MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 73009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_008261	ATAC	2	8	2889912	2889919	50 %	25 %	0 %	25 %	110799912
65002	NC_008261	TTC	2	6	2890047	2890052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799912
65003	NC_008261	T	6	6	2890067	2890072	0 %	100 %	0 %	0 %	110799912
65004	NC_008261	TTA	2	6	2890074	2890079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799912
65005	NC_008261	TCT	2	6	2890106	2890111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799912
65006	NC_008261	TCT	2	6	2890120	2890125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799912
65007	NC_008261	TTA	2	6	2890338	2890343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800174
65008	NC_008261	TCA	2	6	2890374	2890379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800174
65009	NC_008261	A	6	6	2890438	2890443	100 %	0 %	0 %	0 %	110800174
65010	NC_008261	AAC	2	6	2890513	2890518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110800174
65011	NC_008261	A	7	7	2890596	2890602	100 %	0 %	0 %	0 %	110800174
65012	NC_008261	AAG	2	6	2890628	2890633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800174
65013	NC_008261	TGA	2	6	2890644	2890649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800174
65014	NC_008261	GAA	2	6	2890670	2890675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800174
65015	NC_008261	AGA	2	6	2890686	2890691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800174
65016	NC_008261	AT	3	6	2890692	2890697	50 %	50 %	0 %	0 %	110800174
65017	NC_008261	AGA	2	6	2890698	2890703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800174
65018	NC_008261	TA	3	6	2890731	2890736	50 %	50 %	0 %	0 %	110800174
65019	NC_008261	TAT	2	6	2890831	2890836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800777
65020	NC_008261	AT	3	6	2890841	2890846	50 %	50 %	0 %	0 %	110800777
65021	NC_008261	CTTC	2	8	2890902	2890909	0 %	50 %	0 %	50 %	110800777
65022	NC_008261	CT	3	6	2891006	2891011	0 %	50 %	0 %	50 %	110800777
65023	NC_008261	T	6	6	2891046	2891051	0 %	100 %	0 %	0 %	110800777
65024	NC_008261	T	6	6	2891140	2891145	0 %	100 %	0 %	0 %	110800777
65025	NC_008261	TCC	2	6	2891150	2891155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110800777
65026	NC_008261	ATA	2	6	2891160	2891165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800777
65027	NC_008261	TTTA	2	8	2891270	2891277	25 %	75 %	0 %	0 %	110800777
65028	NC_008261	CAT	2	6	2891284	2891289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800777
65029	NC_008261	TC	3	6	2891306	2891311	0 %	50 %	0 %	50 %	110800777
65030	NC_008261	ATCC	2	8	2891368	2891375	25 %	25 %	0 %	50 %	110800777
65031	NC_008261	TTA	2	6	2891410	2891415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800777
65032	NC_008261	TAAT	2	8	2891464	2891471	50 %	50 %	0 %	0 %	110800777
65033	NC_008261	TCT	2	6	2891472	2891477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800777
65034	NC_008261	TTA	2	6	2891490	2891495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800777
65035	NC_008261	TTA	2	6	2891526	2891531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800777
65036	NC_008261	TCT	2	6	2891595	2891600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800777
65037	NC_008261	AAAT	2	8	2891623	2891630	75 %	25 %	0 %	0 %	110800777
65038	NC_008261	AAG	2	6	2891678	2891683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800777
65039	NC_008261	TTTTCT	2	12	2891703	2891714	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	110800777
65040	NC_008261	TCC	2	6	2891718	2891723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110800777
65041	NC_008261	CAT	2	6	2891752	2891757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800777
65042	NC_008261	CT	3	6	2891771	2891776	0 %	50 %	0 %	50 %	110800777
65043	NC_008261	TAT	2	6	2891825	2891830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800777
65044	NC_008261	TAA	2	6	2891878	2891883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800777
65045	NC_008261	AT	3	6	2891890	2891895	50 %	50 %	0 %	0 %	110800777
65046	NC_008261	T	6	6	2891895	2891900	0 %	100 %	0 %	0 %	110800777
65047	NC_008261	TTC	2	6	2891906	2891911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800777
65048	NC_008261	TGA	2	6	2891930	2891935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800777
65049	NC_008261	TCAT	2	8	2891937	2891944	25 %	50 %	0 %	25 %	110800777
65050	NC_008261	AT	3	6	2891977	2891982	50 %	50 %	0 %	0 %	110800777
65051	NC_008261	TTA	2	6	2892004	2892009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800777
65052	NC_008261	CTTTT	2	10	2892083	2892092	0 %	80 %	0 %	20 %	110800777
65053	NC_008261	AAG	2	6	2893507	2893512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801319
65054	NC_008261	CTAG	2	8	2893563	2893570	25 %	25 %	25 %	25 %	110801319
65055	NC_008261	TTG	2	6	2893577	2893582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110801319
65056	NC_008261	TTC	2	6	2893634	2893639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110801319
65057	NC_008261	AAG	2	6	2893666	2893671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801319
65058	NC_008261	AGC	2	6	2893709	2893714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110801319
65059	NC_008261	ATT	2	6	2893727	2893732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801319
65060	NC_008261	TAT	2	6	2893779	2893784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801319
65061	NC_008261	CTG	2	6	2893810	2893815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110801319
65062	NC_008261	AGA	3	9	2893832	2893840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801319
65063	NC_008261	A	7	7	2893845	2893851	100 %	0 %	0 %	0 %	110801319
65064	NC_008261	TAA	2	6	2893852	2893857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801319
65065	NC_008261	TTG	2	6	2893996	2894001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110801319
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65068	NC_008261	ATA	2	6	2894194	2894199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801319
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65070	NC_008261	TAC	2	6	2894225	2894230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801319
65071	NC_008261	TGA	2	6	2894231	2894236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801319
65072	NC_008261	ATT	2	6	2894258	2894263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801319
65073	NC_008261	AAT	2	6	2894282	2894287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801319
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65078	NC_008261	AACTC	2	10	2894499	2894508	40 %	20 %	0 %	40 %	110801319
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65080	NC_008261	TGA	2	6	2894717	2894722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801319
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65082	NC_008261	GA	3	6	2894813	2894818	50 %	0 %	50 %	0 %	110801319
65083	NC_008261	TGA	3	9	2894855	2894863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801319
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65086	NC_008261	ATC	2	6	2894928	2894933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801319
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65088	NC_008261	CAT	2	6	2895014	2895019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801319
65089	NC_008261	TTC	2	6	2895121	2895126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110801319
65090	NC_008261	GTT	2	6	2895162	2895167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110801319
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65099	NC_008261	AGAA	2	8	2895321	2895328	75 %	0 %	25 %	0 %	110801319
65100	NC_008261	GAA	2	6	2895333	2895338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801319
65101	NC_008261	GTC	2	6	2895885	2895890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110799051
65102	NC_008261	ACT	2	6	2895913	2895918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799051
65103	NC_008261	CTA	2	6	2895920	2895925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799051
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65107	NC_008261	AT	3	6	2896127	2896132	50 %	50 %	0 %	0 %	110799051
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65110	NC_008261	T	6	6	2896203	2896208	0 %	100 %	0 %	0 %	110799051
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65115	NC_008261	TCT	2	6	2896354	2896359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799051
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65117	NC_008261	TACATC	2	12	2896509	2896520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799051
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65470	NC_008261	ATCT	2	8	2914026	2914033	25 %	50 %	0 %	25 %	110800659
65471	NC_008261	ATT	2	6	2914039	2914044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800659
65472	NC_008261	AAT	2	6	2914060	2914065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800659
65473	NC_008261	CTT	2	6	2914157	2914162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800659
65474	NC_008261	CTT	2	6	2914175	2914180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800659
65475	NC_008261	AAG	2	6	2914188	2914193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800659
65476	NC_008261	GCAT	2	8	2914246	2914253	25 %	25 %	25 %	25 %	110800659
65477	NC_008261	TTA	2	6	2914301	2914306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800659
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65481	NC_008261	TCA	2	6	2914435	2914440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800659
65482	NC_008261	AAT	2	6	2914456	2914461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800659
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65490	NC_008261	CTT	2	6	2914853	2914858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800659
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65497	NC_008261	TC	3	6	2915082	2915087	0 %	50 %	0 %	50 %	110800659
65498	NC_008261	CT	3	6	2915093	2915098	0 %	50 %	0 %	50 %	110800659
65499	NC_008261	AT	3	6	2915152	2915157	50 %	50 %	0 %	0 %	110801309
65500	NC_008261	TCA	2	6	2915171	2915176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801309

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