MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_004552	ATTC	2	8	949062	949069	25 %	50 %	0 %	25 %	62185423
17003	NC_004552	CTT	2	6	949074	949079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185423
17004	NC_004552	T	6	6	949098	949103	0 %	100 %	0 %	0 %	62185423
17005	NC_004552	AT	3	6	949121	949126	50 %	50 %	0 %	0 %	62185423
17006	NC_004552	AGG	2	6	949214	949219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185423
17007	NC_004552	AGT	2	6	949269	949274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185423
17008	NC_004552	AT	3	6	949296	949301	50 %	50 %	0 %	0 %	62185423
17009	NC_004552	CTC	2	6	949307	949312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185423
17010	NC_004552	TCCCTA	2	12	949378	949389	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	62185423
17011	NC_004552	CTT	2	6	949406	949411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185423
17012	NC_004552	CAT	2	6	949418	949423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185423
17013	NC_004552	GCCAA	2	10	949459	949468	40 %	0 %	20 %	40 %	62185423
17014	NC_004552	CG	3	6	949512	949517	0 %	0 %	50 %	50 %	62185423
17015	NC_004552	GA	3	6	949667	949672	50 %	0 %	50 %	0 %	62185423
17016	NC_004552	T	6	6	949674	949679	0 %	100 %	0 %	0 %	62185423
17017	NC_004552	TCC	2	6	949725	949730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185423
17018	NC_004552	GAT	2	6	949743	949748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185423
17019	NC_004552	GTAA	2	8	949833	949840	50 %	25 %	25 %	0 %	62185423
17020	NC_004552	TGCT	2	8	949860	949867	0 %	50 %	25 %	25 %	62185423
17021	NC_004552	AAG	2	6	949943	949948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185423
17022	NC_004552	GCAA	2	8	949975	949982	50 %	0 %	25 %	25 %	62185423
17023	NC_004552	AAC	2	6	950022	950027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185423
17024	NC_004552	T	6	6	950052	950057	0 %	100 %	0 %	0 %	62185423
17025	NC_004552	AAG	2	6	950083	950088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185424
17026	NC_004552	TAA	2	6	950104	950109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185424
17027	NC_004552	ATT	2	6	950372	950377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185424
17028	NC_004552	T	6	6	950381	950386	0 %	100 %	0 %	0 %	62185424
17029	NC_004552	TAA	2	6	950414	950419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185424
17030	NC_004552	AAT	2	6	950430	950435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185424
17031	NC_004552	CTG	2	6	951145	951150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185425
17032	NC_004552	TCT	2	6	951206	951211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185425
17033	NC_004552	ACG	2	6	951307	951312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185425
17034	NC_004552	CAG	2	6	951376	951381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185425
17035	NC_004552	TTC	2	6	951385	951390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185425
17036	NC_004552	TCT	2	6	951561	951566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185425
17037	NC_004552	CTT	2	6	951585	951590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185425
17038	NC_004552	CAAA	2	8	951666	951673	75 %	0 %	0 %	25 %	62185425
17039	NC_004552	CAG	2	6	951840	951845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185425
17040	NC_004552	GAC	2	6	951858	951863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185425
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17042	NC_004552	GCC	2	6	951971	951976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62185425
17043	NC_004552	A	10	10	952004	952013	100 %	0 %	0 %	0 %	62185425
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17046	NC_004552	TTCTT	2	10	952111	952120	0 %	80 %	0 %	20 %	62185425
17047	NC_004552	AGA	2	6	952144	952149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185425
17048	NC_004552	CTTT	2	8	952282	952289	0 %	75 %	0 %	25 %	62185425
17049	NC_004552	CTT	2	6	952326	952331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185425
17050	NC_004552	CAA	3	9	952410	952418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185425
17051	NC_004552	GTC	2	6	952452	952457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185425
17052	NC_004552	CTT	2	6	952458	952463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185425
17053	NC_004552	GCC	2	6	952482	952487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62185425
17054	NC_004552	AAT	2	6	952526	952531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185425
17055	NC_004552	GTT	2	6	952582	952587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185425
17056	NC_004552	CTC	2	6	952630	952635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185425
17057	NC_004552	AGC	2	6	952648	952653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185425
17058	NC_004552	ATC	2	6	952708	952713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185425
17059	NC_004552	GAA	2	6	952769	952774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185425
17060	NC_004552	TGT	2	6	952782	952787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185425
17061	NC_004552	ATA	2	6	952799	952804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185425
17062	NC_004552	AGG	2	6	952963	952968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185426
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17064	NC_004552	ATTG	2	8	953058	953065	25 %	50 %	25 %	0 %	62185426
17065	NC_004552	CTTT	2	8	953115	953122	0 %	75 %	0 %	25 %	62185426
17066	NC_004552	AT	4	8	953150	953157	50 %	50 %	0 %	0 %	62185426
17067	NC_004552	CTT	2	6	953178	953183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185426
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17087	NC_004552	TGA	2	6	954079	954084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185427
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17089	NC_004552	GGT	2	6	954285	954290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185427
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17091	NC_004552	GAG	2	6	954544	954549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185427
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17093	NC_004552	AAAAT	2	10	954569	954578	80 %	20 %	0 %	0 %	62185427
17094	NC_004552	GCC	2	6	954584	954589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62185427
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17098	NC_004552	TCC	2	6	954723	954728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185427
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17100	NC_004552	GCA	2	6	955023	955028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185428
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17106	NC_004552	T	6	6	955521	955526	0 %	100 %	0 %	0 %	62185429
17107	NC_004552	AAGC	2	8	955666	955673	50 %	0 %	25 %	25 %	62185429
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17124	NC_004552	GAA	3	9	956211	956219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185430
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17235	NC_004552	AATCCT	2	12	961536	961547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185434
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17238	NC_004552	AACA	2	8	961662	961669	75 %	0 %	0 %	25 %	62185434
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17240	NC_004552	CTT	2	6	961834	961839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185435
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17492	NC_004552	A	6	6	975892	975897	100 %	0 %	0 %	0 %	62185445
17493	NC_004552	ACT	2	6	975924	975929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185445
17494	NC_004552	TGG	2	6	976031	976036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185445
17495	NC_004552	AT	3	6	976054	976059	50 %	50 %	0 %	0 %	62185445
17496	NC_004552	AT	3	6	976096	976101	50 %	50 %	0 %	0 %	62185445
17497	NC_004552	TAAC	2	8	976167	976174	50 %	25 %	0 %	25 %	62185446
17498	NC_004552	TCCT	2	8	976203	976210	0 %	50 %	0 %	50 %	62185446
17499	NC_004552	GCT	2	6	976229	976234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185446
17500	NC_004552	CAC	2	6	976273	976278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62185446

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