MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 93864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	TAA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697567
2	NC_009089	T	6	6	76	81	0 %	100 %	0 %	0 %	126697567
3	NC_009089	TAA	2	6	144	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697567
4	NC_009089	A	7	7	210	216	100 %	0 %	0 %	0 %	126697567
5	NC_009089	TGC	2	6	366	371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126697567
6	NC_009089	GTTGCA	2	12	376	387	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126697567
7	NC_009089	T	7	7	416	422	0 %	100 %	0 %	0 %	126697567
8	NC_009089	GGA	2	6	427	432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697567
9	NC_009089	ATGC	2	8	457	464	25 %	25 %	25 %	25 %	126697567
10	NC_009089	TCA	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126697567
11	NC_009089	A	8	8	488	495	100 %	0 %	0 %	0 %	126697567
12	NC_009089	AGT	2	6	504	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697567
13	NC_009089	TTC	2	6	516	521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126697567
14	NC_009089	GAA	2	6	571	576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
15	NC_009089	AATA	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	126697567
16	NC_009089	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126697567
17	NC_009089	AGAA	2	8	642	649	75 %	0 %	25 %	0 %	126697567
18	NC_009089	AAG	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
19	NC_009089	CAAA	3	12	692	703	75 %	0 %	0 %	25 %	126697567
20	NC_009089	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
21	NC_009089	A	6	6	834	839	100 %	0 %	0 %	0 %	126697567
22	NC_009089	AT	3	6	882	887	50 %	50 %	0 %	0 %	126697567
23	NC_009089	A	6	6	891	896	100 %	0 %	0 %	0 %	126697567
24	NC_009089	TTC	2	6	951	956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126697567
25	NC_009089	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126697567
26	NC_009089	GAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
27	NC_009089	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126697567
28	NC_009089	A	7	7	1105	1111	100 %	0 %	0 %	0 %	126697567
29	NC_009089	CG	3	6	1157	1162	0 %	0 %	50 %	50 %	126697567
30	NC_009089	ACA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126697567
31	NC_009089	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
32	NC_009089	GAA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697567
33	NC_009089	AAT	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400927236
34	NC_009089	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	400927236
35	NC_009089	GAATTG	2	12	1599	1610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400927236
36	NC_009089	ACA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400927236
37	NC_009089	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400927236
38	NC_009089	AGA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400927236
39	NC_009089	ATG	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400927236
40	NC_009089	TGT	3	9	1759	1767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400927236
41	NC_009089	TTG	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400927236
42	NC_009089	ATA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400927236
43	NC_009089	GCA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400927236
44	NC_009089	GAA	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400927236
45	NC_009089	TA	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	400927236
46	NC_009089	A	6	6	1963	1968	100 %	0 %	0 %	0 %	400927236
47	NC_009089	AAAC	2	8	1976	1983	75 %	0 %	0 %	25 %	400927236
48	NC_009089	CAAA	2	8	2006	2013	75 %	0 %	0 %	25 %	400927236
49	NC_009089	TAGA	2	8	2046	2053	50 %	25 %	25 %	0 %	400927236
50	NC_009089	TAG	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400927236
51	NC_009089	GTT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400927236
52	NC_009089	A	7	7	2214	2220	100 %	0 %	0 %	0 %	400927236
53	NC_009089	TAAT	2	8	2232	2239	50 %	50 %	0 %	0 %	400927236
54	NC_009089	ATT	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400927236
55	NC_009089	A	6	6	2288	2293	100 %	0 %	0 %	0 %	400927236
56	NC_009089	CAG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400927236
57	NC_009089	TTAAA	2	10	2322	2331	60 %	40 %	0 %	0 %	400927236
58	NC_009089	AG	4	8	2356	2363	50 %	0 %	50 %	0 %	400927236
59	NC_009089	A	7	7	2385	2391	100 %	0 %	0 %	0 %	400927236
60	NC_009089	GAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400927236
61	NC_009089	TAC	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400927236
62	NC_009089	GAT	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400927236
63	NC_009089	TACT	2	8	2630	2637	25 %	50 %	0 %	25 %	400927236
64	NC_009089	ATC	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400927236
65	NC_009089	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	400927236
66	NC_009089	TAT	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697569
67	NC_009089	AT	3	6	2831	2836	50 %	50 %	0 %	0 %	126697569
68	NC_009089	AGG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697569
69	NC_009089	AAG	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697569
70	NC_009089	ATG	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697569
71	NC_009089	AAG	2	6	2942	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697569
72	NC_009089	A	6	6	2951	2956	100 %	0 %	0 %	0 %	126697569
73	NC_009089	TAAAA	2	10	2993	3002	80 %	20 %	0 %	0 %	126697569
74	NC_009089	A	7	7	3010	3016	100 %	0 %	0 %	0 %	126697569
75	NC_009089	TTG	2	6	3111	3116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126697570
76	NC_009089	TAG	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
77	NC_009089	CTTT	2	8	3164	3171	0 %	75 %	0 %	25 %	126697570
78	NC_009089	TA	3	6	3231	3236	50 %	50 %	0 %	0 %	126697570
79	NC_009089	GGA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697570
80	NC_009089	ATA	2	6	3258	3263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697570
81	NC_009089	ATT	2	6	3284	3289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697570
82	NC_009089	A	6	6	3299	3304	100 %	0 %	0 %	0 %	126697570
83	NC_009089	AATA	2	8	3313	3320	75 %	25 %	0 %	0 %	126697570
84	NC_009089	ACT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126697570
85	NC_009089	TGT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126697570
86	NC_009089	GGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	126697570
87	NC_009089	AAAG	2	8	3413	3420	75 %	0 %	25 %	0 %	126697570
88	NC_009089	TAA	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697570
89	NC_009089	TGA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
90	NC_009089	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697570
91	NC_009089	ATG	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
92	NC_009089	TTATAT	2	12	3586	3597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697570
93	NC_009089	A	6	6	3616	3621	100 %	0 %	0 %	0 %	126697570
94	NC_009089	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	126697570
95	NC_009089	AAAT	2	8	3699	3706	75 %	25 %	0 %	0 %	126697570
96	NC_009089	TGA	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
97	NC_009089	TA	3	6	3735	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	126697570
98	NC_009089	AT	3	6	3828	3833	50 %	50 %	0 %	0 %	126697570
99	NC_009089	CAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126697570
100	NC_009089	TAA	2	6	3921	3926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697570
101	NC_009089	A	6	6	3925	3930	100 %	0 %	0 %	0 %	126697570
102	NC_009089	GAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126697570
103	NC_009089	GAT	2	6	3962	3967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
104	NC_009089	AAT	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697570
105	NC_009089	A	7	7	4061	4067	100 %	0 %	0 %	0 %	126697570
106	NC_009089	TGA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697570
107	NC_009089	A	7	7	4077	4083	100 %	0 %	0 %	0 %	126697570
108	NC_009089	TTA	2	6	4116	4121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126697570
109	NC_009089	GGA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697570
110	NC_009089	GTAT	2	8	4215	4222	25 %	50 %	25 %	0 %	126697571
111	NC_009089	GTA	2	6	4227	4232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
112	NC_009089	ATA	2	6	4275	4280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126697571
113	NC_009089	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	126697571
114	NC_009089	AGG	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697571
115	NC_009089	GGA	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126697571
116	NC_009089	ATGG	2	8	4525	4532	25 %	25 %	50 %	0 %	126697571
117	NC_009089	TTTA	2	8	4542	4549	25 %	75 %	0 %	0 %	126697571
118	NC_009089	AT	3	6	4559	4564	50 %	50 %	0 %	0 %	126697571
119	NC_009089	AGT	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
120	NC_009089	TGA	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
121	NC_009089	CTTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	126697571
122	NC_009089	A	6	6	4776	4781	100 %	0 %	0 %	0 %	126697571
123	NC_009089	GGT	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126697571
124	NC_009089	AT	3	6	4816	4821	50 %	50 %	0 %	0 %	126697571
125	NC_009089	TAAA	2	8	4830	4837	75 %	25 %	0 %	0 %	126697571
126	NC_009089	ATG	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
127	NC_009089	TA	3	6	4868	4873	50 %	50 %	0 %	0 %	126697571
128	NC_009089	TGA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
129	NC_009089	TTGTT	2	10	4891	4900	0 %	80 %	20 %	0 %	126697571
130	NC_009089	AT	3	6	4940	4945	50 %	50 %	0 %	0 %	126697571
131	NC_009089	AC	3	6	4967	4972	50 %	0 %	0 %	50 %	126697571
132	NC_009089	GGT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126697571
133	NC_009089	AGC	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126697571
134	NC_009089	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	126697571
135	NC_009089	ATG	2	6	5061	5066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126697571
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