MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40 chromosome

Total Repeats: 34566

< Previous12...58596061626364656667686970Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_008599	AT	3	6	1769224	1769229	50 %	50 %	0 %	0 %	118474247
34502	NC_008599	GATA	2	8	1769282	1769289	50 %	25 %	25 %	0 %	118474247
34503	NC_008599	GCT	2	6	1769487	1769492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118474247
34504	NC_008599	ATA	2	6	1769511	1769516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118474247
34505	NC_008599	CGG	3	9	1769566	1769574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118474247
34506	NC_008599	GC	3	6	1769599	1769604	0 %	0 %	50 %	50 %	118474247
34507	NC_008599	GCGG	2	8	1769639	1769646	0 %	0 %	75 %	25 %	118474247
34508	NC_008599	GCAGTC	2	12	1769681	1769692	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118474247
34509	NC_008599	GA	3	6	1769867	1769872	50 %	0 %	50 %	0 %	118474247
34510	NC_008599	CGA	2	6	1769923	1769928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118474247
34511	NC_008599	AGT	2	6	1769978	1769983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118474247
34512	NC_008599	AAG	2	6	1770103	1770108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118474247
34513	NC_008599	TAC	2	6	1770152	1770157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118474247
34514	NC_008599	CAAA	2	8	1770158	1770165	75 %	0 %	0 %	25 %	118474247
34515	NC_008599	TGA	2	6	1770175	1770180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118474247
34516	NC_008599	TGA	2	6	1770199	1770204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118474247
34517	NC_008599	TGG	2	6	1770226	1770231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118474247
34518	NC_008599	A	6	6	1770239	1770244	100 %	0 %	0 %	0 %	118474247
34519	NC_008599	A	7	7	1770248	1770254	100 %	0 %	0 %	0 %	118474247
34520	NC_008599	ATA	2	6	1770276	1770281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118474247
34521	NC_008599	AT	3	6	1770285	1770290	50 %	50 %	0 %	0 %	118474247
34522	NC_008599	TAG	2	6	1770294	1770299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118474247
34523	NC_008599	AGA	2	6	1770373	1770378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118474247
34524	NC_008599	TAT	2	6	1770532	1770537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118474247
34525	NC_008599	AAG	2	6	1770783	1770788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118474247
34526	NC_008599	TAG	2	6	1770846	1770851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118474247
34527	NC_008599	ACT	2	6	1770854	1770859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118474247
34528	NC_008599	GTA	2	6	1770926	1770931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118474247
34529	NC_008599	AT	3	6	1771050	1771055	50 %	50 %	0 %	0 %	118474247
34530	NC_008599	TACT	2	8	1771132	1771139	25 %	50 %	0 %	25 %	118474247
34531	NC_008599	AAG	2	6	1771144	1771149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118474247
34532	NC_008599	CGG	2	6	1771519	1771524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118475451
34533	NC_008599	ATT	2	6	1771540	1771545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475451
34534	NC_008599	TAGC	2	8	1771548	1771555	25 %	25 %	25 %	25 %	118475451
34535	NC_008599	GGA	2	6	1771583	1771588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118475451
34536	NC_008599	GCG	2	6	1771787	1771792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118475451
34537	NC_008599	CT	3	6	1771830	1771835	0 %	50 %	0 %	50 %	118475451
34538	NC_008599	TTA	4	12	1771857	1771868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475451
34539	NC_008599	ATT	2	6	1771872	1771877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475451
34540	NC_008599	GA	3	6	1771896	1771901	50 %	0 %	50 %	0 %	118475451
34541	NC_008599	TAT	2	6	1771978	1771983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475451
34542	NC_008599	GGC	2	6	1771997	1772002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118475451
34543	NC_008599	AGTG	2	8	1772020	1772027	25 %	25 %	50 %	0 %	118475451
34544	NC_008599	TGG	2	6	1772085	1772090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475451
34545	NC_008599	A	6	6	1772143	1772148	100 %	0 %	0 %	0 %	118475451
34546	NC_008599	A	6	6	1772154	1772159	100 %	0 %	0 %	0 %	118475451
34547	NC_008599	T	6	6	1772202	1772207	0 %	100 %	0 %	0 %	118475451
34548	NC_008599	ATA	2	6	1772225	1772230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475451
34549	NC_008599	ACAA	2	8	1772465	1772472	75 %	0 %	0 %	25 %	118475451
34550	NC_008599	ATC	2	6	1772510	1772515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475451
34551	NC_008599	AGC	2	6	1772518	1772523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475451
34552	NC_008599	T	6	6	1772527	1772532	0 %	100 %	0 %	0 %	118475451
34553	NC_008599	ATGG	2	8	1772605	1772612	25 %	25 %	50 %	0 %	118475451
34554	NC_008599	TTA	2	6	1772724	1772729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475451
34555	NC_008599	CTTA	2	8	1772794	1772801	25 %	50 %	0 %	25 %	118475451
34556	NC_008599	AT	3	6	1772913	1772918	50 %	50 %	0 %	0 %	118475451
34557	NC_008599	T	6	6	1773062	1773067	0 %	100 %	0 %	0 %	118474695
34558	NC_008599	TGCCT	2	10	1773100	1773109	0 %	40 %	20 %	40 %	118474695
34559	NC_008599	T	6	6	1773118	1773123	0 %	100 %	0 %	0 %	118474695
34560	NC_008599	TG	3	6	1773225	1773230	0 %	50 %	50 %	0 %	118474695
34561	NC_008599	AT	3	6	1773237	1773242	50 %	50 %	0 %	0 %	118474695
34562	NC_008599	ATA	2	6	1773281	1773286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118474695
34563	NC_008599	TTTTAT	2	12	1773334	1773345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118474695
34564	NC_008599	T	7	7	1773366	1773372	0 %	100 %	0 %	0 %	118474695
34565	NC_008599	T	6	6	1773381	1773386	0 %	100 %	0 %	0 %	118474695
34566	NC_008599	TCA	2	6	1773438	1773443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118474695

< Previous12...58596061626364656667686970Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.