MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 1202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	TCT	3	9	396	404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
2	NC_009466	AT	3	6	418	423	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
3	NC_009466	CTG	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
4	NC_009466	TCC	2	6	440	445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
5	NC_009466	GGA	2	6	467	472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245108
6	NC_009466	TAA	2	6	571	576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
7	NC_009466	T	6	6	598	603	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
8	NC_009466	TA	4	8	688	695	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
9	NC_009466	GCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245108
10	NC_009466	TAT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
11	NC_009466	TAT	2	6	757	762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
12	NC_009466	T	6	6	783	788	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
13	NC_009466	CCA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
14	NC_009466	CCA	2	6	873	878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
15	NC_009466	ATT	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
16	NC_009466	ATCA	2	8	1030	1037	50 %	25 %	0 %	25 %	148245108
17	NC_009466	TTTA	2	8	1051	1058	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
18	NC_009466	TAC	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
19	NC_009466	T	7	7	1102	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
20	NC_009466	TCT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
21	NC_009466	TAT	2	6	1224	1229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
22	NC_009466	T	7	7	1302	1308	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
23	NC_009466	TTC	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
24	NC_009466	AAT	2	6	1353	1358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
25	NC_009466	TAAT	2	8	1395	1402	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
26	NC_009466	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
27	NC_009466	CCT	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
28	NC_009466	TAG	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245108
29	NC_009466	TGA	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245108
30	NC_009466	AATT	2	8	1512	1519	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
31	NC_009466	ATT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
32	NC_009466	CAAA	2	8	1602	1609	75 %	0 %	0 %	25 %	148245108
33	NC_009466	TTAT	2	8	1637	1644	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
34	NC_009466	TGT	2	6	1749	1754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245108
35	NC_009466	TAAA	2	8	1777	1784	75 %	25 %	0 %	0 %	148245108
36	NC_009466	ATTT	2	8	1809	1816	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
37	NC_009466	TCA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
38	NC_009466	ATC	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
39	NC_009466	ATC	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
40	NC_009466	TCC	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
41	NC_009466	T	8	8	2044	2051	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
42	NC_009466	T	7	7	2070	2076	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
43	NC_009466	TA	3	6	2088	2093	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
44	NC_009466	CTG	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
45	NC_009466	ATTT	2	8	2121	2128	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
46	NC_009466	T	6	6	2126	2131	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
47	NC_009466	ATC	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
48	NC_009466	CCAG	2	8	2187	2194	25 %	0 %	25 %	50 %	148245108
49	NC_009466	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
50	NC_009466	CAC	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
51	NC_009466	TGG	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245108
52	NC_009466	CTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
53	NC_009466	GTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245108
54	NC_009466	CTTT	2	8	2478	2485	0 %	75 %	0 %	25 %	148245108
55	NC_009466	CTTTT	2	10	2517	2526	0 %	80 %	0 %	20 %	148245108
56	NC_009466	T	6	6	2536	2541	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
57	NC_009466	TAA	2	6	2555	2560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
58	NC_009466	T	8	8	2567	2574	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
59	NC_009466	AT	3	6	2605	2610	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
60	NC_009466	AT	3	6	2690	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
61	NC_009466	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	148245108
62	NC_009466	TA	3	6	2767	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
63	NC_009466	TTATTG	2	12	2849	2860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148245108
64	NC_009466	AAG	2	6	2880	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245108
65	NC_009466	TGGA	2	8	2896	2903	25 %	25 %	50 %	0 %	148245108
66	NC_009466	ATTTT	3	15	2910	2924	20 %	80 %	0 %	0 %	148245108
67	NC_009466	GCC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245109
68	NC_009466	TAA	2	6	3074	3079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245109
69	NC_009466	ATC	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
70	NC_009466	CT	3	6	3319	3324	0 %	50 %	0 %	50 %	148245109
71	NC_009466	T	6	6	3324	3329	0 %	100 %	0 %	0 %	148245109
72	NC_009466	TCA	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
73	NC_009466	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	148245109
74	NC_009466	TAA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245109
75	NC_009466	TCA	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
76	NC_009466	TCT	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245109
77	NC_009466	T	7	7	3477	3483	0 %	100 %	0 %	0 %	148245109
78	NC_009466	CT	3	6	3520	3525	0 %	50 %	0 %	50 %	148245109
79	NC_009466	ATC	2	6	3637	3642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
80	NC_009466	T	6	6	3722	3727	0 %	100 %	0 %	0 %	148245110
81	NC_009466	AT	3	6	3735	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	148245110
82	NC_009466	ACTG	2	8	3784	3791	25 %	25 %	25 %	25 %	148245110
83	NC_009466	CAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
84	NC_009466	ATACC	2	10	3831	3840	40 %	20 %	0 %	40 %	148245110
85	NC_009466	TTA	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
86	NC_009466	TTA	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
87	NC_009466	ATTC	2	8	3921	3928	25 %	50 %	0 %	25 %	148245110
88	NC_009466	ATTTTA	2	12	3971	3982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
89	NC_009466	TCA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
90	NC_009466	CTT	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245111
91	NC_009466	TA	3	6	4056	4061	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
92	NC_009466	T	7	7	4075	4081	0 %	100 %	0 %	0 %	148245111
93	NC_009466	AAG	2	6	4156	4161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245111
94	NC_009466	TTTA	2	8	4168	4175	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
95	NC_009466	TTCT	2	8	4183	4190	0 %	75 %	0 %	25 %	148245111
96	NC_009466	TA	3	6	4207	4212	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
97	NC_009466	TCT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245111
98	NC_009466	TAA	2	6	4252	4257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245111
99	NC_009466	ATTT	2	8	4258	4265	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
100	NC_009466	CAG	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245111
101	NC_009466	T	6	6	4299	4304	0 %	100 %	0 %	0 %	148245111
102	NC_009466	TAA	2	6	4335	4340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245111
103	NC_009466	TCA	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245111
104	NC_009466	AT	3	6	4371	4376	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
105	NC_009466	TA	3	6	4384	4389	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
106	NC_009466	TCC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245111
107	NC_009466	TTAT	2	8	4457	4464	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
108	NC_009466	ATT	2	6	4483	4488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245111
109	NC_009466	CCT	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245112
110	NC_009466	TC	3	6	4638	4643	0 %	50 %	0 %	50 %	148245112
111	NC_009466	TTGC	2	8	4672	4679	0 %	50 %	25 %	25 %	148245112
112	NC_009466	ATTT	2	8	4696	4703	25 %	75 %	0 %	0 %	148245112
113	NC_009466	CAT	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
114	NC_009466	ATC	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
115	NC_009466	TA	3	6	4778	4783	50 %	50 %	0 %	0 %	148245112
116	NC_009466	ATC	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
117	NC_009466	T	6	6	4808	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	148245112
118	NC_009466	T	6	6	4819	4824	0 %	100 %	0 %	0 %	148245112
119	NC_009466	AT	3	6	5094	5099	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
120	NC_009466	TCC	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245113
121	NC_009466	GCACT	2	10	5162	5171	20 %	20 %	20 %	40 %	148245113
122	NC_009466	AC	3	6	5188	5193	50 %	0 %	0 %	50 %	148245113
123	NC_009466	AAAT	2	8	5216	5223	75 %	25 %	0 %	0 %	148245113
124	NC_009466	TAA	2	6	5265	5270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245113
125	NC_009466	CTT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245113
126	NC_009466	TAT	2	6	5313	5318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245113
127	NC_009466	T	6	6	5332	5337	0 %	100 %	0 %	0 %	148245113
128	NC_009466	CTT	2	6	5365	5370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245113
129	NC_009466	AT	3	6	5385	5390	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
130	NC_009466	TGC	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245113
131	NC_009466	AT	3	6	5411	5416	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
132	NC_009466	CT	3	6	5434	5439	0 %	50 %	0 %	50 %	148245113
133	NC_009466	TC	3	6	5815	5820	0 %	50 %	0 %	50 %	148245114
134	NC_009466	TTTG	2	8	5828	5835	0 %	75 %	25 %	0 %	148245114
135	NC_009466	ATC	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245114
136	NC_009466	ACCT	2	8	5928	5935	25 %	25 %	0 %	50 %	148245114
137	NC_009466	CTT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245114
138	NC_009466	T	6	6	5967	5972	0 %	100 %	0 %	0 %	148245114
139	NC_009466	CATTTC	2	12	6380	6391	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148245115
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143	NC_009466	TCC	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245115
144	NC_009466	CAT	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245115
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147	NC_009466	TAT	2	6	6776	6781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245115
148	NC_009466	TTCT	2	8	6878	6885	0 %	75 %	0 %	25 %	148245116
149	NC_009466	TAA	2	6	6933	6938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245116
150	NC_009466	T	7	7	6990	6996	0 %	100 %	0 %	0 %	148245116
151	NC_009466	TTA	2	6	7004	7009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245116
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153	NC_009466	TGG	2	6	7080	7085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245116
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155	NC_009466	TCCT	2	8	7105	7112	0 %	50 %	0 %	50 %	148245116
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173	NC_009466	CTT	2	6	8207	8212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245120
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254	NC_009466	TTGT	2	8	12022	12029	0 %	75 %	25 %	0 %	148245123
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259	NC_009466	GCC	2	6	12464	12469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245123
260	NC_009466	CTG	2	6	12693	12698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245123
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262	NC_009466	TATT	2	8	12723	12730	25 %	75 %	0 %	0 %	148245123
263	NC_009466	A	6	6	12734	12739	100 %	0 %	0 %	0 %	148245123
264	NC_009466	TTA	2	6	12750	12755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245123
265	NC_009466	AAT	2	6	12795	12800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
266	NC_009466	TCT	2	6	12859	12864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
267	NC_009466	AAT	2	6	12949	12954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
268	NC_009466	GCT	2	6	12960	12965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245123
269	NC_009466	ATTT	2	8	12975	12982	25 %	75 %	0 %	0 %	148245123
270	NC_009466	TTC	2	6	13017	13022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
271	NC_009466	TCC	2	6	13099	13104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245124
272	NC_009466	CATCTG	2	12	13109	13120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148245124
273	NC_009466	TCA	2	6	13126	13131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245124
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275	NC_009466	CCT	2	6	13180	13185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245124
276	NC_009466	CCCA	2	8	13199	13206	25 %	0 %	0 %	75 %	148245124
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280	NC_009466	TTTC	2	8	13483	13490	0 %	75 %	0 %	25 %	148245125
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396	NC_009466	ATA	2	6	19656	19661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245140
397	NC_009466	TGT	2	6	19728	19733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245140
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