MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_004552	ATCG	2	8	1060027	1060034	25 %	25 %	25 %	25 %	62185505
19003	NC_004552	AAC	2	6	1060061	1060066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185505
19004	NC_004552	TCT	2	6	1060067	1060072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185505
19005	NC_004552	AGA	2	6	1060206	1060211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185505
19006	NC_004552	TAGAT	2	10	1060239	1060248	40 %	40 %	20 %	0 %	62185505
19007	NC_004552	TCGG	2	8	1060250	1060257	0 %	25 %	50 %	25 %	62185505
19008	NC_004552	AT	3	6	1060260	1060265	50 %	50 %	0 %	0 %	62185505
19009	NC_004552	ATGA	2	8	1060521	1060528	50 %	25 %	25 %	0 %	62185506
19010	NC_004552	T	6	6	1060531	1060536	0 %	100 %	0 %	0 %	62185506
19011	NC_004552	A	6	6	1060573	1060578	100 %	0 %	0 %	0 %	62185506
19012	NC_004552	A	6	6	1060631	1060636	100 %	0 %	0 %	0 %	62185506
19013	NC_004552	AGA	2	6	1060641	1060646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185506
19014	NC_004552	CAA	2	6	1060667	1060672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185506
19015	NC_004552	AAG	2	6	1060673	1060678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185506
19016	NC_004552	AAG	2	6	1060721	1060726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185506
19017	NC_004552	TAA	2	6	1060785	1060790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185506
19018	NC_004552	AAG	2	6	1060796	1060801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185506
19019	NC_004552	ATCC	2	8	1060858	1060865	25 %	25 %	0 %	50 %	62185506
19020	NC_004552	TAT	2	6	1060881	1060886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185506
19021	NC_004552	ACTC	2	8	1060905	1060912	25 %	25 %	0 %	50 %	62185506
19022	NC_004552	ATC	3	9	1060924	1060932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185506
19023	NC_004552	TTG	2	6	1060958	1060963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185506
19024	NC_004552	A	7	7	1060984	1060990	100 %	0 %	0 %	0 %	62185506
19025	NC_004552	ATT	2	6	1061014	1061019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185506
19026	NC_004552	AGG	2	6	1061043	1061048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185506
19027	NC_004552	GCT	2	6	1061104	1061109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185506
19028	NC_004552	CTA	2	6	1061126	1061131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185506
19029	NC_004552	ACA	2	6	1061139	1061144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185506
19030	NC_004552	CAAG	2	8	1061169	1061176	50 %	0 %	25 %	25 %	62185506
19031	NC_004552	CAT	2	6	1061192	1061197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185507
19032	NC_004552	GTG	2	6	1061246	1061251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185507
19033	NC_004552	TCG	2	6	1061286	1061291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185507
19034	NC_004552	A	8	8	1061348	1061355	100 %	0 %	0 %	0 %	62185507
19035	NC_004552	TTC	2	6	1061401	1061406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185507
19036	NC_004552	GAAG	2	8	1061424	1061431	50 %	0 %	50 %	0 %	62185507
19037	NC_004552	ACT	2	6	1061457	1061462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185507
19038	NC_004552	TGA	2	6	1061503	1061508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185507
19039	NC_004552	TGC	2	6	1061509	1061514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185507
19040	NC_004552	CAT	2	6	1061518	1061523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185507
19041	NC_004552	ATT	2	6	1061532	1061537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185507
19042	NC_004552	ACA	2	6	1061573	1061578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185507
19043	NC_004552	TTCT	2	8	1061617	1061624	0 %	75 %	0 %	25 %	62185507
19044	NC_004552	GAAA	2	8	1061672	1061679	75 %	0 %	25 %	0 %	62185507
19045	NC_004552	CAG	2	6	1061713	1061718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185507
19046	NC_004552	A	6	6	1061830	1061835	100 %	0 %	0 %	0 %	62185507
19047	NC_004552	TAT	2	6	1061900	1061905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185507
19048	NC_004552	TACC	2	8	1061946	1061953	25 %	25 %	0 %	50 %	62185507
19049	NC_004552	ATG	3	9	1062003	1062011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185507
19050	NC_004552	CTT	2	6	1062048	1062053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185507
19051	NC_004552	TGG	2	6	1062061	1062066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185507
19052	NC_004552	TTA	2	6	1062078	1062083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185507
19053	NC_004552	CGC	2	6	1062134	1062139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62185508
19054	NC_004552	GTT	2	6	1062179	1062184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185508
19055	NC_004552	AGC	2	6	1062257	1062262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185508
19056	NC_004552	AACA	2	8	1062277	1062284	75 %	0 %	0 %	25 %	62185508
19057	NC_004552	TGA	2	6	1062325	1062330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185508
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19059	NC_004552	TCT	2	6	1062505	1062510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185509
19060	NC_004552	TGC	2	6	1062511	1062516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185509
19061	NC_004552	G	6	6	1062561	1062566	0 %	0 %	100 %	0 %	62185509
19062	NC_004552	ATT	2	6	1062569	1062574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185509
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19065	NC_004552	TGA	3	9	1062665	1062673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185509
19066	NC_004552	TTCT	2	8	1062730	1062737	0 %	75 %	0 %	25 %	62185509
19067	NC_004552	TGC	2	6	1062749	1062754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185509
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19071	NC_004552	GGT	2	6	1062894	1062899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185509
19072	NC_004552	GAT	2	6	1062971	1062976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185509
19073	NC_004552	TTAA	2	8	1063005	1063012	50 %	50 %	0 %	0 %	62185509
19074	NC_004552	ATT	2	6	1063098	1063103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185509
19075	NC_004552	CTTG	2	8	1063182	1063189	0 %	50 %	25 %	25 %	62185509
19076	NC_004552	CAAA	2	8	1063202	1063209	75 %	0 %	0 %	25 %	62185509
19077	NC_004552	ACT	2	6	1063213	1063218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185509
19078	NC_004552	CAT	2	6	1063247	1063252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185509
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19083	NC_004552	CG	3	6	1063559	1063564	0 %	0 %	50 %	50 %	62185510
19084	NC_004552	CAC	2	6	1063586	1063591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62185510
19085	NC_004552	AAT	2	6	1063605	1063610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185510
19086	NC_004552	TAA	2	6	1063636	1063641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185510
19087	NC_004552	TGA	2	6	1063683	1063688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185510
19088	NC_004552	TTC	2	6	1063705	1063710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185510
19089	NC_004552	GAC	2	6	1063770	1063775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185510
19090	NC_004552	GAA	2	6	1063782	1063787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185510
19091	NC_004552	TTA	2	6	1063915	1063920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185511
19092	NC_004552	AGC	2	6	1063931	1063936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185511
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19094	NC_004552	AGA	2	6	1064053	1064058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185511
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19098	NC_004552	GAA	2	6	1064300	1064305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185511
19099	NC_004552	CAG	2	6	1064310	1064315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185511
19100	NC_004552	GCA	2	6	1064339	1064344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185511
19101	NC_004552	T	6	6	1064409	1064414	0 %	100 %	0 %	0 %	62185511
19102	NC_004552	C	6	6	1064415	1064420	0 %	0 %	0 %	100 %	62185511
19103	NC_004552	T	6	6	1064436	1064441	0 %	100 %	0 %	0 %	62185511
19104	NC_004552	CAA	2	6	1064514	1064519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185511
19105	NC_004552	GTT	2	6	1064604	1064609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185511
19106	NC_004552	T	6	6	1064652	1064657	0 %	100 %	0 %	0 %	62185511
19107	NC_004552	T	6	6	1064680	1064685	0 %	100 %	0 %	0 %	62185511
19108	NC_004552	GAA	2	6	1064689	1064694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185511
19109	NC_004552	T	7	7	1064732	1064738	0 %	100 %	0 %	0 %	62185511
19110	NC_004552	AAG	2	6	1064873	1064878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185511
19111	NC_004552	GATG	2	8	1064974	1064981	25 %	25 %	50 %	0 %	62185512
19112	NC_004552	TCC	2	6	1065022	1065027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185512
19113	NC_004552	AG	3	6	1065144	1065149	50 %	0 %	50 %	0 %	62185512
19114	NC_004552	TCT	2	6	1065228	1065233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185512
19115	NC_004552	AGGA	2	8	1065411	1065418	50 %	0 %	50 %	0 %	62185512
19116	NC_004552	T	6	6	1065428	1065433	0 %	100 %	0 %	0 %	62185512
19117	NC_004552	A	6	6	1065434	1065439	100 %	0 %	0 %	0 %	62185512
19118	NC_004552	TGT	2	6	1065475	1065480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185513
19119	NC_004552	ACA	2	6	1065509	1065514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185513
19120	NC_004552	CCCTT	2	10	1065599	1065608	0 %	40 %	0 %	60 %	62185513
19121	NC_004552	ACA	2	6	1065620	1065625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185513
19122	NC_004552	A	7	7	1065700	1065706	100 %	0 %	0 %	0 %	62185513
19123	NC_004552	AAT	2	6	1065708	1065713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185513
19124	NC_004552	CAT	2	6	1065744	1065749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185513
19125	NC_004552	CTT	2	6	1065859	1065864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185513
19126	NC_004552	TCA	2	6	1065940	1065945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185514
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19129	NC_004552	T	6	6	1065999	1066004	0 %	100 %	0 %	0 %	62185514
19130	NC_004552	CTT	2	6	1066007	1066012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185514
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19133	NC_004552	CAT	2	6	1066092	1066097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185514
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19136	NC_004552	CAT	2	6	1066218	1066223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185514
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19138	NC_004552	GTTTTT	2	12	1066250	1066261	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	62185514
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19140	NC_004552	CTGG	2	8	1066370	1066377	0 %	25 %	50 %	25 %	62185515
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19143	NC_004552	CCA	2	6	1066481	1066486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62185515
19144	NC_004552	GTA	2	6	1066586	1066591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185515
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19146	NC_004552	A	7	7	1066701	1066707	100 %	0 %	0 %	0 %	62185515
19147	NC_004552	TTC	2	6	1066708	1066713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185515
19148	NC_004552	T	6	6	1066749	1066754	0 %	100 %	0 %	0 %	62185515
19149	NC_004552	ATG	2	6	1066780	1066785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185515
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19152	NC_004552	GT	3	6	1066871	1066876	0 %	50 %	50 %	0 %	62185515
19153	NC_004552	GCT	2	6	1066984	1066989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185515
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19156	NC_004552	TCC	3	9	1067145	1067153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185515
19157	NC_004552	GAA	2	6	1067258	1067263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185515
19158	NC_004552	T	6	6	1067299	1067304	0 %	100 %	0 %	0 %	62185515
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19167	NC_004552	TGT	2	6	1067543	1067548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185516
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19221	NC_004552	CTT	2	6	1070155	1070160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185517
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19225	NC_004552	TCT	2	6	1070292	1070297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185517
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19228	NC_004552	CAG	2	6	1070408	1070413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185517
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19230	NC_004552	G	7	7	1070567	1070573	0 %	0 %	100 %	0 %	62185517
19231	NC_004552	TCCT	2	8	1070586	1070593	0 %	50 %	0 %	50 %	62185517
19232	NC_004552	AGA	2	6	1070594	1070599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185517
19233	NC_004552	ATGCCA	2	12	1070673	1070684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	62185517
19234	NC_004552	GA	3	6	1070689	1070694	50 %	0 %	50 %	0 %	62185517
19235	NC_004552	CTT	2	6	1070722	1070727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185517
19236	NC_004552	GAA	2	6	1070751	1070756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185517
19237	NC_004552	TCG	2	6	1070865	1070870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185517
19238	NC_004552	T	6	6	1070931	1070936	0 %	100 %	0 %	0 %	62185517
19239	NC_004552	GCG	2	6	1071003	1071008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62185517
19240	NC_004552	CTT	2	6	1071010	1071015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185517
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19356	NC_004552	ACAA	2	8	1076509	1076516	75 %	0 %	0 %	25 %	62185522
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19358	NC_004552	GAT	2	6	1076621	1076626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185522
19359	NC_004552	GGC	2	6	1076627	1076632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62185522
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19476	NC_004552	A	7	7	1082573	1082579	100 %	0 %	0 %	0 %	62185526
19477	NC_004552	ATGAC	2	10	1082685	1082694	40 %	20 %	20 %	20 %	62185526
19478	NC_004552	GAA	2	6	1082723	1082728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185526
19479	NC_004552	ATGACT	2	12	1083144	1083155	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	62185527
19480	NC_004552	C	8	8	1083171	1083178	0 %	0 %	0 %	100 %	62185527
19481	NC_004552	GCA	2	6	1083212	1083217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185527
19482	NC_004552	TCA	2	6	1083278	1083283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185527
19483	NC_004552	CGC	2	6	1083367	1083372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62185527
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19500	NC_004552	A	6	6	1084265	1084270	100 %	0 %	0 %	0 %	62185528

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