MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 plasmid pBOT3502

Total Repeats: 376

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009496	AT	5	10	123	132	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
2	NC_009496	T	6	6	193	198	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
3	NC_009496	AT	3	6	215	220	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
4	NC_009496	T	6	6	255	260	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
5	NC_009496	TCT	2	6	284	289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
6	NC_009496	AAT	2	6	382	387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
7	NC_009496	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	148381587
8	NC_009496	ATA	2	6	419	424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
9	NC_009496	TAT	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
10	NC_009496	TTA	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
11	NC_009496	TCC	2	6	466	471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148381587
12	NC_009496	AAC	2	6	475	480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148381587
13	NC_009496	CAT	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
14	NC_009496	TTA	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
15	NC_009496	ATC	2	6	544	549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
16	NC_009496	T	6	6	579	584	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
17	NC_009496	TA	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
18	NC_009496	T	6	6	688	693	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
19	NC_009496	TAT	2	6	721	726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
20	NC_009496	TAT	2	6	744	749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
21	NC_009496	AAG	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381587
22	NC_009496	GTT	2	6	911	916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148381587
23	NC_009496	T	6	6	965	970	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
24	NC_009496	AAT	2	6	982	987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
25	NC_009496	T	6	6	1010	1015	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
26	NC_009496	TA	3	6	1123	1128	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
27	NC_009496	AT	3	6	1178	1183	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
28	NC_009496	ATA	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
29	NC_009496	TTA	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
30	NC_009496	AGG	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148381587
31	NC_009496	CAT	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
32	NC_009496	T	6	6	1308	1313	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
33	NC_009496	ATAA	2	8	1375	1382	75 %	25 %	0 %	0 %	148381587
34	NC_009496	TTCT	2	8	1385	1392	0 %	75 %	0 %	25 %	148381587
35	NC_009496	T	6	6	1414	1419	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
36	NC_009496	CTT	2	6	1433	1438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
37	NC_009496	TAAAC	2	10	1505	1514	60 %	20 %	0 %	20 %	148381587
38	NC_009496	T	8	8	1577	1584	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
39	NC_009496	TA	3	6	1591	1596	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
40	NC_009496	TA	3	6	1626	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
41	NC_009496	AAG	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381587
42	NC_009496	ATC	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
43	NC_009496	TA	3	6	1749	1754	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
44	NC_009496	CTT	2	6	1755	1760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
45	NC_009496	TATCA	2	10	1813	1822	40 %	40 %	0 %	20 %	148381587
46	NC_009496	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	148381587
47	NC_009496	T	7	7	1931	1937	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
48	NC_009496	TGA	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381587
49	NC_009496	TAA	2	6	1974	1979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
50	NC_009496	GCA	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148381587
51	NC_009496	GAA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381587
52	NC_009496	AATT	2	8	2038	2045	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
53	NC_009496	ATT	2	6	2059	2064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
54	NC_009496	ATT	3	9	2117	2125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
55	NC_009496	AGT	2	6	2175	2180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381587
56	NC_009496	TTA	2	6	2235	2240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
57	NC_009496	TTTCC	2	10	2253	2262	0 %	60 %	0 %	40 %	148381587
58	NC_009496	CTA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
59	NC_009496	TC	3	6	2289	2294	0 %	50 %	0 %	50 %	148381587
60	NC_009496	CTT	2	6	2297	2302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
61	NC_009496	CTAT	2	8	2318	2325	25 %	50 %	0 %	25 %	148381587
62	NC_009496	T	7	7	2463	2469	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
63	NC_009496	TCTA	2	8	2557	2564	25 %	50 %	0 %	25 %	148381587
64	NC_009496	TA	3	6	2563	2568	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
65	NC_009496	CTT	2	6	2577	2582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
66	NC_009496	TAT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
67	NC_009496	T	6	6	2683	2688	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
68	NC_009496	AT	3	6	2690	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
69	NC_009496	GTA	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381587
70	NC_009496	T	6	6	2792	2797	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
71	NC_009496	TTTA	2	8	2887	2894	25 %	75 %	0 %	0 %	148381587
72	NC_009496	ATA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
73	NC_009496	TA	3	6	2953	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
74	NC_009496	CAT	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
75	NC_009496	CTAG	2	8	2999	3006	25 %	25 %	25 %	25 %	148381587
76	NC_009496	TC	3	6	3031	3036	0 %	50 %	0 %	50 %	148381587
77	NC_009496	AAT	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
78	NC_009496	AAGC	2	8	3164	3171	50 %	0 %	25 %	25 %	148381587
79	NC_009496	TAA	2	6	3233	3238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
80	NC_009496	TTAA	2	8	3269	3276	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
81	NC_009496	AAG	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381587
82	NC_009496	TTA	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
83	NC_009496	CATA	2	8	3441	3448	50 %	25 %	0 %	25 %	148381587
84	NC_009496	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
85	NC_009496	ATT	2	6	3508	3513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
86	NC_009496	ATGAAG	2	12	3550	3561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148381587
87	NC_009496	T	8	8	3767	3774	0 %	100 %	0 %	0 %	148381588
88	NC_009496	AAG	2	6	3902	3907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381588
89	NC_009496	ATC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381588
90	NC_009496	ATA	2	6	3940	3945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381588
91	NC_009496	ATT	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381588
92	NC_009496	A	6	6	4437	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	148381589
93	NC_009496	ATAA	2	8	4449	4456	75 %	25 %	0 %	0 %	148381589
94	NC_009496	ACA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148381589
95	NC_009496	TA	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	148381589
96	NC_009496	AAG	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381590
97	NC_009496	TAAA	2	8	4835	4842	75 %	25 %	0 %	0 %	148381590
98	NC_009496	GAAT	2	8	4848	4855	50 %	25 %	25 %	0 %	148381590
99	NC_009496	AATA	2	8	4899	4906	75 %	25 %	0 %	0 %	148381590
100	NC_009496	AT	3	6	4925	4930	50 %	50 %	0 %	0 %	148381590
101	NC_009496	TAA	2	6	5012	5017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381590
102	NC_009496	AG	3	6	5029	5034	50 %	0 %	50 %	0 %	148381590
103	NC_009496	TA	3	6	5047	5052	50 %	50 %	0 %	0 %	148381590
104	NC_009496	ATA	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381590
105	NC_009496	AC	4	8	5179	5186	50 %	0 %	0 %	50 %	148381590
106	NC_009496	AT	3	6	5249	5254	50 %	50 %	0 %	0 %	148381590
107	NC_009496	ATG	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381590
108	NC_009496	ATA	2	6	5315	5320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381590
109	NC_009496	TTTA	2	8	5333	5340	25 %	75 %	0 %	0 %	148381590
110	NC_009496	TATG	2	8	5463	5470	25 %	50 %	25 %	0 %	148381591
111	NC_009496	ATA	2	6	5471	5476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
112	NC_009496	TAT	2	6	5494	5499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381591
113	NC_009496	TGA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381591
114	NC_009496	TA	3	6	5560	5565	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
115	NC_009496	AGAT	2	8	5640	5647	50 %	25 %	25 %	0 %	148381591
116	NC_009496	AT	3	6	5661	5666	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
117	NC_009496	TAA	2	6	5670	5675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
118	NC_009496	A	6	6	5674	5679	100 %	0 %	0 %	0 %	148381591
119	NC_009496	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
120	NC_009496	ATA	2	6	5720	5725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
121	NC_009496	TAT	2	6	5732	5737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381591
122	NC_009496	GTAA	2	8	5800	5807	50 %	25 %	25 %	0 %	148381591
123	NC_009496	TAA	2	6	5835	5840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
124	NC_009496	A	7	7	5844	5850	100 %	0 %	0 %	0 %	148381591
125	NC_009496	ATAA	2	8	5866	5873	75 %	25 %	0 %	0 %	148381591
126	NC_009496	ATA	2	6	5881	5886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
127	NC_009496	ATA	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
128	NC_009496	ATAA	2	8	5947	5954	75 %	25 %	0 %	0 %	148381591
129	NC_009496	AAC	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148381591
130	NC_009496	TA	3	6	6002	6007	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
131	NC_009496	TA	4	8	6012	6019	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
132	NC_009496	ATTT	2	8	6020	6027	25 %	75 %	0 %	0 %	148381591
133	NC_009496	TG	3	6	6035	6040	0 %	50 %	50 %	0 %	148381591
134	NC_009496	A	7	7	6057	6063	100 %	0 %	0 %	0 %	148381591
135	NC_009496	TA	3	6	6097	6102	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
136	NC_009496	A	6	6	6109	6114	100 %	0 %	0 %	0 %	148381591
137	NC_009496	TAATT	2	10	6115	6124	40 %	60 %	0 %	0 %	148381591
138	NC_009496	TTG	2	6	6306	6311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148381592
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140	NC_009496	T	7	7	6347	6353	0 %	100 %	0 %	0 %	148381592
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.