MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome

Total Repeats: 37480

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009954	CTTA	2	8	2	9	25 %	50 %	0 %	25 %	159040593
2	NC_009954	CCT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040593
3	NC_009954	CCT	4	12	39	50	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040593
4	NC_009954	CAG	2	6	69	74	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040593
5	NC_009954	CAC	2	6	75	80	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
6	NC_009954	TAT	4	12	81	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
7	NC_009954	TAT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
8	NC_009954	TCA	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040593
9	NC_009954	GGC	2	6	378	383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159040593
10	NC_009954	CACT	2	8	407	414	25 %	25 %	0 %	50 %	159040593
11	NC_009954	GCT	2	6	576	581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040593
12	NC_009954	ACC	2	6	591	596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
13	NC_009954	AC	3	6	662	667	50 %	0 %	0 %	50 %	159040593
14	NC_009954	CACT	2	8	689	696	25 %	25 %	0 %	50 %	159040593
15	NC_009954	AAC	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
16	NC_009954	ACCAT	2	10	766	775	40 %	20 %	0 %	40 %	159040593
17	NC_009954	ACC	2	6	813	818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
18	NC_009954	ACA	3	9	949	957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
19	NC_009954	TCAC	2	8	964	971	25 %	25 %	0 %	50 %	159040593
20	NC_009954	ACC	2	6	972	977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
21	NC_009954	ACCAT	2	10	988	997	40 %	20 %	0 %	40 %	159040593
22	NC_009954	CAG	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040593
23	NC_009954	GT	3	6	1013	1018	0 %	50 %	50 %	0 %	159040593
24	NC_009954	GCT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040593
25	NC_009954	GTG	2	6	1087	1092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
26	NC_009954	GACA	2	8	1101	1108	50 %	0 %	25 %	25 %	159040593
27	NC_009954	TGG	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
28	NC_009954	ACCAT	2	10	1210	1219	40 %	20 %	0 %	40 %	159040593
29	NC_009954	TGGT	2	8	1244	1251	0 %	50 %	50 %	0 %	159040593
30	NC_009954	GCC	2	6	1257	1262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159040593
31	NC_009954	CTGCA	2	10	1305	1314	20 %	20 %	20 %	40 %	159040593
32	NC_009954	CATT	2	8	1316	1323	25 %	50 %	0 %	25 %	159040593
33	NC_009954	CT	3	6	1339	1344	0 %	50 %	0 %	50 %	159040593
34	NC_009954	GTA	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
35	NC_009954	ATA	2	6	1452	1457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040593
36	NC_009954	GT	3	6	1568	1573	0 %	50 %	50 %	0 %	159040593
37	NC_009954	ACTGT	2	10	1613	1622	20 %	40 %	20 %	20 %	159040593
38	NC_009954	CAC	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
39	NC_009954	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
40	NC_009954	ATA	2	6	1853	1858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040593
41	NC_009954	GTAC	2	8	1886	1893	25 %	25 %	25 %	25 %	159040593
42	NC_009954	CAC	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
43	NC_009954	TAT	2	6	1982	1987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
44	NC_009954	GAA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040593
45	NC_009954	TTG	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040593
46	NC_009954	GTG	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
47	NC_009954	TTG	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040593
48	NC_009954	GGT	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
49	NC_009954	ACC	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
50	NC_009954	AGT	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
51	NC_009954	CTT	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040593
52	NC_009954	TGGCT	2	10	2373	2382	0 %	40 %	40 %	20 %	159040593
53	NC_009954	CGC	2	6	2388	2393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159040593
54	NC_009954	TGAC	2	8	2403	2410	25 %	25 %	25 %	25 %	159040593
55	NC_009954	GTT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040593
56	NC_009954	CAC	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
57	NC_009954	TAG	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
58	NC_009954	CAACC	2	10	2759	2768	40 %	0 %	0 %	60 %	159040593
59	NC_009954	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
60	NC_009954	GT	3	6	3008	3013	0 %	50 %	50 %	0 %	159040593
61	NC_009954	GTA	2	6	3039	3044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
62	NC_009954	CAA	2	6	3071	3076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
63	NC_009954	ACATT	2	10	3080	3089	40 %	40 %	0 %	20 %	159040593
64	NC_009954	CT	3	6	3106	3111	0 %	50 %	0 %	50 %	159040593
65	NC_009954	TGG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
66	NC_009954	ACTGG	2	10	3200	3209	20 %	20 %	40 %	20 %	159040593
67	NC_009954	ATG	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
68	NC_009954	GTA	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
69	NC_009954	GCCA	2	8	3276	3283	25 %	0 %	25 %	50 %	159040593
70	NC_009954	TGG	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
71	NC_009954	CAC	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
72	NC_009954	ATG	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
73	NC_009954	TTG	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040593
74	NC_009954	AAT	2	6	3586	3591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040593
75	NC_009954	AGT	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
76	NC_009954	GAA	2	6	3720	3725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040593
77	NC_009954	AGC	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040593
78	NC_009954	CTA	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040593
79	NC_009954	AGT	2	6	3926	3931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
80	NC_009954	CAAC	2	8	3937	3944	50 %	0 %	0 %	50 %	159040593
81	NC_009954	TGTGGC	2	12	3951	3962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159040593
82	NC_009954	CCA	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
83	NC_009954	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
84	NC_009954	AAC	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
85	NC_009954	TAG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
86	NC_009954	CAA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
87	NC_009954	CGTTG	2	10	4332	4341	0 %	40 %	40 %	20 %	159040593
88	NC_009954	CAC	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
89	NC_009954	TGC	3	9	4379	4387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040593
90	NC_009954	AT	5	10	4398	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	159040593
91	NC_009954	CGC	2	6	4431	4436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159040593
92	NC_009954	GTT	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040593
93	NC_009954	TGG	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
94	NC_009954	TAG	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
95	NC_009954	GTAG	2	8	4742	4749	25 %	25 %	50 %	0 %	159040593
96	NC_009954	CCCT	2	8	4834	4841	0 %	25 %	0 %	75 %	159040593
97	NC_009954	TGC	2	6	4854	4859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040593
98	NC_009954	ATG	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
99	NC_009954	ATG	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
100	NC_009954	AAT	2	6	4972	4977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040593
101	NC_009954	GCT	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040593
102	NC_009954	AACTAT	2	12	5070	5081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159040593
103	NC_009954	ACC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
104	NC_009954	GCT	2	6	5130	5135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040593
105	NC_009954	CGG	3	9	5181	5189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159040593
106	NC_009954	TAT	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
107	NC_009954	TAACC	2	10	5265	5274	40 %	20 %	0 %	40 %	159040593
108	NC_009954	TGA	2	6	5286	5291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
109	NC_009954	ATG	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
110	NC_009954	GAA	2	6	5499	5504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040593
111	NC_009954	CGT	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040593
112	NC_009954	GTA	2	6	5587	5592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
113	NC_009954	ATT	2	6	5655	5660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
114	NC_009954	GTA	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
115	NC_009954	TCA	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040593
116	NC_009954	AGGT	2	8	5881	5888	25 %	25 %	50 %	0 %	159040593
117	NC_009954	CTC	2	6	5901	5906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040593
118	NC_009954	CATT	2	8	5981	5988	25 %	50 %	0 %	25 %	159040593
119	NC_009954	GTG	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
120	NC_009954	TCT	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040593
121	NC_009954	AACTG	2	10	6120	6129	40 %	20 %	20 %	20 %	159040593
122	NC_009954	GCC	2	6	6133	6138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159040593
123	NC_009954	ACA	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
124	NC_009954	TAC	2	6	6183	6188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040593
125	NC_009954	CAC	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
126	NC_009954	TCAA	2	8	6202	6209	50 %	25 %	0 %	25 %	159040593
127	NC_009954	GCCT	2	8	6265	6272	0 %	25 %	25 %	50 %	159040593
128	NC_009954	GGC	2	6	6289	6294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159040593
129	NC_009954	AGT	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
130	NC_009954	ACA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
131	NC_009954	ACA	2	6	6454	6459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
132	NC_009954	TA	3	6	6503	6508	50 %	50 %	0 %	0 %	159040593
133	NC_009954	CAG	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040593
134	NC_009954	GAA	2	6	6567	6572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040593
135	NC_009954	ATA	2	6	6633	6638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040593
136	NC_009954	TAT	2	6	6710	6715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
137	NC_009954	AACC	2	8	6737	6744	50 %	0 %	0 %	50 %	159040593
138	NC_009954	GTA	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
139	NC_009954	GTT	2	6	6790	6795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040593
140	NC_009954	GTA	2	6	6798	6803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
141	NC_009954	GCTGA	2	10	6844	6853	20 %	20 %	40 %	20 %	159040593
142	NC_009954	CAA	2	6	6884	6889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040593
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145	NC_009954	GTTAC	2	10	6985	6994	20 %	40 %	20 %	20 %	159040593
146	NC_009954	TGGA	2	8	7022	7029	25 %	25 %	50 %	0 %	159040593
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148	NC_009954	GT	3	6	7106	7111	0 %	50 %	50 %	0 %	159040593
149	NC_009954	GTA	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
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157	NC_009954	TTA	2	6	7517	7522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
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163	NC_009954	CAC	2	6	7661	7666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040593
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165	NC_009954	TGG	2	6	7709	7714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040593
166	NC_009954	GTA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040593
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173	NC_009954	ATT	2	6	8140	8145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040593
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246	NC_009954	ATT	2	6	12229	12234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040595
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255	NC_009954	AACC	2	8	12640	12647	50 %	0 %	0 %	50 %	159040595
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259	NC_009954	ACA	2	6	12937	12942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040595
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261	NC_009954	CTTA	2	8	13134	13141	25 %	50 %	0 %	25 %	159040595
262	NC_009954	TAT	2	6	13176	13181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040595
263	NC_009954	AAT	2	6	13257	13262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040595
264	NC_009954	CTACT	2	10	13325	13334	20 %	40 %	0 %	40 %	159040595
265	NC_009954	AAT	2	6	13348	13353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040595
266	NC_009954	TAT	2	6	13368	13373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040595
267	NC_009954	ACCAC	2	10	13384	13393	40 %	0 %	0 %	60 %	159040595
268	NC_009954	TGA	2	6	13479	13484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040595
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270	NC_009954	AC	3	6	13551	13556	50 %	0 %	0 %	50 %	159040595
271	NC_009954	ACTA	2	8	13623	13630	50 %	25 %	0 %	25 %	159040595
272	NC_009954	TAA	2	6	13724	13729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040595
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281	NC_009954	GTG	2	6	14048	14053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040595
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302	NC_009954	GAGTA	2	10	14698	14707	40 %	20 %	40 %	0 %	159040595
303	NC_009954	ACT	2	6	14838	14843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040595
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374	NC_009954	ATA	2	6	19175	19180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040598
375	NC_009954	GCA	2	6	19203	19208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040598
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380	NC_009954	TAAT	2	8	19496	19503	50 %	50 %	0 %	0 %	159040599
381	NC_009954	ACT	2	6	19505	19510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040599
382	NC_009954	CTC	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040599
383	NC_009954	CCTTAC	2	12	19549	19560	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	159040599
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386	NC_009954	TCA	2	6	19998	20003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040599
387	NC_009954	TTGGG	2	10	20047	20056	0 %	40 %	60 %	0 %	159040599
388	NC_009954	TCT	2	6	20077	20082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040599
389	NC_009954	TCCTC	2	10	20095	20104	0 %	40 %	0 %	60 %	159040599
390	NC_009954	TGG	2	6	20152	20157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040599
391	NC_009954	CTC	2	6	20199	20204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040599
392	NC_009954	CCT	2	6	20210	20215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040599
393	NC_009954	ATA	2	6	20223	20228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040599
394	NC_009954	TCA	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040599
395	NC_009954	TAA	2	6	20278	20283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040599
396	NC_009954	CCT	3	9	20338	20346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040599
397	NC_009954	CTG	2	6	20363	20368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040599
398	NC_009954	TGA	2	6	20372	20377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040599
399	NC_009954	TCTCAA	2	12	20407	20418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040599
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499	NC_009954	CCT	2	6	24869	24874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040604
500	NC_009954	CTC	2	6	24965	24970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040604

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