MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON16

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009796	TC	3	6	411	416	0 %	50 %	0 %	50 %	157149616
2	NC_009796	T	7	7	428	434	0 %	100 %	0 %	0 %	157149616
3	NC_009796	TAC	2	6	444	449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149616
4	NC_009796	AAATTT	2	12	655	666	50 %	50 %	0 %	0 %	157149616
5	NC_009796	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149616
6	NC_009796	AT	3	6	766	771	50 %	50 %	0 %	0 %	157149616
7	NC_009796	AGA	2	6	822	827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149616
8	NC_009796	A	6	6	852	857	100 %	0 %	0 %	0 %	157149616
9	NC_009796	AAAT	2	8	911	918	75 %	25 %	0 %	0 %	157149616
10	NC_009796	AT	3	6	946	951	50 %	50 %	0 %	0 %	157149616
11	NC_009796	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	157149616
12	NC_009796	A	7	7	969	975	100 %	0 %	0 %	0 %	157149616
13	NC_009796	TGG	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149616
14	NC_009796	AG	3	6	1072	1077	50 %	0 %	50 %	0 %	157149616
15	NC_009796	TGA	2	6	1124	1129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149616
16	NC_009796	TCTA	2	8	1152	1159	25 %	50 %	0 %	25 %	157149616
17	NC_009796	T	6	6	1190	1195	0 %	100 %	0 %	0 %	157149616
18	NC_009796	A	6	6	1307	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	157149616
19	NC_009796	ACA	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149634
20	NC_009796	CTA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149634
21	NC_009796	GTA	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149634
22	NC_009796	GGT	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149634
23	NC_009796	AGG	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149634
24	NC_009796	AGA	2	6	1582	1587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149634
25	NC_009796	TA	3	6	1627	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	157149634
26	NC_009796	AG	3	6	1636	1641	50 %	0 %	50 %	0 %	157149634
27	NC_009796	TGT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149634
28	NC_009796	TAT	2	6	1726	1731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149634
29	NC_009796	AACC	2	8	1753	1760	50 %	0 %	0 %	50 %	157149634
30	NC_009796	GAT	2	6	1801	1806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149634
31	NC_009796	A	7	7	1810	1816	100 %	0 %	0 %	0 %	157149634
32	NC_009796	CT	3	6	2039	2044	0 %	50 %	0 %	50 %	157149633
33	NC_009796	TTA	2	6	2335	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149633
34	NC_009796	A	7	7	2409	2415	100 %	0 %	0 %	0 %	157149633
35	NC_009796	AAC	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149633
36	NC_009796	TAA	2	6	2542	2547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149633
37	NC_009796	TC	3	6	2596	2601	0 %	50 %	0 %	50 %	157149633
38	NC_009796	TGA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149633
39	NC_009796	TAG	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149633
40	NC_009796	A	6	6	2735	2740	100 %	0 %	0 %	0 %	157149633
41	NC_009796	CAA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149633
42	NC_009796	CGA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149633
43	NC_009796	TTA	2	6	2861	2866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149633
44	NC_009796	TGA	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149633
45	NC_009796	AAGA	2	8	2886	2893	75 %	0 %	25 %	0 %	157149633
46	NC_009796	CTAG	2	8	2907	2914	25 %	25 %	25 %	25 %	157149633
47	NC_009796	A	6	6	2943	2948	100 %	0 %	0 %	0 %	157149633
48	NC_009796	AGCA	2	8	2969	2976	50 %	0 %	25 %	25 %	157149633
49	NC_009796	TGA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149633
50	NC_009796	CGC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149615
51	NC_009796	TTAGTT	2	12	3183	3194	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157149615
52	NC_009796	ATG	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149615
53	NC_009796	GTG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149615
54	NC_009796	TATG	2	8	3301	3308	25 %	50 %	25 %	0 %	157149615
55	NC_009796	GGA	2	6	3314	3319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149615
56	NC_009796	GTA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149615
57	NC_009796	AGC	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149615
58	NC_009796	TCT	2	6	3473	3478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149615
59	NC_009796	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149615
60	NC_009796	GCT	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149615
61	NC_009796	TTGC	2	8	3525	3532	0 %	50 %	25 %	25 %	157149615
62	NC_009796	T	6	6	3595	3600	0 %	100 %	0 %	0 %	157149615
63	NC_009796	TC	3	6	3622	3627	0 %	50 %	0 %	50 %	157149615
64	NC_009796	ATA	2	6	3687	3692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149615
65	NC_009796	AAT	2	6	3693	3698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149615
66	NC_009796	A	7	7	3787	3793	100 %	0 %	0 %	0 %	157149631
67	NC_009796	GGC	2	6	3796	3801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149631
68	NC_009796	T	6	6	3867	3872	0 %	100 %	0 %	0 %	157149631
69	NC_009796	GATC	2	8	3920	3927	25 %	25 %	25 %	25 %	157149631
70	NC_009796	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	157149631
71	NC_009796	A	6	6	3958	3963	100 %	0 %	0 %	0 %	157149631
72	NC_009796	AATA	2	8	3966	3973	75 %	25 %	0 %	0 %	157149631
73	NC_009796	TAAAA	2	10	3977	3986	80 %	20 %	0 %	0 %	157149631
74	NC_009796	CTAG	2	8	4034	4041	25 %	25 %	25 %	25 %	157149619
75	NC_009796	GTG	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149619
76	NC_009796	ATA	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149619
77	NC_009796	TGG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149619
78	NC_009796	ACA	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149619
79	NC_009796	GTT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149619
80	NC_009796	TGG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149619
81	NC_009796	AAG	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149619
82	NC_009796	ATG	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149619
83	NC_009796	CAA	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149619
84	NC_009796	AACA	2	8	4486	4493	75 %	0 %	0 %	25 %	157149619
85	NC_009796	AT	3	6	4498	4503	50 %	50 %	0 %	0 %	157149619
86	NC_009796	TAA	2	6	4515	4520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149619
87	NC_009796	AACT	2	8	4542	4549	50 %	25 %	0 %	25 %	157149619
88	NC_009796	AAC	3	9	4636	4644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
89	NC_009796	AAGC	2	8	4681	4688	50 %	0 %	25 %	25 %	157149630
90	NC_009796	CCA	2	6	4706	4711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149630
91	NC_009796	TAA	2	6	4776	4781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149630
92	NC_009796	AAT	2	6	4906	4911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149630
93	NC_009796	TC	3	6	4923	4928	0 %	50 %	0 %	50 %	157149630
94	NC_009796	AGT	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
95	NC_009796	AC	3	6	4946	4951	50 %	0 %	0 %	50 %	157149630
96	NC_009796	TAGCTT	2	12	4965	4976	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157149630
97	NC_009796	CGGCTG	2	12	5069	5080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157149630
98	NC_009796	GAT	2	6	5109	5114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
99	NC_009796	AGG	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149630
100	NC_009796	CAA	2	6	5174	5179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
101	NC_009796	AAC	3	9	5191	5199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
102	NC_009796	GGC	2	6	5203	5208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149630
103	NC_009796	GTG	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149630
104	NC_009796	GA	3	6	5249	5254	50 %	0 %	50 %	0 %	157149630
105	NC_009796	TAA	2	6	5262	5267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149630
106	NC_009796	AGC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149630
107	NC_009796	ACA	2	6	5312	5317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
108	NC_009796	AG	3	6	5329	5334	50 %	0 %	50 %	0 %	157149630
109	NC_009796	ACA	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149630
110	NC_009796	ATAG	2	8	5380	5387	50 %	25 %	25 %	0 %	157149630
111	NC_009796	AT	3	6	5493	5498	50 %	50 %	0 %	0 %	157149630
112	NC_009796	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149630
113	NC_009796	GAT	2	6	5616	5621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
114	NC_009796	TAG	2	6	5774	5779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
115	NC_009796	GTA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149630
116	NC_009796	TAT	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149627
117	NC_009796	TAGCAA	2	12	6088	6099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157149627
118	NC_009796	ATA	2	6	6132	6137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149627
119	NC_009796	CAA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149627
120	NC_009796	AAAC	2	8	6168	6175	75 %	0 %	0 %	25 %	157149627
121	NC_009796	TAA	2	6	6194	6199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149627
122	NC_009796	ATA	2	6	6259	6264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149627
123	NC_009796	AATA	2	8	6270	6277	75 %	25 %	0 %	0 %	157149627
124	NC_009796	TG	3	6	6282	6287	0 %	50 %	50 %	0 %	157149635
125	NC_009796	A	8	8	6361	6368	100 %	0 %	0 %	0 %	157149635
126	NC_009796	ATG	2	6	6375	6380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149635
127	NC_009796	TAA	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149635
128	NC_009796	ATG	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149635
129	NC_009796	A	8	8	6512	6519	100 %	0 %	0 %	0 %	157149635
130	NC_009796	ATTG	2	8	6526	6533	25 %	50 %	25 %	0 %	157149635
131	NC_009796	ATT	2	6	6552	6557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149635
132	NC_009796	TGTT	2	8	6565	6572	0 %	75 %	25 %	0 %	157149635
133	NC_009796	A	6	6	6581	6586	100 %	0 %	0 %	0 %	157149635
134	NC_009796	AAAT	2	8	6600	6607	75 %	25 %	0 %	0 %	157149635
135	NC_009796	GAT	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149635
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137	NC_009796	AAT	2	6	6719	6724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149635
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.