MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 85498

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007973	GGCA	2	8	117	124	25 %	0 %	50 %	25 %	94308946
2	NC_007973	CGC	2	6	153	158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308946
3	NC_007973	CGA	2	6	202	207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
4	NC_007973	TGCG	2	8	295	302	0 %	25 %	50 %	25 %	94308946
5	NC_007973	GC	3	6	358	363	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
6	NC_007973	AGCA	2	8	378	385	50 %	0 %	25 %	25 %	94308946
7	NC_007973	TGGC	2	8	459	466	0 %	25 %	50 %	25 %	94308946
8	NC_007973	GC	3	6	498	503	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
9	NC_007973	GC	3	6	513	518	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
10	NC_007973	CCAG	2	8	552	559	25 %	0 %	25 %	50 %	94308946
11	NC_007973	GC	3	6	567	572	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
12	NC_007973	GGC	2	6	584	589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308946
13	NC_007973	GCG	2	6	590	595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308946
14	NC_007973	GCA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
15	NC_007973	CGCGG	2	10	641	650	0 %	0 %	60 %	40 %	94308946
16	NC_007973	CACC	2	8	651	658	25 %	0 %	0 %	75 %	94308946
17	NC_007973	CGC	2	6	768	773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308946
18	NC_007973	GCCG	2	8	784	791	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
19	NC_007973	GCA	3	9	796	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
20	NC_007973	CG	3	6	886	891	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
21	NC_007973	CAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308946
22	NC_007973	CGG	2	6	952	957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308946
23	NC_007973	CG	5	10	1020	1029	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
24	NC_007973	GTG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308946
25	NC_007973	CGA	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
26	NC_007973	CTG	3	9	1130	1138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308946
27	NC_007973	GAT	2	6	1142	1147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308946
28	NC_007973	TTC	2	6	1154	1159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308946
29	NC_007973	CGCA	2	8	1172	1179	25 %	0 %	25 %	50 %	94308946
30	NC_007973	GAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308946
31	NC_007973	TTC	2	6	1187	1192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308946
32	NC_007973	ATC	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308946
33	NC_007973	CGA	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
34	NC_007973	GCC	2	6	1324	1329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308946
35	NC_007973	TGA	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308946
36	NC_007973	GCC	3	9	1367	1375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308946
37	NC_007973	CTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308946
38	NC_007973	GC	3	6	1452	1457	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
39	NC_007973	CGAT	2	8	1503	1510	25 %	25 %	25 %	25 %	94308946
40	NC_007973	CTG	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308946
41	NC_007973	AGA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308946
42	NC_007973	ACA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308946
43	NC_007973	AAG	2	6	1628	1633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308946
44	NC_007973	CG	3	6	1648	1653	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
45	NC_007973	AGA	2	6	1695	1700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308946
46	NC_007973	GTT	2	6	1720	1725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94308946
47	NC_007973	CGG	2	6	1726	1731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308946
48	NC_007973	CAC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308946
49	NC_007973	AC	3	6	1843	1848	50 %	0 %	0 %	50 %	94308946
50	NC_007973	CTG	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
51	NC_007973	GCC	2	6	2290	2295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308947
52	NC_007973	CTG	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
53	NC_007973	TCCT	2	8	2349	2356	0 %	50 %	0 %	50 %	94308947
54	NC_007973	CGAC	2	8	2359	2366	25 %	0 %	25 %	50 %	94308947
55	NC_007973	ACC	2	6	2424	2429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308947
56	NC_007973	CG	3	6	2435	2440	0 %	0 %	50 %	50 %	94308947
57	NC_007973	GCT	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
58	NC_007973	GC	3	6	2459	2464	0 %	0 %	50 %	50 %	94308947
59	NC_007973	GAA	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308947
60	NC_007973	GCC	2	6	2583	2588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308947
61	NC_007973	AGA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308947
62	NC_007973	CTG	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
63	NC_007973	GCA	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308947
64	NC_007973	TAC	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308947
65	NC_007973	TGC	2	6	2695	2700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
66	NC_007973	TGG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308947
67	NC_007973	AAG	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308947
68	NC_007973	CGAC	2	8	2734	2741	25 %	0 %	25 %	50 %	94308947
69	NC_007973	GCG	2	6	2761	2766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308947
70	NC_007973	ATC	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308947
71	NC_007973	CTG	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
72	NC_007973	GAT	2	6	2865	2870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308947
73	NC_007973	GCC	2	6	2889	2894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308947
74	NC_007973	TGG	2	6	2941	2946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308947
75	NC_007973	TGCAAC	2	12	3016	3027	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94308947
76	NC_007973	GCGT	2	8	3073	3080	0 %	25 %	50 %	25 %	94308947
77	NC_007973	CCA	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308947
78	NC_007973	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94308947
79	NC_007973	GCAGGT	2	12	3236	3247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	94308947
80	NC_007973	GC	3	6	3271	3276	0 %	0 %	50 %	50 %	94308947
81	NC_007973	GAC	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308947
82	NC_007973	GTC	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
83	NC_007973	CAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
84	NC_007973	GCA	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
85	NC_007973	CAC	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308948
86	NC_007973	TCGA	2	8	3683	3690	25 %	25 %	25 %	25 %	94308948
87	NC_007973	CTCGAT	2	12	3745	3756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94308948
88	NC_007973	CCG	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
89	NC_007973	CGA	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
90	NC_007973	AGCGC	2	10	3816	3825	20 %	0 %	40 %	40 %	94308948
91	NC_007973	CGG	2	6	3856	3861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308948
92	NC_007973	GGC	2	6	3893	3898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308948
93	NC_007973	GGCGTG	2	12	3905	3916	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	94308948
94	NC_007973	CGAC	2	8	4083	4090	25 %	0 %	25 %	50 %	94308948
95	NC_007973	CGA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
96	NC_007973	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308948
97	NC_007973	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308948
98	NC_007973	TCG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
99	NC_007973	AAC	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308948
100	NC_007973	CGG	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308948
101	NC_007973	GC	3	6	4459	4464	0 %	0 %	50 %	50 %	94308948
102	NC_007973	TCA	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
103	NC_007973	GAA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308948
104	NC_007973	AAG	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308948
105	NC_007973	CGA	2	6	4540	4545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
106	NC_007973	GGCCT	2	10	4556	4565	0 %	20 %	40 %	40 %	94308948
107	NC_007973	TCC	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94308948
108	NC_007973	GCCT	2	8	4641	4648	0 %	25 %	25 %	50 %	94308948
109	NC_007973	TCG	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
110	NC_007973	CTG	2	6	4685	4690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
111	NC_007973	ACG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
112	NC_007973	ATC	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
113	NC_007973	TCG	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
114	NC_007973	GCCCGC	2	12	4739	4750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
115	NC_007973	CG	3	6	4756	4761	0 %	0 %	50 %	50 %	94308948
116	NC_007973	CGC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
117	NC_007973	TCG	2	6	4869	4874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
118	NC_007973	GGC	2	6	4889	4894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308948
119	NC_007973	CG	4	8	4967	4974	0 %	0 %	50 %	50 %	94308948
120	NC_007973	AGG	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94308948
121	NC_007973	ACC	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308948
122	NC_007973	CAT	4	12	5080	5091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
123	NC_007973	CTG	3	9	5129	5137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
124	NC_007973	TTC	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308948
125	NC_007973	CAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
126	NC_007973	GCC	2	6	5197	5202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
127	NC_007973	GAC	2	6	5246	5251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
128	NC_007973	GCC	2	6	5304	5309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
129	NC_007973	GCC	2	6	5385	5390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
130	NC_007973	TCG	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
131	NC_007973	CG	3	6	5420	5425	0 %	0 %	50 %	50 %	94308948
132	NC_007973	CTCGAC	2	12	5444	5455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	94308948
133	NC_007973	CGC	3	9	5458	5466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
134	NC_007973	GCT	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
135	NC_007973	ACG	3	9	5544	5552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
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264	NC_007973	GAA	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308953
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