MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 1230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009479	ACC	2	6	19	24	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271111
2	NC_009479	TCA	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
3	NC_009479	GAG	2	6	73	78	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271111
4	NC_009479	CGC	2	6	160	165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
5	NC_009479	CGC	2	6	213	218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
6	NC_009479	CAT	2	6	252	257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
7	NC_009479	CGA	2	6	264	269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
8	NC_009479	CCG	2	6	275	280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
9	NC_009479	GCA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
10	NC_009479	TCG	2	6	299	304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271111
11	NC_009479	AGC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
12	NC_009479	GCG	3	9	382	390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271111
13	NC_009479	ACC	2	6	430	435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271111
14	NC_009479	GCC	2	6	502	507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
15	NC_009479	TCG	2	6	512	517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271111
16	NC_009479	CGA	4	12	522	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
17	NC_009479	TCA	2	6	551	556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
18	NC_009479	GC	3	6	600	605	0 %	0 %	50 %	50 %	148271111
19	NC_009479	CGA	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
20	NC_009479	GC	3	6	615	620	0 %	0 %	50 %	50 %	148271111
21	NC_009479	CCG	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
22	NC_009479	GGC	2	6	639	644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271111
23	NC_009479	TCG	2	6	677	682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271111
24	NC_009479	CCG	2	6	734	739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
25	NC_009479	GAG	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271111
26	NC_009479	ACT	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
27	NC_009479	CTA	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
28	NC_009479	CCG	2	6	867	872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
29	NC_009479	CGA	2	6	909	914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
30	NC_009479	CAA	3	9	957	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271111
31	NC_009479	CCG	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
32	NC_009479	GAA	2	6	1035	1040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271111
33	NC_009479	CAC	2	6	1068	1073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271111
34	NC_009479	AGG	2	6	1103	1108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271111
35	NC_009479	TTC	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271111
36	NC_009479	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
37	NC_009479	CGC	2	6	1182	1187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
38	NC_009479	GCA	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
39	NC_009479	CGG	2	6	1233	1238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271111
40	NC_009479	GCCCG	2	10	1276	1285	0 %	0 %	40 %	60 %	148271111
41	NC_009479	CGC	2	6	1311	1316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
42	NC_009479	AGC	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
43	NC_009479	CGA	2	6	1362	1367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
44	NC_009479	CGCGC	2	10	1370	1379	0 %	0 %	40 %	60 %	148271111
45	NC_009479	GAC	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
46	NC_009479	ACGGAC	2	12	1429	1440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
47	NC_009479	GCC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
48	NC_009479	CCG	2	6	1499	1504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
49	NC_009479	GAA	2	6	1791	1796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271112
50	NC_009479	CG	3	6	1819	1824	0 %	0 %	50 %	50 %	148271112
51	NC_009479	ACG	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271112
52	NC_009479	CGC	2	6	1841	1846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271112
53	NC_009479	CAC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271112
54	NC_009479	CTC	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271112
55	NC_009479	CGTC	2	8	1988	1995	0 %	25 %	25 %	50 %	148271112
56	NC_009479	CGA	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271112
57	NC_009479	CCG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
58	NC_009479	CAAGAC	3	18	2447	2464	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148271113
59	NC_009479	CCA	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271113
60	NC_009479	CTG	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
61	NC_009479	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271113
62	NC_009479	GCA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271113
63	NC_009479	GCC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
64	NC_009479	AGA	3	9	2734	2742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271113
65	NC_009479	GAG	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271113
66	NC_009479	GAG	2	6	2766	2771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271113
67	NC_009479	GGA	2	6	2846	2851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271113
68	NC_009479	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271113
69	NC_009479	CGT	3	9	2999	3007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
70	NC_009479	GTC	2	6	3066	3071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
71	NC_009479	CGA	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271113
72	NC_009479	CGT	2	6	3149	3154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
73	NC_009479	GTC	2	6	3231	3236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
74	NC_009479	CCG	2	6	3244	3249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
75	NC_009479	CGC	3	9	3260	3268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
76	NC_009479	CGC	2	6	3278	3283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
77	NC_009479	GAC	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271113
78	NC_009479	ACG	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271113
79	NC_009479	ACC	2	6	3853	3858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271114
80	NC_009479	CGA	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271114
81	NC_009479	CGT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271114
82	NC_009479	TCT	2	6	3939	3944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271114
83	NC_009479	CGC	2	6	4439	4444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271115
84	NC_009479	GAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271115
85	NC_009479	CCG	2	6	4497	4502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271115
86	NC_009479	TGG	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271115
87	NC_009479	GCG	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271115
88	NC_009479	GCA	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271115
89	NC_009479	TCG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271115
90	NC_009479	CTT	2	6	4676	4681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271115
91	NC_009479	CGAG	2	8	4726	4733	25 %	0 %	50 %	25 %	148271115
92	NC_009479	GGA	3	9	4789	4797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271116
93	NC_009479	GCG	2	6	4845	4850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271116
94	NC_009479	CGCCA	2	10	4853	4862	20 %	0 %	20 %	60 %	148271116
95	NC_009479	CGC	3	9	4885	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271116
96	NC_009479	TGA	2	6	4926	4931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271116
97	NC_009479	CGT	2	6	5017	5022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271116
98	NC_009479	CGG	2	6	5047	5052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271116
99	NC_009479	CCG	2	6	5082	5087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271116
100	NC_009479	CCT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271116
101	NC_009479	TGG	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271116
102	NC_009479	CCG	2	6	5232	5237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271116
103	NC_009479	CGGGA	2	10	5244	5253	20 %	0 %	60 %	20 %	148271116
104	NC_009479	CCT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271117
105	NC_009479	GCT	2	6	5293	5298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271117
106	NC_009479	TGG	3	9	5300	5308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271117
107	NC_009479	CGGC	2	8	5324	5331	0 %	0 %	50 %	50 %	148271117
108	NC_009479	TAC	2	6	5332	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271117
109	NC_009479	CGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
110	NC_009479	GAC	2	6	5376	5381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
111	NC_009479	AGC	2	6	5385	5390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
112	NC_009479	CGG	2	6	5402	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271117
113	NC_009479	TCG	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271117
114	NC_009479	ACGC	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	148271117
115	NC_009479	CGT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271117
116	NC_009479	ACG	2	6	5603	5608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
117	NC_009479	GC	3	6	5614	5619	0 %	0 %	50 %	50 %	148271117
118	NC_009479	CGG	2	6	5627	5632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271117
119	NC_009479	GCA	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
120	NC_009479	ACC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271117
121	NC_009479	GCA	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
122	NC_009479	AGC	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
123	NC_009479	CGAC	2	8	5828	5835	25 %	0 %	25 %	50 %	148271117
124	NC_009479	CAA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271117
125	NC_009479	CGA	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
126	NC_009479	CTCC	2	8	5905	5912	0 %	25 %	0 %	75 %	148271117
127	NC_009479	GCC	2	6	5914	5919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271117
128	NC_009479	CGA	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
129	NC_009479	CCGCG	2	10	5994	6003	0 %	0 %	40 %	60 %	148271117
130	NC_009479	ACC	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271117
131	NC_009479	CAC	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271117
132	NC_009479	CAT	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271118
133	NC_009479	ACG	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271118
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135	NC_009479	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271118
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138	NC_009479	ACG	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271118
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140	NC_009479	GC	3	6	6469	6474	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
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260	NC_009479	ACC	2	6	11203	11208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271123
261	NC_009479	GTC	2	6	11284	11289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271123
262	NC_009479	CGC	2	6	11322	11327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
263	NC_009479	GC	3	6	11354	11359	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
264	NC_009479	CGA	2	6	11376	11381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
265	NC_009479	CCG	2	6	11393	11398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
266	NC_009479	CGG	2	6	11406	11411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271123
267	NC_009479	CGA	2	6	11481	11486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
268	NC_009479	CGG	2	6	11568	11573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271123
269	NC_009479	ACCGAC	2	12	11617	11628	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148271123
270	NC_009479	CGCT	2	8	11638	11645	0 %	25 %	25 %	50 %	148271123
271	NC_009479	CG	5	10	11685	11694	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
272	NC_009479	CGC	2	6	11709	11714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
273	NC_009479	TCGG	2	8	11733	11740	0 %	25 %	50 %	25 %	148271123
274	NC_009479	CGA	2	6	11751	11756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
275	NC_009479	CGC	2	6	11791	11796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
276	NC_009479	GCT	2	6	11805	11810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271123
277	NC_009479	CGT	2	6	11892	11897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271123
278	NC_009479	CGC	2	6	11910	11915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
279	NC_009479	CCG	2	6	11930	11935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
280	NC_009479	CCG	2	6	11999	12004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
281	NC_009479	CGA	2	6	12024	12029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
282	NC_009479	GCC	2	6	12112	12117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
283	NC_009479	CG	3	6	12184	12189	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
284	NC_009479	GC	3	6	12249	12254	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
285	NC_009479	CCA	2	6	12308	12313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271123
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287	NC_009479	AGC	2	6	12413	12418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
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289	NC_009479	CGG	2	6	12446	12451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271123
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291	NC_009479	CCA	2	6	12615	12620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271123
292	NC_009479	GCG	2	6	12647	12652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271123
293	NC_009479	GAT	2	6	12720	12725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271123
294	NC_009479	CGC	2	6	12741	12746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
295	NC_009479	TCC	2	6	12758	12763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271123
296	NC_009479	CCG	2	6	12785	12790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
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301	NC_009479	CGGC	2	8	12969	12976	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
302	NC_009479	CGCGGC	2	12	12996	13007	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
303	NC_009479	GCA	2	6	13011	13016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
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310	NC_009479	TGA	2	6	13284	13289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271123
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320	NC_009479	GCGGCC	2	12	13510	13521	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
321	NC_009479	AGC	2	6	13522	13527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
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323	NC_009479	CCG	2	6	13592	13597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
324	NC_009479	CGC	2	6	13605	13610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271123
325	NC_009479	GGC	2	6	13671	13676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271123
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329	NC_009479	CGA	2	6	13764	13769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
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371	NC_009479	CCT	2	6	15527	15532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271125
372	NC_009479	CG	3	6	15573	15578	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
373	NC_009479	GGC	2	6	15581	15586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271125
374	NC_009479	CCT	2	6	15596	15601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271125
375	NC_009479	TCA	2	6	15626	15631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271125
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378	NC_009479	CGA	2	6	15755	15760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271125
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380	NC_009479	CGGG	2	8	15779	15786	0 %	0 %	75 %	25 %	148271125
381	NC_009479	GC	3	6	15868	15873	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
382	NC_009479	CATG	2	8	15908	15915	25 %	25 %	25 %	25 %	148271125
383	NC_009479	AGC	2	6	15967	15972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271125
384	NC_009479	CAC	2	6	15982	15987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271125
385	NC_009479	TCGGG	2	10	16019	16028	0 %	20 %	60 %	20 %	148271125
386	NC_009479	ACG	2	6	16714	16719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271126
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