MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 1467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	TA	3	6	471	476	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
2	NC_004565	A	6	6	488	493	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
3	NC_004565	TGA	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373132
4	NC_004565	AT	3	6	587	592	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
5	NC_004565	ATA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
6	NC_004565	CAT	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373132
7	NC_004565	AT	4	8	694	701	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
8	NC_004565	AAG	2	6	731	736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
9	NC_004565	AAATT	2	10	753	762	60 %	40 %	0 %	0 %	28373132
10	NC_004565	TAGATT	2	12	772	783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28373132
11	NC_004565	ACT	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373132
12	NC_004565	AT	3	6	909	914	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
13	NC_004565	TAAA	2	8	979	986	75 %	25 %	0 %	0 %	28373132
14	NC_004565	A	6	6	1009	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
15	NC_004565	GCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28373132
16	NC_004565	TTA	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373132
17	NC_004565	ATA	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
18	NC_004565	TA	3	6	1219	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
19	NC_004565	AG	3	6	1323	1328	50 %	0 %	50 %	0 %	28373132
20	NC_004565	T	6	6	1337	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	28373132
21	NC_004565	TAA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
22	NC_004565	TAG	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373132
23	NC_004565	TAA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
24	NC_004565	TTA	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373132
25	NC_004565	AGA	2	6	1574	1579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
26	NC_004565	ATA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
27	NC_004565	AAG	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
28	NC_004565	GAAT	2	8	1673	1680	50 %	25 %	25 %	0 %	28373132
29	NC_004565	GAAG	2	8	1706	1713	50 %	0 %	50 %	0 %	28373132
30	NC_004565	AG	3	6	1722	1727	50 %	0 %	50 %	0 %	28373132
31	NC_004565	TA	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
32	NC_004565	AAGA	2	8	1802	1809	75 %	0 %	25 %	0 %	28373132
33	NC_004565	TAAA	2	8	1813	1820	75 %	25 %	0 %	0 %	28373132
34	NC_004565	A	6	6	1818	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
35	NC_004565	AT	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	28373133
36	NC_004565	ACA	2	6	2925	2930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373133
37	NC_004565	AGG	2	6	2942	2947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28373133
38	NC_004565	AGGAAC	2	12	2987	2998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28373133
39	NC_004565	ATA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373133
40	NC_004565	TA	3	6	3058	3063	50 %	50 %	0 %	0 %	28373133
41	NC_004565	TCC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28373133
42	NC_004565	T	6	6	3191	3196	0 %	100 %	0 %	0 %	28373133
43	NC_004565	ATTTG	2	10	3447	3456	20 %	60 %	20 %	0 %	28373134
44	NC_004565	T	8	8	3487	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	28373134
45	NC_004565	T	6	6	3518	3523	0 %	100 %	0 %	0 %	28373134
46	NC_004565	CAT	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373134
47	NC_004565	TAAT	2	8	3603	3610	50 %	50 %	0 %	0 %	28373134
48	NC_004565	AAG	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373135
49	NC_004565	T	8	8	3681	3688	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
50	NC_004565	T	6	6	3719	3724	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
51	NC_004565	TCT	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373135
52	NC_004565	T	7	7	3780	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
53	NC_004565	TCT	2	6	3792	3797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373135
54	NC_004565	GAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373135
55	NC_004565	AAAC	2	8	4879	4886	75 %	0 %	0 %	25 %	28373136
56	NC_004565	AT	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	28373136
57	NC_004565	TAG	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373136
58	NC_004565	AATT	2	8	4988	4995	50 %	50 %	0 %	0 %	28373136
59	NC_004565	AGT	2	6	5017	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373136
60	NC_004565	AT	3	6	5027	5032	50 %	50 %	0 %	0 %	28373136
61	NC_004565	GAA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373136
62	NC_004565	TAAATA	2	12	5048	5059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373136
63	NC_004565	AGA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373136
64	NC_004565	AAAAT	2	10	5078	5087	80 %	20 %	0 %	0 %	28373136
65	NC_004565	TAA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373136
66	NC_004565	TAT	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373136
67	NC_004565	AAT	2	6	5219	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373136
68	NC_004565	AATTT	2	10	5323	5332	40 %	60 %	0 %	0 %	28373137
69	NC_004565	AT	3	6	5361	5366	50 %	50 %	0 %	0 %	28373137
70	NC_004565	GTT	2	6	5376	5381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373137
71	NC_004565	AT	3	6	5392	5397	50 %	50 %	0 %	0 %	28373137
72	NC_004565	A	7	7	5423	5429	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
73	NC_004565	ATT	2	6	5438	5443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373137
74	NC_004565	TGG	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373137
75	NC_004565	TTA	2	6	5461	5466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373137
76	NC_004565	TATTT	2	10	5474	5483	20 %	80 %	0 %	0 %	28373137
77	NC_004565	A	8	8	5492	5499	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
78	NC_004565	AAT	2	6	5504	5509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
79	NC_004565	ATA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
80	NC_004565	A	7	7	5537	5543	100 %	0 %	0 %	0 %	28373137
81	NC_004565	AGATA	2	10	5558	5567	60 %	20 %	20 %	0 %	28373137
82	NC_004565	GAA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373137
83	NC_004565	AAT	2	6	5592	5597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
84	NC_004565	ATA	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
85	NC_004565	AT	3	6	5661	5666	50 %	50 %	0 %	0 %	28373137
86	NC_004565	ATA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
87	NC_004565	TAAA	2	8	5736	5743	75 %	25 %	0 %	0 %	28373137
88	NC_004565	ATT	2	6	6539	6544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373138
89	NC_004565	AT	3	6	6554	6559	50 %	50 %	0 %	0 %	28373138
90	NC_004565	ATATT	2	10	6568	6577	40 %	60 %	0 %	0 %	28373138
91	NC_004565	A	6	6	6595	6600	100 %	0 %	0 %	0 %	28373138
92	NC_004565	TA	4	8	6601	6608	50 %	50 %	0 %	0 %	28373138
93	NC_004565	T	7	7	6609	6615	0 %	100 %	0 %	0 %	28373138
94	NC_004565	AAG	2	6	6635	6640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
95	NC_004565	A	7	7	6642	6648	100 %	0 %	0 %	0 %	28373138
96	NC_004565	GGAA	2	8	6691	6698	50 %	0 %	50 %	0 %	28373138
97	NC_004565	TAA	2	6	6725	6730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
98	NC_004565	TTC	2	6	6761	6766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373138
99	NC_004565	AGA	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
100	NC_004565	TAA	2	6	6814	6819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
101	NC_004565	AGA	2	6	6827	6832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
102	NC_004565	AAT	2	6	6846	6851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
103	NC_004565	TGT	2	6	7944	7949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373139
104	NC_004565	AT	4	8	7994	8001	50 %	50 %	0 %	0 %	28373139
105	NC_004565	ACAA	2	8	8035	8042	75 %	0 %	0 %	25 %	28373139
106	NC_004565	TAA	2	6	8064	8069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373139
107	NC_004565	T	8	8	8087	8094	0 %	100 %	0 %	0 %	28373139
108	NC_004565	TGG	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373139
109	NC_004565	T	6	6	8147	8152	0 %	100 %	0 %	0 %	28373139
110	NC_004565	ACCA	2	8	8159	8166	50 %	0 %	0 %	50 %	28373139
111	NC_004565	TGTA	2	8	8201	8208	25 %	50 %	25 %	0 %	28373139
112	NC_004565	GAAA	3	12	8231	8242	75 %	0 %	25 %	0 %	28373139
113	NC_004565	TAT	2	6	8467	8472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373140
114	NC_004565	AT	3	6	8471	8476	50 %	50 %	0 %	0 %	28373140
115	NC_004565	T	6	6	8478	8483	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
116	NC_004565	T	6	6	8500	8505	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
117	NC_004565	TAG	2	6	8549	8554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373140
118	NC_004565	TA	3	6	8586	8591	50 %	50 %	0 %	0 %	28373140
119	NC_004565	TAT	2	6	8601	8606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373140
120	NC_004565	AGA	2	6	8619	8624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373140
121	NC_004565	TCT	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373140
122	NC_004565	TTTA	2	8	8709	8716	25 %	75 %	0 %	0 %	28373140
123	NC_004565	ATG	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373140
124	NC_004565	ATT	2	6	8778	8783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373140
125	NC_004565	TTG	2	6	8836	8841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373140
126	NC_004565	CTT	2	6	8918	8923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373140
127	NC_004565	TAT	2	6	8949	8954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373140
128	NC_004565	T	6	6	8954	8959	0 %	100 %	0 %	0 %	28373140
129	NC_004565	ACC	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28373141
130	NC_004565	TAG	2	6	9077	9082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373141
131	NC_004565	ATT	2	6	9088	9093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373141
132	NC_004565	T	6	6	9092	9097	0 %	100 %	0 %	0 %	28373141
133	NC_004565	ATA	2	6	9130	9135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373141
134	NC_004565	TA	3	6	9183	9188	50 %	50 %	0 %	0 %	28373141
135	NC_004565	T	6	6	9193	9198	0 %	100 %	0 %	0 %	28373141
136	NC_004565	AATA	2	8	9199	9206	75 %	25 %	0 %	0 %	28373141
137	NC_004565	TCT	2	6	9209	9214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373141
138	NC_004565	A	6	6	9233	9238	100 %	0 %	0 %	0 %	28373141
139	NC_004565	TTCAT	2	10	9242	9251	20 %	60 %	0 %	20 %	28373141
140	NC_004565	AATT	2	8	9261	9268	50 %	50 %	0 %	0 %	28373141
141	NC_004565	TAT	2	6	9273	9278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373141
142	NC_004565	ATAATT	2	12	9319	9330	50 %	50 %	0 %	0 %	28373141
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