MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 38734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009727	AATT	2	8	140425	140432	50 %	50 %	0 %	0 %	154707534
2502	NC_009727	TTA	2	6	140520	140525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707534
2503	NC_009727	TAT	2	6	140566	140571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706035
2504	NC_009727	CCAAAG	2	12	140608	140619	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	154706035
2505	NC_009727	GCC	2	6	140772	140777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706035
2506	NC_009727	AGC	2	6	140778	140783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706035
2507	NC_009727	GCT	2	6	141074	141079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706035
2508	NC_009727	AC	3	6	141200	141205	50 %	0 %	0 %	50 %	154706035
2509	NC_009727	CGC	2	6	141251	141256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706035
2510	NC_009727	C	6	6	141358	141363	0 %	0 %	0 %	100 %	154706035
2511	NC_009727	CCA	2	6	141416	141421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706035
2512	NC_009727	AACT	2	8	141465	141472	50 %	25 %	0 %	25 %	154706035
2513	NC_009727	ACC	2	6	141492	141497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706035
2514	NC_009727	AAT	2	6	141510	141515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706035
2515	NC_009727	CGT	2	6	141522	141527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706035
2516	NC_009727	TGTGAT	2	12	141536	141547	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154706035
2517	NC_009727	CAG	2	6	141593	141598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706035
2518	NC_009727	CAT	2	6	141612	141617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706035
2519	NC_009727	GCT	2	6	141618	141623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706035
2520	NC_009727	TTC	2	6	141642	141647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706035
2521	NC_009727	GAG	2	6	141683	141688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706035
2522	NC_009727	A	6	6	141706	141711	100 %	0 %	0 %	0 %	154706035
2523	NC_009727	TTG	2	6	141717	141722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706035
2524	NC_009727	TGG	2	6	141733	141738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706035
2525	NC_009727	ATG	2	6	141805	141810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706035
2526	NC_009727	GAT	2	6	141833	141838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706035
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2529	NC_009727	T	6	6	141946	141951	0 %	100 %	0 %	0 %	154707430
2530	NC_009727	TAAA	2	8	142015	142022	75 %	25 %	0 %	0 %	154707430
2531	NC_009727	TCA	2	6	142033	142038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707430
2532	NC_009727	A	7	7	142162	142168	100 %	0 %	0 %	0 %	154707430
2533	NC_009727	AGG	2	6	142244	142249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154707430
2534	NC_009727	TCC	2	6	142332	142337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154706183
2535	NC_009727	GTC	2	6	142391	142396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706183
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2538	NC_009727	TGT	2	6	142552	142557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706183
2539	NC_009727	A	7	7	142574	142580	100 %	0 %	0 %	0 %	154706183
2540	NC_009727	CTT	2	6	142585	142590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706183
2541	NC_009727	AT	3	6	142635	142640	50 %	50 %	0 %	0 %	154706183
2542	NC_009727	AAT	2	6	142647	142652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706183
2543	NC_009727	ATC	2	6	142724	142729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706183
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2545	NC_009727	GCAG	2	8	142818	142825	25 %	0 %	50 %	25 %	154706183
2546	NC_009727	G	6	6	142841	142846	0 %	0 %	100 %	0 %	154706183
2547	NC_009727	TCT	2	6	142887	142892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706183
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2549	NC_009727	TATTT	2	10	142926	142935	20 %	80 %	0 %	0 %	154706183
2550	NC_009727	CGA	2	6	143163	143168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706642
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2552	NC_009727	TGC	2	6	143236	143241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706642
2553	NC_009727	GCA	2	6	143306	143311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706642
2554	NC_009727	CAT	2	6	143320	143325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706642
2555	NC_009727	AATAA	2	10	143344	143353	80 %	20 %	0 %	0 %	154706642
2556	NC_009727	ATAA	2	8	143385	143392	75 %	25 %	0 %	0 %	154706642
2557	NC_009727	GTT	2	6	143408	143413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706642
2558	NC_009727	TGC	2	6	143426	143431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706642
2559	NC_009727	TTG	2	6	143443	143448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706642
2560	NC_009727	GCCC	2	8	143457	143464	0 %	0 %	25 %	75 %	154706642
2561	NC_009727	CAC	2	6	143476	143481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706642
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2564	NC_009727	AAT	2	6	143685	143690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706642
2565	NC_009727	AGA	2	6	143707	143712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706642
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2570	NC_009727	CTG	2	6	143908	143913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706642
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2572	NC_009727	CATT	2	8	144008	144015	25 %	50 %	0 %	25 %	154706642
2573	NC_009727	AAT	2	6	144055	144060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706642
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2587	NC_009727	CAT	2	6	144669	144674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707126
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2589	NC_009727	GTC	2	6	144834	144839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154707126
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2597	NC_009727	AACG	2	8	145531	145538	50 %	0 %	25 %	25 %	154707126
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2601	NC_009727	TTTG	2	8	145682	145689	0 %	75 %	25 %	0 %	154707126
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2605	NC_009727	GAT	2	6	145786	145791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707126
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2608	NC_009727	CCATC	2	10	145871	145880	20 %	20 %	0 %	60 %	154707126
2609	NC_009727	ATTG	2	8	145885	145892	25 %	50 %	25 %	0 %	154707126
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