC	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878164
61	NC_010001	GCA	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878164
62	NC_010001	AT	3	6	3095	3100	50 %	50 %	0 %	0 %	160878165
63	NC_010001	A	6	6	3103	3108	100 %	0 %	0 %	0 %	160878165
64	NC_010001	AGA	2	6	3119	3124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878165
65	NC_010001	TTG	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878165
66	NC_010001	TTA	2	6	3193	3198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878165
67	NC_010001	A	8	8	3245	3252	100 %	0 %	0 %	0 %	160878165
68	NC_010001	TGG	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878165
69	NC_010001	TCG	2	6	3298	3303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878165
70	NC_010001	GAT	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
71	NC_010001	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
72	NC_010001	AGA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
73	NC_010001	GAT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
74	NC_010001	ATC	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878166
75	NC_010001	A	9	9	4130	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	160878166
76	NC_010001	TCT	2	6	4182	4187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878166
77	NC_010001	ATT	2	6	4190	4195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
78	NC_010001	TGT	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878166
79	NC_010001	T	7	7	4215	4221	0 %	100 %	0 %	0 %	160878166
80	NC_010001	GGA	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878166
81	NC_010001	TAAG	2	8	4297	4304	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
82	NC_010001	ACA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878166
83	NC_010001	TTA	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
84	NC_010001	TG	3	6	4406	4411	0 %	50 %	50 %	0 %	160878166
85	NC_010001	AATT	2	8	4420	4427	50 %	50 %	0 %	0 %	160878166
86	NC_010001	AG	4	8	4451	4458	50 %	0 %	50 %	0 %	160878166
87	NC_010001	ATGA	2	8	4476	4483	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
88	NC_010001	TTA	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
89	NC_010001	A	6	6	4503	4508	100 %	0 %	0 %	0 %	160878166
90	NC_010001	AGA	2	6	4523	4528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
91	NC_010001	GCA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878166
92	NC_010001	CTG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878166
93	NC_010001	GAT	2	6	4785	4790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
94	NC_010001	TAGA	2	8	4804	4811	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
95	NC_010001	TTA	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
96	NC_010001	TTG	2	6	4840	4845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878166
97	NC_010001	GAA	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
98	NC_010001	TAG	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878167
99	NC_010001	AAAC	2	8	5224	5231	75 %	0 %	0 %	25 %	160878167
100	NC_010001	A	6	6	5235	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	160878167
101	NC_010001	CGG	2	6	5282	5287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160878167
102	NC_010001	GGA	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878167
103	NC_010001	GGA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878167
104	NC_010001	GTT	2	6	5448	5453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878167
105	NC_010001	AAC	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
106	NC_010001	GAA	2	6	5511	5516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878167
107	NC_010001	TATGAT	2	12	5523	5534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	160878167
108	NC_010001	AAC	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
109	NC_010001	ATT	2	6	5586	5591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
110	NC_010001	GAA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878167
111	NC_010001	TAAA	2	8	5689	5696	75 %	25 %	0 %	0 %	160878167
112	NC_010001	TGCAA	2	10	5765	5774	40 %	20 %	20 %	20 %	160878167
113	NC_010001	GTT	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878167
114	NC_010001	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878167
115	NC_010001	GGT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878167
116	NC_010001	ATT	2	6	5967	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
117	NC_010001	ACAA	2	8	6005	6012	75 %	0 %	0 %	25 %	160878167
118	NC_010001	AGC	2	6	6041	6046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878167
119	NC_010001	TGC	2	6	6152	6157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878167
120	NC_010001	TA	3	6	6264	6269	50 %	50 %	0 %	0 %	160878167
121	NC_010001	GGT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878167
122	NC_010001	AAC	2	6	6393	6398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
123	NC_010001	TGA	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878167
124	NC_010001	ATT	3	9	6477	6485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
125	NC_010001	CCGATG	2	12	6490	6501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	160878167
126	NC_010001	TAT	2	6	6526	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
127	NC_010001	AATT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	160878167
128	NC_010001	ACC	2	6	6593	6598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160878167
129	NC_010001	AGCA	2	8	6618	6625	50 %	0 %	25 %	25 %	160878167
130	NC_010001	ACA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
131	NC_010001	ACA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
132	NC_010001	GA	3	6	6765	6770	50 %	0 %	50 %	0 %	160878167
133	NC_010001	GATG	2	8	6791	6798	25 %	25 %	50 %	0 %	160878167
134	NC_010001	TTC	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878167
135	NC_010001	TAC	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878167
136	NC_010001	ATG	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878168
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