MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 19397 chromosome

Total Repeats: 87591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009697	AATA	2	8	36	43	75 %	25 %	0 %	0 %	153930843
2	NC_009697	AAGT	2	8	65	72	50 %	25 %	25 %	0 %	153930843
3	NC_009697	AAT	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930843
4	NC_009697	TTAC	2	8	205	212	25 %	50 %	0 %	25 %	153930843
5	NC_009697	A	7	7	216	222	100 %	0 %	0 %	0 %	153930843
6	NC_009697	ACT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930843
7	NC_009697	GAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930843
8	NC_009697	A	6	6	254	259	100 %	0 %	0 %	0 %	153930843
9	NC_009697	AGA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930843
10	NC_009697	A	7	7	272	278	100 %	0 %	0 %	0 %	153930843
11	NC_009697	ATA	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930843
12	NC_009697	ATG	2	6	311	316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930843
13	NC_009697	CTA	2	6	323	328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930843
14	NC_009697	GCA	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930843
15	NC_009697	TAGCAG	2	12	401	412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153930843
16	NC_009697	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	153930843
17	NC_009697	TA	3	6	444	449	50 %	50 %	0 %	0 %	153930843
18	NC_009697	TGG	2	6	450	455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930843
19	NC_009697	ATGC	2	8	481	488	25 %	25 %	25 %	25 %	153930843
20	NC_009697	TA	3	6	499	504	50 %	50 %	0 %	0 %	153930843
21	NC_009697	AGT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930843
22	NC_009697	TCT	2	6	541	546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930843
23	NC_009697	AATT	3	12	563	574	50 %	50 %	0 %	0 %	153930843
24	NC_009697	GAT	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930843
25	NC_009697	AAAT	2	8	606	613	75 %	25 %	0 %	0 %	153930843
26	NC_009697	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930843
27	NC_009697	AGAA	2	8	666	673	75 %	0 %	25 %	0 %	153930843
28	NC_009697	AACA	2	8	718	725	75 %	0 %	0 %	25 %	153930843
29	NC_009697	AAT	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930843
30	NC_009697	AGA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930843
31	NC_009697	A	6	6	859	864	100 %	0 %	0 %	0 %	153930843
32	NC_009697	TA	4	8	905	912	50 %	50 %	0 %	0 %	153930843
33	NC_009697	TAA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930843
34	NC_009697	TAG	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930843
35	NC_009697	TCA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930843
36	NC_009697	TAA	2	6	987	992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930843
37	NC_009697	ATT	2	6	1072	1077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930843
38	NC_009697	AAG	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930843
39	NC_009697	TAT	2	6	1096	1101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930843
40	NC_009697	AGA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930843
41	NC_009697	AGA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930843
42	NC_009697	GAA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930843
43	NC_009697	TAC	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930843
44	NC_009697	TAA	2	6	1275	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930843
45	NC_009697	A	7	7	1284	1290	100 %	0 %	0 %	0 %	153930843
46	NC_009697	TAAA	2	8	1322	1329	75 %	25 %	0 %	0 %	153930843
47	NC_009697	AAAAAT	2	12	1340	1351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153930843
48	NC_009697	A	7	7	1626	1632	100 %	0 %	0 %	0 %	153931816
49	NC_009697	TAT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153931816
50	NC_009697	TTA	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153931816
51	NC_009697	TAA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931816
52	NC_009697	AGA	2	6	1795	1800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153931816
53	NC_009697	ATA	2	6	1838	1843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931816
54	NC_009697	AAAT	2	8	1869	1876	75 %	25 %	0 %	0 %	153931816
55	NC_009697	AGA	2	6	1882	1887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153931816
56	NC_009697	ATA	2	6	1901	1906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931816
57	NC_009697	AT	4	8	1931	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	153931816
58	NC_009697	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153931816
59	NC_009697	A	6	6	2011	2016	100 %	0 %	0 %	0 %	153931816
60	NC_009697	TAG	2	6	2112	2117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153931816
61	NC_009697	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153931816
62	NC_009697	GTT	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153931816
63	NC_009697	GATAAT	2	12	2159	2170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153931816
64	NC_009697	AGA	3	9	2224	2232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153931816
65	NC_009697	TTTA	2	8	2272	2279	25 %	75 %	0 %	0 %	153931816
66	NC_009697	AAT	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931816
67	NC_009697	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153931816
68	NC_009697	TTA	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153931816
69	NC_009697	GAA	2	6	2351	2356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153931816
70	NC_009697	ATA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931816
71	NC_009697	CT	3	6	2413	2418	0 %	50 %	0 %	50 %	153931816
72	NC_009697	AAG	2	6	2427	2432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153931816
73	NC_009697	GAT	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153931816
74	NC_009697	TAA	2	6	2478	2483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931816
75	NC_009697	GAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153931816
76	NC_009697	AGT	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153931816
77	NC_009697	TAT	2	6	2644	2649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153931816
78	NC_009697	A	6	6	2650	2655	100 %	0 %	0 %	0 %	153931816
79	NC_009697	AAT	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153931816
80	NC_009697	AATT	2	8	2746	2753	50 %	50 %	0 %	0 %	153932828
81	NC_009697	ATA	2	6	2759	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153932828
82	NC_009697	TTCT	2	8	2773	2780	0 %	75 %	0 %	25 %	153932828
83	NC_009697	CAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153932828
84	NC_009697	T	6	6	2822	2827	0 %	100 %	0 %	0 %	153932828
85	NC_009697	AAGTTA	2	12	2841	2852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153932828
86	NC_009697	A	6	6	2865	2870	100 %	0 %	0 %	0 %	153932828
87	NC_009697	GAC	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153932828
88	NC_009697	TAA	2	6	2911	2916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153932828
89	NC_009697	ATT	2	6	2930	2935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153932828
90	NC_009697	TA	3	6	3010	3015	50 %	50 %	0 %	0 %	153933867
91	NC_009697	A	6	6	3015	3020	100 %	0 %	0 %	0 %	153933867
92	NC_009697	TAA	2	6	3029	3034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
93	NC_009697	ATG	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153933867
94	NC_009697	CAAATA	2	12	3074	3085	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153933867
95	NC_009697	TAA	2	6	3096	3101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
96	NC_009697	TA	3	6	3132	3137	50 %	50 %	0 %	0 %	153933867
97	NC_009697	ATAAAG	2	12	3170	3181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153933867
98	NC_009697	ATA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
99	NC_009697	AT	3	6	3263	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	153933867
100	NC_009697	A	6	6	3280	3285	100 %	0 %	0 %	0 %	153933867
101	NC_009697	AATAA	2	10	3298	3307	80 %	20 %	0 %	0 %	153933867
102	NC_009697	A	8	8	3312	3319	100 %	0 %	0 %	0 %	153933867
103	NC_009697	TGT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153933867
104	NC_009697	AGA	2	6	3363	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153933867
105	NC_009697	AAT	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
106	NC_009697	TAT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153933867
107	NC_009697	ATA	2	6	3467	3472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
108	NC_009697	GAAA	2	8	3484	3491	75 %	0 %	25 %	0 %	153933867
109	NC_009697	A	6	6	3501	3506	100 %	0 %	0 %	0 %	153933867
110	NC_009697	ATG	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153933867
111	NC_009697	AG	3	6	3582	3587	50 %	0 %	50 %	0 %	153933867
112	NC_009697	TAAAT	2	10	3603	3612	60 %	40 %	0 %	0 %	153933867
113	NC_009697	ATT	2	6	3613	3618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153933867
114	NC_009697	AAG	2	6	3634	3639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153933867
115	NC_009697	AGA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153933867
116	NC_009697	ATT	2	6	3714	3719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153933867
117	NC_009697	A	7	7	3741	3747	100 %	0 %	0 %	0 %	153933867
118	NC_009697	GA	3	6	3754	3759	50 %	0 %	50 %	0 %	153933867
119	NC_009697	GAT	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153933867
120	NC_009697	AAGT	2	8	3797	3804	50 %	25 %	25 %	0 %	153933867
121	NC_009697	ATAA	2	8	3805	3812	75 %	25 %	0 %	0 %	153933867
122	NC_009697	ACA	2	6	3843	3848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153933867
123	NC_009697	CAT	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153933867
124	NC_009697	ATA	2	6	3889	3894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
125	NC_009697	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	153933867
126	NC_009697	ATA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
127	NC_009697	GAT	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153933867
128	NC_009697	TAA	2	6	4004	4009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
129	NC_009697	AGA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153933867
130	NC_009697	TAA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153933867
131	NC_009697	TAAAA	2	10	4083	4092	80 %	20 %	0 %	0 %	153933867
132	NC_009697	TTC	2	6	4126	4131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153931135
133	NC_009697	GTA	3	9	4146	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153931135
134	NC_009697	GGAT	2	8	4241	4248	25 %	25 %	50 %	0 %	153931135
135	NC_009697	TTG	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153931135
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137	NC_009697	ATG	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153931278
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