MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 65849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009012	ATG	2	6	221703	221708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972709
4003	NC_009012	AGC	2	6	221802	221807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972709
4004	NC_009012	GTT	2	6	221870	221875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972709
4005	NC_009012	AAT	2	6	221959	221964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972709
4006	NC_009012	TTG	2	6	221988	221993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972709
4007	NC_009012	GTG	2	6	222101	222106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972709
4008	NC_009012	AGA	2	6	222142	222147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972709
4009	NC_009012	TGT	2	6	222157	222162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972709
4010	NC_009012	GCA	2	6	222210	222215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972709
4011	NC_009012	TA	4	8	222261	222268	50 %	50 %	0 %	0 %	125972709
4012	NC_009012	GTG	2	6	222437	222442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972709
4013	NC_009012	GTT	2	6	222635	222640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972709
4014	NC_009012	A	7	7	222687	222693	100 %	0 %	0 %	0 %	125972709
4015	NC_009012	ATT	2	6	222698	222703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972709
4016	NC_009012	AAG	2	6	222858	222863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972709
4017	NC_009012	ACCT	2	8	222952	222959	25 %	25 %	0 %	50 %	125972709
4018	NC_009012	ACTCCG	2	12	222992	223003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	125972709
4019	NC_009012	GGT	2	6	223015	223020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972709
4020	NC_009012	AAG	2	6	223193	223198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972709
4021	NC_009012	GTT	2	6	223250	223255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972709
4022	NC_009012	A	6	6	223289	223294	100 %	0 %	0 %	0 %	125972709
4023	NC_009012	CAA	2	6	223366	223371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972709
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4029	NC_009012	AAG	2	6	223608	223613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972709
4030	NC_009012	CTG	2	6	223667	223672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972709
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4033	NC_009012	GA	3	6	223868	223873	50 %	0 %	50 %	0 %	125972709
4034	NC_009012	AT	3	6	223876	223881	50 %	50 %	0 %	0 %	125972709
4035	NC_009012	AAT	2	6	223922	223927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972709
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4040	NC_009012	CGG	2	6	224112	224117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972709
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4043	NC_009012	GCG	2	6	224192	224197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972709
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4045	NC_009012	TAGAA	2	10	224238	224247	60 %	20 %	20 %	0 %	125972709
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4054	NC_009012	CCA	2	6	224866	224871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125972710
4055	NC_009012	GCTG	2	8	224891	224898	0 %	25 %	50 %	25 %	125972710
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4057	NC_009012	CGGA	2	8	225100	225107	25 %	0 %	50 %	25 %	125972710
4058	NC_009012	TACA	2	8	225123	225130	50 %	25 %	0 %	25 %	125972710
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4065	NC_009012	GAAA	2	8	225717	225724	75 %	0 %	25 %	0 %	125972711
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4094	NC_009012	GA	3	6	227117	227122	50 %	0 %	50 %	0 %	125972712
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4103	NC_009012	TTGA	2	8	227476	227483	25 %	50 %	25 %	0 %	125972712
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4106	NC_009012	GGA	2	6	227632	227637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972713
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4113	NC_009012	GAA	2	6	227927	227932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972713
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4245	NC_009012	CTTAT	2	10	235938	235947	20 %	60 %	0 %	20 %	125972718
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4493	NC_009012	ACA	2	6	250443	250448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972730
4494	NC_009012	CAG	2	6	250469	250474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972730
4495	NC_009012	ATT	2	6	250488	250493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972730
4496	NC_009012	GGA	2	6	250658	250663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972730
4497	NC_009012	A	6	6	250703	250708	100 %	0 %	0 %	0 %	125972730
4498	NC_009012	GA	4	8	250822	250829	50 %	0 %	50 %	0 %	125972730
4499	NC_009012	GAA	2	6	250852	250857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972730
4500	NC_009012	GGA	2	6	250880	250885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972730

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