MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Solibacter usitatus Ellin6076 chromosome

Total Repeats: 207542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008536	TGA	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116619146
2	NC_008536	ATT	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116619146
3	NC_008536	CAAAG	2	10	122	131	60 %	0 %	20 %	20 %	116619146
4	NC_008536	CGA	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619146
5	NC_008536	GCG	2	6	380	385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619146
6	NC_008536	GTG	2	6	425	430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116619146
7	NC_008536	CGC	2	6	454	459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619146
8	NC_008536	ATGC	2	8	545	552	25 %	25 %	25 %	25 %	116619146
9	NC_008536	GATC	2	8	568	575	25 %	25 %	25 %	25 %	116619146
10	NC_008536	GCA	2	6	582	587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619146
11	NC_008536	ATC	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619146
12	NC_008536	CGAG	2	8	606	613	25 %	0 %	50 %	25 %	116619146
13	NC_008536	GAT	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116619146
14	NC_008536	GCA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619146
15	NC_008536	CGA	2	6	703	708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619146
16	NC_008536	CTG	2	6	716	721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619146
17	NC_008536	AGG	2	6	741	746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116619146
18	NC_008536	ACC	2	6	777	782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619146
19	NC_008536	C	6	6	812	817	0 %	0 %	0 %	100 %	116619146
20	NC_008536	GCC	2	6	886	891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619146
21	NC_008536	AAG	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619146
22	NC_008536	CGA	2	6	955	960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619146
23	NC_008536	CTC	2	6	1039	1044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619146
24	NC_008536	CCG	2	6	1114	1119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619146
25	NC_008536	TCCA	2	8	1133	1140	25 %	25 %	0 %	50 %	116619146
26	NC_008536	AAG	2	6	1202	1207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619146
27	NC_008536	GC	3	6	1279	1284	0 %	0 %	50 %	50 %	116619146
28	NC_008536	CGG	2	6	1288	1293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619146
29	NC_008536	CAC	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619146
30	NC_008536	CAA	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116619146
31	NC_008536	TAC	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619146
32	NC_008536	TC	3	6	1681	1686	0 %	50 %	0 %	50 %	116619147
33	NC_008536	GTG	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116619147
34	NC_008536	A	7	7	1701	1707	100 %	0 %	0 %	0 %	116619147
35	NC_008536	ACC	2	6	1709	1714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619147
36	NC_008536	CGAC	2	8	1773	1780	25 %	0 %	25 %	50 %	116619147
37	NC_008536	GC	3	6	1811	1816	0 %	0 %	50 %	50 %	116619147
38	NC_008536	AAGA	2	8	1820	1827	75 %	0 %	25 %	0 %	116619147
39	NC_008536	GC	3	6	1847	1852	0 %	0 %	50 %	50 %	116619147
40	NC_008536	CG	3	6	1968	1973	0 %	0 %	50 %	50 %	116619147
41	NC_008536	GGA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116619147
42	NC_008536	GC	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	116619147
43	NC_008536	CTG	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619147
44	NC_008536	CGCCT	2	10	2156	2165	0 %	20 %	20 %	60 %	116619147
45	NC_008536	AAG	2	6	2228	2233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619147
46	NC_008536	GAT	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116619147
47	NC_008536	TCG	2	6	2289	2294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619147
48	NC_008536	TGA	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116619147
49	NC_008536	TTC	2	6	2315	2320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116619147
50	NC_008536	CTG	2	6	2336	2341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619147
51	NC_008536	CG	3	6	2478	2483	0 %	0 %	50 %	50 %	116619147
52	NC_008536	GCG	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619147
53	NC_008536	AG	3	6	2554	2559	50 %	0 %	50 %	0 %	116619147
54	NC_008536	CCG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619147
55	NC_008536	TGCG	2	8	2628	2635	0 %	25 %	50 %	25 %	116619147
56	NC_008536	A	6	6	2673	2678	100 %	0 %	0 %	0 %	116619147
57	NC_008536	CCG	2	6	2697	2702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619147
58	NC_008536	CAG	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619148
59	NC_008536	TGCGCC	2	12	2866	2877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116619148
60	NC_008536	GTC	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619148
61	NC_008536	ACG	2	6	2998	3003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619148
62	NC_008536	GACG	2	8	3027	3034	25 %	0 %	50 %	25 %	116619148
63	NC_008536	GAA	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619148
64	NC_008536	CCG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619148
65	NC_008536	GTC	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619148
66	NC_008536	CGG	2	6	3107	3112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619148
67	NC_008536	CGG	2	6	3143	3148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619148
68	NC_008536	GC	3	6	3272	3277	0 %	0 %	50 %	50 %	116619148
69	NC_008536	CCA	2	6	3328	3333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619148
70	NC_008536	CAA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116619148
71	NC_008536	GGC	2	6	3471	3476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619148
72	NC_008536	TCA	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619148
73	NC_008536	CACGAT	2	12	3572	3583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116619148
74	NC_008536	ACG	2	6	3604	3609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619148
75	NC_008536	CAA	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116619148
76	NC_008536	GC	3	6	3688	3693	0 %	0 %	50 %	50 %	116619148
77	NC_008536	TC	3	6	3755	3760	0 %	50 %	0 %	50 %	116619148
78	NC_008536	CGA	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619148
79	NC_008536	GGT	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116619148
80	NC_008536	GCCGCA	2	12	3809	3820	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116619148
81	NC_008536	TCG	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619148
82	NC_008536	GCC	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619148
83	NC_008536	GACGC	2	10	3998	4007	20 %	0 %	40 %	40 %	116619148
84	NC_008536	GC	3	6	4012	4017	0 %	0 %	50 %	50 %	116619148
85	NC_008536	GGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619148
86	NC_008536	CGG	2	6	4109	4114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619148
87	NC_008536	CGC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619148
88	NC_008536	TCC	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619148
89	NC_008536	CTG	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619148
90	NC_008536	CTT	3	9	4361	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116619148
91	NC_008536	TCA	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619148
92	NC_008536	CG	3	6	4393	4398	0 %	0 %	50 %	50 %	116619148
93	NC_008536	AAG	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619148
94	NC_008536	CG	3	6	4500	4505	0 %	0 %	50 %	50 %	116619148
95	NC_008536	TCC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619148
96	NC_008536	CGA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619148
97	NC_008536	GAA	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619148
98	NC_008536	GGC	2	6	4856	4861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619148
99	NC_008536	CCG	2	6	4874	4879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619148
100	NC_008536	GCC	2	6	4919	4924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619148
101	NC_008536	TCG	2	6	4927	4932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619148
102	NC_008536	GAA	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619148
103	NC_008536	CTC	2	6	4977	4982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619148
104	NC_008536	AAGA	2	8	5004	5011	75 %	0 %	25 %	0 %	116619148
105	NC_008536	CTC	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619148
106	NC_008536	TCT	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116619148
107	NC_008536	GCC	2	6	5173	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619148
108	NC_008536	GAA	2	6	5190	5195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619148
109	NC_008536	CTTTT	2	10	5314	5323	0 %	80 %	0 %	20 %	116619149
110	NC_008536	ATC	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619149
111	NC_008536	CG	3	6	5366	5371	0 %	0 %	50 %	50 %	116619149
112	NC_008536	GCGCC	2	10	5435	5444	0 %	0 %	40 %	60 %	116619149
113	NC_008536	CGG	2	6	5475	5480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619149
114	NC_008536	CCG	2	6	5540	5545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
115	NC_008536	CGC	2	6	5553	5558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
116	NC_008536	CGC	2	6	5588	5593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
117	NC_008536	ACGG	2	8	5612	5619	25 %	0 %	50 %	25 %	116619149
118	NC_008536	CCG	2	6	5621	5626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
119	NC_008536	CTT	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116619149
120	NC_008536	GC	3	6	5637	5642	0 %	0 %	50 %	50 %	116619149
121	NC_008536	CCG	3	9	5663	5671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
122	NC_008536	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619149
123	NC_008536	GCGT	2	8	5709	5716	0 %	25 %	50 %	25 %	116619149
124	NC_008536	CCA	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619149
125	NC_008536	CGGC	2	8	5750	5757	0 %	0 %	50 %	50 %	116619149
126	NC_008536	CAT	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619149
127	NC_008536	GCG	2	6	5858	5863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619149
128	NC_008536	CGCC	2	8	5864	5871	0 %	0 %	25 %	75 %	116619149
129	NC_008536	CGC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
130	NC_008536	TGT	2	6	5966	5971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116619149
131	NC_008536	CAC	2	6	5979	5984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619149
132	NC_008536	TGG	2	6	5987	5992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116619149
133	NC_008536	CGTT	2	8	6025	6032	0 %	50 %	25 %	25 %	116619149
134	NC_008536	CGC	2	6	6039	6044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
135	NC_008536	GCCA	2	8	6064	6071	25 %	0 %	25 %	50 %	116619149
136	NC_008536	CAC	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619149
137	NC_008536	CTG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619149
138	NC_008536	GCC	2	6	6265	6270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
139	NC_008536	CCG	2	6	6278	6283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
140	NC_008536	TCG	2	6	6346	6351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619149
141	NC_008536	CGC	2	6	6378	6383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
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143	NC_008536	CGC	4	12	6417	6428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619149
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145	NC_008536	GCAG	2	8	6492	6499	25 %	0 %	50 %	25 %	116619149
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153	NC_008536	GAA	2	6	6862	6867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116619150
154	NC_008536	CCA	2	6	6906	6911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619150
155	NC_008536	GCA	2	6	6915	6920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619150
156	NC_008536	GTC	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619150
157	NC_008536	CCTGCA	2	12	7146	7157	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116619150
158	NC_008536	CGCA	2	8	7177	7184	25 %	0 %	25 %	50 %	116619150
159	NC_008536	TCC	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619150
160	NC_008536	CTTGG	2	10	7376	7385	0 %	40 %	40 %	20 %	116619150
161	NC_008536	CG	3	6	7406	7411	0 %	0 %	50 %	50 %	116619150
162	NC_008536	CGT	2	6	7440	7445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619150
163	NC_008536	CG	3	6	7480	7485	0 %	0 %	50 %	50 %	116619150
164	NC_008536	TTC	2	6	7532	7537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116619150
165	NC_008536	GCA	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619150
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170	NC_008536	CGC	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619150
171	NC_008536	CCG	3	9	7857	7865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619150
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173	NC_008536	GCA	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619150
174	NC_008536	CGCT	2	8	7961	7968	0 %	25 %	25 %	50 %	116619150
175	NC_008536	GC	3	6	8010	8015	0 %	0 %	50 %	50 %	116619150
176	NC_008536	TCG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619150
177	NC_008536	CCA	2	6	8127	8132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619150
178	NC_008536	CG	3	6	8170	8175	0 %	0 %	50 %	50 %	116619150
179	NC_008536	TCC	2	6	8225	8230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619150
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223	NC_008536	CAC	2	6	10321	10326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619152
224	NC_008536	ACG	3	9	10376	10384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619152
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233	NC_008536	TAT	2	6	10834	10839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116619152
234	NC_008536	GCCGC	2	10	10865	10874	0 %	0 %	40 %	60 %	116619152
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244	NC_008536	CGG	2	6	11393	11398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619153
245	NC_008536	ACT	2	6	11554	11559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619153
246	NC_008536	TGG	2	6	11586	11591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116619153
247	NC_008536	CTCC	2	8	11645	11652	0 %	25 %	0 %	75 %	116619153
248	NC_008536	GCC	2	6	11655	11660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619153
249	NC_008536	CAATT	2	10	12216	12225	40 %	40 %	0 %	20 %	116619154
250	NC_008536	GGT	2	6	12297	12302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116619154
251	NC_008536	AGC	2	6	12341	12346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619154
252	NC_008536	GC	3	6	12345	12350	0 %	0 %	50 %	50 %	116619154
253	NC_008536	TCG	2	6	12362	12367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619154
254	NC_008536	AACTG	2	10	12398	12407	40 %	20 %	20 %	20 %	116619154
255	NC_008536	CCT	2	6	12443	12448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619154
256	NC_008536	ATC	2	6	12463	12468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619154
257	NC_008536	GCC	2	6	12504	12509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116619154
258	NC_008536	TCC	2	6	12644	12649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116619154
259	NC_008536	GC	3	6	12658	12663	0 %	0 %	50 %	50 %	116619154
260	NC_008536	GGA	2	6	12669	12674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116619154
261	NC_008536	GGA	2	6	12747	12752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116619154
262	NC_008536	TAC	2	6	12769	12774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116619154
263	NC_008536	CACC	2	8	12777	12784	25 %	0 %	0 %	75 %	116619154
264	NC_008536	CTT	2	6	12831	12836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116619155
265	NC_008536	GCG	2	6	12851	12856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116619155
266	NC_008536	CTG	2	6	12921	12926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116619155
267	NC_008536	GAC	2	6	12958	12963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619155
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269	NC_008536	GCA	2	6	13459	13464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116619156
270	NC_008536	TCGA	2	8	13518	13525	25 %	25 %	25 %	25 %	116619156
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273	NC_008536	CAGCCG	2	12	13683	13694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116619157
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391	NC_008536	ACC	2	6	18634	18639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116619158
392	NC_008536	GCTC	2	8	18648	18655	0 %	25 %	25 %	50 %	116619158
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