MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 3262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	ATCCCT	2	12	26	37	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	94152465
2	NC_007971	TGC	2	6	75	80	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
3	NC_007971	ATC	2	6	115	120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
4	NC_007971	GTCG	2	8	162	169	0 %	25 %	50 %	25 %	94152465
5	NC_007971	ACT	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
6	NC_007971	CG	3	6	207	212	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
7	NC_007971	GA	3	6	221	226	50 %	0 %	50 %	0 %	94152465
8	NC_007971	ACC	3	9	298	306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152465
9	NC_007971	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152465
10	NC_007971	CGG	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152465
11	NC_007971	GTC	2	6	526	531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
12	NC_007971	AAG	2	6	532	537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152465
13	NC_007971	CTCTG	2	10	597	606	0 %	40 %	20 %	40 %	94152465
14	NC_007971	TTC	2	6	643	648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152465
15	NC_007971	ATC	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
16	NC_007971	GCT	2	6	732	737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
17	NC_007971	TGG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152465
18	NC_007971	CG	3	6	908	913	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
19	NC_007971	TCA	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
20	NC_007971	GGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152465
21	NC_007971	GAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152465
22	NC_007971	CG	3	6	1089	1094	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
23	NC_007971	GCA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
24	NC_007971	GCC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
25	NC_007971	C	7	7	1294	1300	0 %	0 %	0 %	100 %	94152464
26	NC_007971	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
27	NC_007971	C	8	8	1398	1405	0 %	0 %	0 %	100 %	94152464
28	NC_007971	CAG	2	6	1434	1439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
29	NC_007971	AT	3	6	1640	1645	50 %	50 %	0 %	0 %	94152464
30	NC_007971	GAAG	2	8	1673	1680	50 %	0 %	50 %	0 %	94152464
31	NC_007971	GT	3	6	1802	1807	0 %	50 %	50 %	0 %	94152464
32	NC_007971	TCG	2	6	1924	1929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
33	NC_007971	GTT	2	6	1971	1976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152464
34	NC_007971	CGC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
35	NC_007971	GCT	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
36	NC_007971	GCA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
37	NC_007971	GCC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
38	NC_007971	CGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152463
39	NC_007971	GC	3	6	3025	3030	0 %	0 %	50 %	50 %	94152463
40	NC_007971	AACG	2	8	3143	3150	50 %	0 %	25 %	25 %	94152463
41	NC_007971	GCCG	2	8	3156	3163	0 %	0 %	50 %	50 %	94152463
42	NC_007971	GAG	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152463
43	NC_007971	ATC	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152463
44	NC_007971	CAG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152463
45	NC_007971	GCC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
46	NC_007971	GCC	2	6	3596	3601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
47	NC_007971	TCGT	2	8	3654	3661	0 %	50 %	25 %	25 %	94152462
48	NC_007971	CGTC	2	8	3662	3669	0 %	25 %	25 %	50 %	94152462
49	NC_007971	CTT	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152462
50	NC_007971	GC	3	6	3717	3722	0 %	0 %	50 %	50 %	94152462
51	NC_007971	CGC	2	6	3786	3791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
52	NC_007971	TAGG	2	8	3840	3847	25 %	25 %	50 %	0 %	94152462
53	NC_007971	CGC	2	6	3900	3905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
54	NC_007971	TGA	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152462
55	NC_007971	GAATC	2	10	4068	4077	40 %	20 %	20 %	20 %	94152462
56	NC_007971	TTCGT	2	10	4108	4117	0 %	60 %	20 %	20 %	94152462
57	NC_007971	AACC	2	8	4170	4177	50 %	0 %	0 %	50 %	94152462
58	NC_007971	GTGA	2	8	4198	4205	25 %	25 %	50 %	0 %	94152462
59	NC_007971	GATA	2	8	4342	4349	50 %	25 %	25 %	0 %	94152462
60	NC_007971	ATC	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152462
61	NC_007971	TCG	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152462
62	NC_007971	CGCC	2	8	4411	4418	0 %	0 %	25 %	75 %	94152462
63	NC_007971	AAG	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152462
64	NC_007971	CGC	3	9	4466	4474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
65	NC_007971	CTT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152462
66	NC_007971	GTT	2	6	4545	4550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152462
67	NC_007971	CG	3	6	4718	4723	0 %	0 %	50 %	50 %	94152462
68	NC_007971	CTC	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152462
69	NC_007971	GCT	2	6	4790	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152462
70	NC_007971	T	6	6	4804	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	94152462
71	NC_007971	TGGA	2	8	6841	6848	25 %	25 %	50 %	0 %	94152461
72	NC_007971	CGA	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152461
73	NC_007971	AGA	3	9	6866	6874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152461
74	NC_007971	CGG	2	6	6945	6950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152461
75	NC_007971	GA	3	6	7034	7039	50 %	0 %	50 %	0 %	94152461
76	NC_007971	AGG	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152461
77	NC_007971	AGT	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152461
78	NC_007971	GAA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152461
79	NC_007971	GC	4	8	7134	7141	0 %	0 %	50 %	50 %	94152461
80	NC_007971	GCC	2	6	7153	7158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152461
81	NC_007971	C	6	6	7174	7179	0 %	0 %	0 %	100 %	94152461
82	NC_007971	AGC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152461
83	NC_007971	CAA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152460
84	NC_007971	CTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
85	NC_007971	CCT	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
86	NC_007971	AATCTC	2	12	7841	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152460
87	NC_007971	GGC	2	6	7866	7871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
88	NC_007971	CGCT	2	8	8015	8022	0 %	25 %	25 %	50 %	94152460
89	NC_007971	CCG	2	6	8101	8106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152460
90	NC_007971	CGGC	2	8	8233	8240	0 %	0 %	50 %	50 %	94152460
91	NC_007971	TCC	2	6	8272	8277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
92	NC_007971	TCG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
93	NC_007971	CAG	2	6	8460	8465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
94	NC_007971	CTCC	2	8	8478	8485	0 %	25 %	0 %	75 %	94152460
95	NC_007971	GCGG	2	8	8514	8521	0 %	0 %	75 %	25 %	94152460
96	NC_007971	GGGC	2	8	8551	8558	0 %	0 %	75 %	25 %	94152460
97	NC_007971	GA	3	6	8664	8669	50 %	0 %	50 %	0 %	94152460
98	NC_007971	GTT	2	6	8688	8693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152460
99	NC_007971	GGC	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
100	NC_007971	TCGA	2	8	8755	8762	25 %	25 %	25 %	25 %	94152460
101	NC_007971	CTC	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
102	NC_007971	TGA	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152460
103	NC_007971	GGC	2	6	8864	8869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
104	NC_007971	CTT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152460
105	NC_007971	GA	3	6	9028	9033	50 %	0 %	50 %	0 %	94152460
106	NC_007971	AAG	2	6	9114	9119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152460
107	NC_007971	CGT	2	6	9217	9222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
108	NC_007971	GTCT	2	8	9261	9268	0 %	50 %	25 %	25 %	94152460
109	NC_007971	TCG	2	6	9283	9288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
110	NC_007971	CAG	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
111	NC_007971	CTCG	2	8	9336	9343	0 %	25 %	25 %	50 %	94152460
112	NC_007971	CGA	2	6	9386	9391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
113	NC_007971	GTGC	2	8	9392	9399	0 %	25 %	50 %	25 %	94152460
114	NC_007971	CGA	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
115	NC_007971	GCCTTC	2	12	9756	9767	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	94152460
116	NC_007971	CCG	2	6	9772	9777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152460
117	NC_007971	ACG	2	6	9948	9953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
118	NC_007971	GCGA	2	8	11403	11410	25 %	0 %	50 %	25 %	94152458
119	NC_007971	GCA	2	6	11411	11416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152458
120	NC_007971	TTGCA	2	10	11425	11434	20 %	40 %	20 %	20 %	94152458
121	NC_007971	GAG	2	6	11478	11483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152458
122	NC_007971	TGC	2	6	11545	11550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152458
123	NC_007971	AGGGC	2	10	11552	11561	20 %	0 %	60 %	20 %	94152458
124	NC_007971	GCT	2	6	12368	12373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
125	NC_007971	GGC	2	6	12378	12383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152457
126	NC_007971	CGACT	2	10	12516	12525	20 %	20 %	20 %	40 %	94152457
127	NC_007971	TCG	2	6	12607	12612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
128	NC_007971	GCG	2	6	12625	12630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152457
129	NC_007971	GAG	2	6	12676	12681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152457
130	NC_007971	TGC	2	6	12705	12710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
131	NC_007971	GCG	2	6	12859	12864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152457
132	NC_007971	TCT	2	6	12934	12939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152457
133	NC_007971	GCA	3	9	12976	12984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152457
134	NC_007971	CAC	2	6	13055	13060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152457
135	NC_007971	TCGA	2	8	13075	13082	25 %	25 %	25 %	25 %	94152457
136	NC_007971	TGG	2	6	13199	13204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152457
137	NC_007971	GAA	2	6	13206	13211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152457
138	NC_007971	ACT	2	6	13219	13224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152457
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141	NC_007971	CGAT	2	8	13330	13337	25 %	25 %	25 %	25 %	94152457
142	NC_007971	GTG	2	6	13441	13446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152457
143	NC_007971	GAAT	2	8	13478	13485	50 %	25 %	25 %	0 %	94152457
144	NC_007971	CTT	2	6	13493	13498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152457
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160	NC_007971	CATT	2	8	14840	14847	25 %	50 %	0 %	25 %	94152454
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250	NC_007971	CTC	2	6	21920	21925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152445
251	NC_007971	GGTTG	2	10	21939	21948	0 %	40 %	60 %	0 %	94152445
252	NC_007971	GCG	3	9	21956	21964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152445
253	NC_007971	TCG	3	9	22005	22013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152445
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257	NC_007971	CATA	2	8	22328	22335	50 %	25 %	0 %	25 %	94152445
258	NC_007971	TTG	2	6	22436	22441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152445
259	NC_007971	TGT	2	6	22450	22455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152445
260	NC_007971	CAA	2	6	22495	22500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152445
261	NC_007971	GAGG	2	8	22501	22508	25 %	0 %	75 %	0 %	94152445
262	NC_007971	GAA	2	6	22519	22524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152445
263	NC_007971	GTC	2	6	22571	22576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152445
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265	NC_007971	CAG	2	6	22622	22627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152445
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395	NC_007971	CGCACG	2	12	31918	31929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	94152432
396	NC_007971	CG	3	6	31928	31933	0 %	0 %	50 %	50 %	94152432
397	NC_007971	CGG	2	6	31959	31964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152432
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