MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 1230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009479	CGG	2	6	20752	20757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271130
502	NC_009479	CCG	2	6	20892	20897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271130
503	NC_009479	GCC	2	6	20932	20937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271130
504	NC_009479	GCC	2	6	20948	20953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271130
505	NC_009479	GTGGA	2	10	21026	21035	20 %	20 %	60 %	0 %	148271131
506	NC_009479	CTG	3	9	21039	21047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271131
507	NC_009479	CCA	2	6	21222	21227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271131
508	NC_009479	CGC	2	6	21265	21270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271131
509	NC_009479	CGA	2	6	21284	21289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
510	NC_009479	CCG	2	6	21294	21299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271131
511	NC_009479	ACG	2	6	21301	21306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
512	NC_009479	GGA	2	6	21357	21362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271131
513	NC_009479	GCG	2	6	21420	21425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271131
514	NC_009479	CAT	2	6	21430	21435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271131
515	NC_009479	CGT	2	6	21456	21461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271131
516	NC_009479	CGC	2	6	21473	21478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271131
517	NC_009479	CTCG	2	8	21610	21617	0 %	25 %	25 %	50 %	148271131
518	NC_009479	GCC	2	6	21630	21635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271131
519	NC_009479	GAT	2	6	21663	21668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271131
520	NC_009479	GGC	2	6	21679	21684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271131
521	NC_009479	CGG	2	6	21690	21695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271131
522	NC_009479	TTCC	2	8	21721	21728	0 %	50 %	0 %	50 %	148271131
523	NC_009479	GAG	2	6	21764	21769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271131
524	NC_009479	TCT	2	6	21849	21854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271131
525	NC_009479	CGA	2	6	21855	21860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
526	NC_009479	GCGA	2	8	21875	21882	25 %	0 %	50 %	25 %	148271131
527	NC_009479	ACG	2	6	21890	21895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
528	NC_009479	TTC	2	6	22046	22051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271131
529	NC_009479	TGG	2	6	22055	22060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271131
530	NC_009479	AGG	2	6	22061	22066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271131
531	NC_009479	CGA	2	6	22095	22100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
532	NC_009479	CAT	2	6	22143	22148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271131
533	NC_009479	CCTGT	2	10	22169	22178	0 %	40 %	20 %	40 %	148271131
534	NC_009479	TG	3	6	22209	22214	0 %	50 %	50 %	0 %	148271131
535	NC_009479	CG	3	6	22232	22237	0 %	0 %	50 %	50 %	148271131
536	NC_009479	GGA	2	6	22272	22277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271131
537	NC_009479	CAG	2	6	22282	22287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
538	NC_009479	GCGAGA	2	12	22301	22312	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148271131
539	NC_009479	ATGCCC	2	12	22326	22337	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148271131
540	NC_009479	CGA	2	6	22369	22374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271131
541	NC_009479	CACCC	2	10	22383	22392	20 %	0 %	0 %	80 %	148271131
542	NC_009479	TCAC	2	8	22478	22485	25 %	25 %	0 %	50 %	148271131
543	NC_009479	TTCC	2	8	22492	22499	0 %	50 %	0 %	50 %	148271132
544	NC_009479	CGC	2	6	22507	22512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271132
545	NC_009479	GCC	2	6	22545	22550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271132
546	NC_009479	TCCG	2	8	22631	22638	0 %	25 %	25 %	50 %	148271132
547	NC_009479	CTG	2	6	22642	22647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271132
548	NC_009479	GCC	4	12	22655	22666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271132
549	NC_009479	ACCG	2	8	22697	22704	25 %	0 %	25 %	50 %	148271132
550	NC_009479	CGC	2	6	22705	22710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271132
551	NC_009479	TCC	2	6	22763	22768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271132
552	NC_009479	CTG	3	9	22813	22821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271132
553	NC_009479	CCG	2	6	22830	22835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271132
554	NC_009479	GCA	2	6	22845	22850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271132
555	NC_009479	GCC	2	6	22904	22909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271132
556	NC_009479	CAG	2	6	22924	22929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271132
557	NC_009479	CGGC	2	8	22933	22940	0 %	0 %	50 %	50 %	148271132
558	NC_009479	GCA	2	6	23061	23066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271132
559	NC_009479	AAGG	2	8	23084	23091	50 %	0 %	50 %	0 %	148271132
560	NC_009479	AAG	2	6	23101	23106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271132
561	NC_009479	CTG	2	6	23123	23128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271132
562	NC_009479	CCAA	2	8	23241	23248	50 %	0 %	0 %	50 %	148271132
563	NC_009479	GCC	2	6	23306	23311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271132
564	NC_009479	AT	3	6	23337	23342	50 %	50 %	0 %	0 %	148271132
565	NC_009479	GCT	2	6	23385	23390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271132
566	NC_009479	CGT	2	6	23396	23401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271132
567	NC_009479	GTCCA	2	10	23581	23590	20 %	20 %	20 %	40 %	148271132
568	NC_009479	GGC	2	6	23666	23671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271132
569	NC_009479	CCTGC	2	10	23820	23829	0 %	20 %	20 %	60 %	148271133
570	NC_009479	CCG	2	6	23900	23905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271133
571	NC_009479	CTG	2	6	23985	23990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271133
572	NC_009479	ATC	2	6	24008	24013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271133
573	NC_009479	CGG	2	6	24132	24137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271133
574	NC_009479	CG	3	6	24170	24175	0 %	0 %	50 %	50 %	148271133
575	NC_009479	TCG	2	6	24204	24209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271133
576	NC_009479	C	6	6	24319	24324	0 %	0 %	0 %	100 %	148271133
577	NC_009479	GCC	3	9	24335	24343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271133
578	NC_009479	TGC	2	6	24352	24357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271133
579	NC_009479	CAC	2	6	24367	24372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271133
580	NC_009479	TCC	2	6	24392	24397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271133
581	NC_009479	TTC	2	6	24407	24412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271133
582	NC_009479	GAT	2	6	24469	24474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271133
583	NC_009479	GCC	2	6	24519	24524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271133
584	NC_009479	TGT	2	6	24539	24544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148271133
585	NC_009479	ATC	2	6	24712	24717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271134
586	NC_009479	CGG	2	6	24731	24736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271134
587	NC_009479	GCG	2	6	24745	24750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271134
588	NC_009479	GCCA	2	8	24754	24761	25 %	0 %	25 %	50 %	148271134
589	NC_009479	GCGCC	2	10	24788	24797	0 %	0 %	40 %	60 %	148271134
590	NC_009479	GGCA	2	8	24799	24806	25 %	0 %	50 %	25 %	148271134
591	NC_009479	CAGCTG	2	12	24839	24850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148271134
592	NC_009479	ATC	2	6	24895	24900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271134
593	NC_009479	CG	3	6	24951	24956	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
594	NC_009479	CG	3	6	24961	24966	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
595	NC_009479	TGG	2	6	25036	25041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271135
596	NC_009479	GCC	2	6	25044	25049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271135
597	NC_009479	CGA	3	9	25108	25116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271135
598	NC_009479	CCG	2	6	25120	25125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271135
599	NC_009479	GC	3	6	25204	25209	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
600	NC_009479	TCGG	2	8	25212	25219	0 %	25 %	50 %	25 %	148271135
601	NC_009479	TC	3	6	25243	25248	0 %	50 %	0 %	50 %	148271135
602	NC_009479	CGA	2	6	25300	25305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271135
603	NC_009479	GCG	2	6	25318	25323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271135
604	NC_009479	CGT	2	6	25360	25365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271135
605	NC_009479	GCA	2	6	25396	25401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271135
606	NC_009479	CG	3	6	25405	25410	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
607	NC_009479	TCG	2	6	25432	25437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271135
608	NC_009479	CCG	2	6	25463	25468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271135
609	NC_009479	GCG	2	6	25490	25495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271135
610	NC_009479	CGGTGA	2	12	25510	25521	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148271135
611	NC_009479	GGTGC	2	10	25697	25706	0 %	20 %	60 %	20 %	148271136
612	NC_009479	GTA	2	6	25712	25717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271136
613	NC_009479	ACG	3	9	25733	25741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271136
614	NC_009479	TCG	2	6	25804	25809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271136
615	NC_009479	CGC	2	6	25871	25876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271136
616	NC_009479	GAT	2	6	25884	25889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271136
617	NC_009479	CG	3	6	25957	25962	0 %	0 %	50 %	50 %	148271136
618	NC_009479	ACT	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271136
619	NC_009479	TCG	2	6	25988	25993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271136
620	NC_009479	GC	3	6	26046	26051	0 %	0 %	50 %	50 %	148271136
621	NC_009479	ACG	2	6	26155	26160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271136
622	NC_009479	GCGAA	2	10	26188	26197	40 %	0 %	40 %	20 %	148271136
623	NC_009479	CTC	2	6	26220	26225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271136
624	NC_009479	CGC	2	6	26273	26278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271136
625	NC_009479	GAGG	2	8	26292	26299	25 %	0 %	75 %	0 %	148271136
626	NC_009479	CCCGC	2	10	26345	26354	0 %	0 %	20 %	80 %	148271136
627	NC_009479	GCTT	2	8	26389	26396	0 %	50 %	25 %	25 %	148271136
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755	NC_009479	GC	4	8	33497	33504	0 %	0 %	50 %	50 %	148271142
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