MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 chromosome

Total Repeats: 35422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008787	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	121612751
2	NC_008787	AAACGA	2	12	42	53	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121612751
3	NC_008787	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	121612751
4	NC_008787	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	121612751
5	NC_008787	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	121612751
6	NC_008787	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612751
7	NC_008787	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121612751
8	NC_008787	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121612751
9	NC_008787	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	121612751
10	NC_008787	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	121612751
11	NC_008787	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121612751
12	NC_008787	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612751
13	NC_008787	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612751
14	NC_008787	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612751
15	NC_008787	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	121612751
16	NC_008787	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121612751
17	NC_008787	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121612751
18	NC_008787	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612751
19	NC_008787	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121612751
20	NC_008787	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	121612751
21	NC_008787	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	121612751
22	NC_008787	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	121612751
23	NC_008787	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612751
24	NC_008787	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	121612751
25	NC_008787	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	121612751
26	NC_008787	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121612751
27	NC_008787	CTT	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121612751
28	NC_008787	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612751
29	NC_008787	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
30	NC_008787	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
31	NC_008787	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	121612492
32	NC_008787	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121612492
33	NC_008787	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121612492
34	NC_008787	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	121612492
35	NC_008787	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
36	NC_008787	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	121612492
37	NC_008787	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612492
38	NC_008787	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612492
39	NC_008787	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121612492
40	NC_008787	T	6	6	1764	1769	0 %	100 %	0 %	0 %	121612492
41	NC_008787	A	7	7	1781	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
42	NC_008787	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
43	NC_008787	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121612492
44	NC_008787	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	121612492
45	NC_008787	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
46	NC_008787	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612492
47	NC_008787	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
48	NC_008787	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	121612492
49	NC_008787	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
50	NC_008787	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	121612492
51	NC_008787	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612492
52	NC_008787	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612492
53	NC_008787	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612492
54	NC_008787	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121612492
55	NC_008787	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	121612557
56	NC_008787	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612557
57	NC_008787	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612557
58	NC_008787	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	121612557
59	NC_008787	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	121612557
60	NC_008787	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121612557
61	NC_008787	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	121612557
62	NC_008787	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	121612557
63	NC_008787	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	121612557
64	NC_008787	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	121612557
65	NC_008787	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121612557
66	NC_008787	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121612557
67	NC_008787	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	121612557
68	NC_008787	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	121612557
69	NC_008787	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612557
70	NC_008787	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	121612557
71	NC_008787	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	121612557
72	NC_008787	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121612557
73	NC_008787	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121612557
74	NC_008787	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	121612557
75	NC_008787	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	121612557
76	NC_008787	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121612557
77	NC_008787	TGT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121612557
78	NC_008787	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612557
79	NC_008787	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	121612557
80	NC_008787	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121612557
81	NC_008787	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	121612557
82	NC_008787	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	121612557
83	NC_008787	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121612557
84	NC_008787	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121612557
85	NC_008787	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612557
86	NC_008787	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121612557
87	NC_008787	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	121612557
88	NC_008787	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121612557
89	NC_008787	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	121612557
90	NC_008787	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	121612557
91	NC_008787	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	121612557
92	NC_008787	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612557
93	NC_008787	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612557
94	NC_008787	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612557
95	NC_008787	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612557
96	NC_008787	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612557
97	NC_008787	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	121612557
98	NC_008787	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612557
99	NC_008787	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121612557
100	NC_008787	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121612557
101	NC_008787	TTC	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121612266
102	NC_008787	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	121612266
103	NC_008787	TTC	3	9	4952	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121612266
104	NC_008787	ATA	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121612266
105	NC_008787	T	6	6	5006	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	121612266
106	NC_008787	CATC	2	8	5055	5062	25 %	25 %	0 %	50 %	121612266
107	NC_008787	GCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121612266
108	NC_008787	T	6	6	5082	5087	0 %	100 %	0 %	0 %	121612266
109	NC_008787	TGCA	2	8	5091	5098	25 %	25 %	25 %	25 %	121612266
110	NC_008787	AATC	2	8	5169	5176	50 %	25 %	0 %	25 %	121612266
111	NC_008787	T	7	7	5246	5252	0 %	100 %	0 %	0 %	121612266
112	NC_008787	GCAT	2	8	5285	5292	25 %	25 %	25 %	25 %	121613203
113	NC_008787	AT	3	6	5298	5303	50 %	50 %	0 %	0 %	121613203
114	NC_008787	CCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121613203
115	NC_008787	ATA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121613203
116	NC_008787	TTG	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121613203
117	NC_008787	T	6	6	5546	5551	0 %	100 %	0 %	0 %	121613203
118	NC_008787	T	6	6	5692	5697	0 %	100 %	0 %	0 %	121613203
119	NC_008787	CAT	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121613203
120	NC_008787	ACC	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121613203
121	NC_008787	ACAA	2	8	5771	5778	75 %	0 %	0 %	25 %	121613203
122	NC_008787	CTC	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121613203
123	NC_008787	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121613203
124	NC_008787	ATA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121613203
125	NC_008787	CAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121613203
126	NC_008787	T	6	6	6117	6122	0 %	100 %	0 %	0 %	121613203
127	NC_008787	TCT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121613203
128	NC_008787	T	6	6	6143	6148	0 %	100 %	0 %	0 %	121613203
129	NC_008787	TCTT	2	8	6197	6204	0 %	75 %	0 %	25 %	121613203
130	NC_008787	TGG	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121613203
131	NC_008787	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121613203
132	NC_008787	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121613203
133	NC_008787	T	6	6	6335	6340	0 %	100 %	0 %	0 %	121613203
134	NC_008787	A	6	6	6390	6395	100 %	0 %	0 %	0 %	121613203
135	NC_008787	T	6	6	6450	6455	0 %	100 %	0 %	0 %	121613203
136	NC_008787	TACT	2	8	6714	6721	25 %	50 %	0 %	25 %	121612732
137	NC_008787	GTT	2	6	6740	6745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121612732
138	NC_008787	TGA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121612732
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