MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 73009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_008261	TCT	2	6	2522003	2522008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800456
56502	NC_008261	AT	3	6	2522022	2522027	50 %	50 %	0 %	0 %	110800456
56503	NC_008261	TAAG	2	8	2522041	2522048	50 %	25 %	25 %	0 %	110800456
56504	NC_008261	TAAG	2	8	2522054	2522061	50 %	25 %	25 %	0 %	110800456
56505	NC_008261	TA	3	6	2522121	2522126	50 %	50 %	0 %	0 %	110800456
56506	NC_008261	AAT	2	6	2522141	2522146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800456
56507	NC_008261	AAT	2	6	2522148	2522153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800456
56508	NC_008261	TTTACT	2	12	2522188	2522199	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	110800456
56509	NC_008261	CCT	2	6	2522334	2522339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110798867
56510	NC_008261	T	6	6	2522347	2522352	0 %	100 %	0 %	0 %	110798867
56511	NC_008261	TAT	2	6	2522379	2522384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798867
56512	NC_008261	TCT	2	6	2522475	2522480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110798867
56513	NC_008261	ATT	3	9	2522504	2522512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798867
56514	NC_008261	ATC	2	6	2522569	2522574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110798867
56515	NC_008261	CTT	2	6	2522616	2522621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110798867
56516	NC_008261	ACA	2	6	2522663	2522668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110798867
56517	NC_008261	TCTT	2	8	2522671	2522678	0 %	75 %	0 %	25 %	110798867
56518	NC_008261	TATCA	2	10	2522689	2522698	40 %	40 %	0 %	20 %	110798867
56519	NC_008261	ATA	2	6	2522704	2522709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798867
56520	NC_008261	AAT	2	6	2522819	2522824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798867
56521	NC_008261	TCA	2	6	2522858	2522863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110798867
56522	NC_008261	TAT	2	6	2522914	2522919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798867
56523	NC_008261	ATA	2	6	2522964	2522969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798867
56524	NC_008261	CAA	2	6	2523057	2523062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110798867
56525	NC_008261	TTG	2	6	2523111	2523116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110798867
56526	NC_008261	TTA	2	6	2523125	2523130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798867
56527	NC_008261	TAA	2	6	2523157	2523162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798867
56528	NC_008261	CAA	2	6	2523198	2523203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110798867
56529	NC_008261	TCC	2	6	2523232	2523237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110800920
56530	NC_008261	TGT	2	6	2523288	2523293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110800920
56531	NC_008261	TA	3	6	2523297	2523302	50 %	50 %	0 %	0 %	110800920
56532	NC_008261	ATC	2	6	2523303	2523308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800920
56533	NC_008261	CTA	2	6	2523356	2523361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800920
56534	NC_008261	CTA	2	6	2523410	2523415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800920
56535	NC_008261	TTG	2	6	2523485	2523490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110800920
56536	NC_008261	ATG	2	6	2523497	2523502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800920
56537	NC_008261	TA	3	6	2523524	2523529	50 %	50 %	0 %	0 %	110800920
56538	NC_008261	AGC	2	6	2523549	2523554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110800920
56539	NC_008261	ACCT	2	8	2523558	2523565	25 %	25 %	0 %	50 %	110800920
56540	NC_008261	T	7	7	2523612	2523618	0 %	100 %	0 %	0 %	110800920
56541	NC_008261	T	6	6	2523627	2523632	0 %	100 %	0 %	0 %	110800920
56542	NC_008261	ATA	2	6	2523634	2523639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800920
56543	NC_008261	AAAATT	2	12	2523695	2523706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799849
56544	NC_008261	CTCTG	2	10	2523771	2523780	0 %	40 %	20 %	40 %	110799849
56545	NC_008261	TTA	2	6	2523786	2523791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799849
56546	NC_008261	TATAAT	2	12	2523811	2523822	50 %	50 %	0 %	0 %	110799849
56547	NC_008261	GCA	2	6	2523932	2523937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110799849
56548	NC_008261	AATA	2	8	2523967	2523974	75 %	25 %	0 %	0 %	110799849
56549	NC_008261	ATATA	2	10	2524044	2524053	60 %	40 %	0 %	0 %	110799849
56550	NC_008261	GCT	2	6	2524097	2524102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110799849
56551	NC_008261	GAT	2	6	2524128	2524133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799849
56552	NC_008261	CTG	2	6	2524185	2524190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110799849
56553	NC_008261	TAT	2	6	2524219	2524224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799849
56554	NC_008261	AAACA	2	10	2524248	2524257	80 %	0 %	0 %	20 %	110799849
56555	NC_008261	ATA	2	6	2524263	2524268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799849
56556	NC_008261	CTA	2	6	2524278	2524283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799849
56557	NC_008261	AT	3	6	2524321	2524326	50 %	50 %	0 %	0 %	110799849
56558	NC_008261	ATA	2	6	2524376	2524381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799849
56559	NC_008261	CTC	2	6	2524441	2524446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110800128
56560	NC_008261	TCTTCC	2	12	2524472	2524483	0 %	50 %	0 %	50 %	110800128
56561	NC_008261	TGAG	2	8	2524513	2524520	25 %	25 %	50 %	0 %	110800128
56562	NC_008261	CT	3	6	2524537	2524542	0 %	50 %	0 %	50 %	110800128
56563	NC_008261	TTCT	2	8	2524581	2524588	0 %	75 %	0 %	25 %	110800128
56564	NC_008261	TAAA	2	8	2524657	2524664	75 %	25 %	0 %	0 %	110800128
56565	NC_008261	AATC	2	8	2524692	2524699	50 %	25 %	0 %	25 %	110800128
56566	NC_008261	CTAT	2	8	2524727	2524734	25 %	50 %	0 %	25 %	110800128
56567	NC_008261	TTC	2	6	2524765	2524770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800128
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56570	NC_008261	CTT	2	6	2524852	2524857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800128
56571	NC_008261	TTC	2	6	2524864	2524869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800128
56572	NC_008261	TAT	2	6	2524893	2524898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800128
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56575	NC_008261	CTT	2	6	2524925	2524930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799495
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56583	NC_008261	ATT	2	6	2525069	2525074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799495
56584	NC_008261	T	6	6	2525080	2525085	0 %	100 %	0 %	0 %	110799495
56585	NC_008261	T	6	6	2525235	2525240	0 %	100 %	0 %	0 %	110799495
56586	NC_008261	ATG	2	6	2525276	2525281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799495
56587	NC_008261	ATT	3	9	2525358	2525366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799495
56588	NC_008261	TAC	2	6	2525368	2525373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799495
56589	NC_008261	TTTC	2	8	2525405	2525412	0 %	75 %	0 %	25 %	110799495
56590	NC_008261	CAT	2	6	2525458	2525463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799495
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56592	NC_008261	TCCTA	2	10	2525474	2525483	20 %	40 %	0 %	40 %	110799495
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56603	NC_008261	AT	3	6	2525818	2525823	50 %	50 %	0 %	0 %	110799495
56604	NC_008261	TCC	2	6	2525855	2525860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110799495
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56608	NC_008261	TAG	2	6	2525969	2525974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799495
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56612	NC_008261	TTTA	2	8	2526098	2526105	25 %	75 %	0 %	0 %	110799495
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56998	NC_008261	TC	3	6	2542015	2542020	0 %	50 %	0 %	50 %	110801024
56999	NC_008261	CATT	2	8	2542035	2542042	25 %	50 %	0 %	25 %	110801024
57000	NC_008261	TTA	2	6	2542086	2542091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801024

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