MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12101	NC_004552	AGCAA	2	10	681226	681235	60 %	0 %	20 %	20 %	62185210
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12112	NC_004552	ACG	2	6	681828	681833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185211
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12118	NC_004552	GCAAA	2	10	682148	682157	60 %	0 %	20 %	20 %	62185211
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12123	NC_004552	TCC	3	9	682293	682301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185211
12124	NC_004552	ATAA	2	8	682370	682377	75 %	25 %	0 %	0 %	62185211
12125	NC_004552	AGA	2	6	682380	682385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185211
12126	NC_004552	A	6	6	682429	682434	100 %	0 %	0 %	0 %	62185211
12127	NC_004552	CATTT	2	10	682452	682461	20 %	60 %	0 %	20 %	62185211
12128	NC_004552	T	6	6	682459	682464	0 %	100 %	0 %	0 %	62185211
12129	NC_004552	CTT	2	6	682481	682486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185211
12130	NC_004552	TA	3	6	682584	682589	50 %	50 %	0 %	0 %	62185211
12131	NC_004552	AAT	2	6	682613	682618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185211
12132	NC_004552	GAA	2	6	682700	682705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185211
12133	NC_004552	ATC	2	6	682713	682718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185211
12134	NC_004552	T	7	7	682755	682761	0 %	100 %	0 %	0 %	62185211
12135	NC_004552	TCT	2	6	682774	682779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185211
12136	NC_004552	A	6	6	682784	682789	100 %	0 %	0 %	0 %	62185211
12137	NC_004552	TCA	2	6	682840	682845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185211
12138	NC_004552	A	6	6	682860	682865	100 %	0 %	0 %	0 %	62185211
12139	NC_004552	TTG	2	6	682887	682892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185211
12140	NC_004552	TCG	2	6	682979	682984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185211
12141	NC_004552	AACA	2	8	683028	683035	75 %	0 %	0 %	25 %	62185211
12142	NC_004552	CAT	2	6	683061	683066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185211
12143	NC_004552	ACG	2	6	686103	686108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185212
12144	NC_004552	CTCC	2	8	686124	686131	0 %	25 %	0 %	75 %	62185212
12145	NC_004552	GAG	2	6	686159	686164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185212
12146	NC_004552	TCA	2	6	686183	686188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185212
12147	NC_004552	AAC	2	6	686191	686196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185212
12148	NC_004552	TG	3	6	686215	686220	0 %	50 %	50 %	0 %	62185212
12149	NC_004552	GTT	2	6	686259	686264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185212
12150	NC_004552	ACCTT	2	10	686280	686289	20 %	40 %	0 %	40 %	62185212
12151	NC_004552	CTTTG	2	10	686309	686318	0 %	60 %	20 %	20 %	62185212
12152	NC_004552	ATA	2	6	686319	686324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185212
12153	NC_004552	TAC	3	9	686326	686334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185212
12154	NC_004552	TCAAGG	2	12	686362	686373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	62185212
12155	NC_004552	TCC	2	6	686422	686427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185212
12156	NC_004552	GTCTT	2	10	686490	686499	0 %	60 %	20 %	20 %	62185212
12157	NC_004552	CAG	2	6	686517	686522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185212
12158	NC_004552	AAT	2	6	686576	686581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185212
12159	NC_004552	CTC	2	6	686605	686610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185212
12160	NC_004552	ATT	2	6	686671	686676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185212
12161	NC_004552	AAC	2	6	686681	686686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185212
12162	NC_004552	GTG	2	6	686742	686747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185212
12163	NC_004552	ATC	2	6	686798	686803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185212
12164	NC_004552	GTG	2	6	686811	686816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185212
12165	NC_004552	TCT	2	6	686901	686906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185212
12166	NC_004552	TGA	2	6	686932	686937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185212
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12168	NC_004552	A	6	6	686951	686956	100 %	0 %	0 %	0 %	62185212
12169	NC_004552	TCT	2	6	686985	686990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185212
12170	NC_004552	GAA	2	6	687011	687016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185212
12171	NC_004552	CAAC	2	8	687049	687056	50 %	0 %	0 %	50 %	62185212
12172	NC_004552	CAG	2	6	687069	687074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185212
12173	NC_004552	CTT	2	6	687177	687182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185212
12174	NC_004552	CTAA	2	8	687203	687210	50 %	25 %	0 %	25 %	62185212
12175	NC_004552	G	15	15	687235	687249	0 %	0 %	100 %	0 %	62185212
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12177	NC_004552	TAG	2	6	687381	687386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185212
12178	NC_004552	CA	3	6	687409	687414	50 %	0 %	0 %	50 %	62185212
12179	NC_004552	CCT	2	6	687443	687448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185212
12180	NC_004552	CTT	2	6	687688	687693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185212
12181	NC_004552	TGA	2	6	687778	687783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185212
12182	NC_004552	AAC	2	6	687845	687850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185212
12183	NC_004552	TC	3	6	687869	687874	0 %	50 %	0 %	50 %	62185212
12184	NC_004552	TAT	2	6	687875	687880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185212
12185	NC_004552	GAC	2	6	688006	688011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185212
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12193	NC_004552	CTG	2	6	688308	688313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185212
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12195	NC_004552	TAC	2	6	688351	688356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185212
12196	NC_004552	CTG	2	6	688380	688385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185212
12197	NC_004552	CAA	2	6	688402	688407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185212
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12200	NC_004552	ATA	2	6	688775	688780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185213
12201	NC_004552	CTG	2	6	688794	688799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185213
12202	NC_004552	ATC	2	6	688872	688877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185213
12203	NC_004552	CGA	2	6	688937	688942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185213
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12208	NC_004552	ACTTC	2	10	689068	689077	20 %	40 %	0 %	40 %	62185213
12209	NC_004552	TCA	2	6	689188	689193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185213
12210	NC_004552	ACA	2	6	689254	689259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185213
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12212	NC_004552	CGATC	2	10	689328	689337	20 %	20 %	20 %	40 %	62185213
12213	NC_004552	AT	3	6	689362	689367	50 %	50 %	0 %	0 %	62185213
12214	NC_004552	CTT	2	6	689396	689401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
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12216	NC_004552	TTC	2	6	689571	689576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12217	NC_004552	TTC	2	6	689583	689588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12218	NC_004552	AAG	2	6	689595	689600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185213
12219	NC_004552	ACT	2	6	689656	689661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185213
12220	NC_004552	CTT	2	6	689687	689692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12221	NC_004552	GAT	2	6	689702	689707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185213
12222	NC_004552	CTT	2	6	689723	689728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
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12224	NC_004552	TCT	2	6	689743	689748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12225	NC_004552	CTT	3	9	689813	689821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12226	NC_004552	T	7	7	689851	689857	0 %	100 %	0 %	0 %	62185213
12227	NC_004552	T	8	8	689877	689884	0 %	100 %	0 %	0 %	62185213
12228	NC_004552	TTC	2	6	689916	689921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12229	NC_004552	CTT	2	6	689960	689965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12230	NC_004552	CTT	2	6	689996	690001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12231	NC_004552	CAAT	2	8	690008	690015	50 %	25 %	0 %	25 %	62185213
12232	NC_004552	AGC	2	6	690084	690089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185213
12233	NC_004552	TCA	2	6	690091	690096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185213
12234	NC_004552	GATC	2	8	690101	690108	25 %	25 %	25 %	25 %	62185213
12235	NC_004552	AGGA	2	8	690117	690124	50 %	0 %	50 %	0 %	62185213
12236	NC_004552	AT	3	6	690136	690141	50 %	50 %	0 %	0 %	62185213
12237	NC_004552	AAGA	2	8	690146	690153	75 %	0 %	25 %	0 %	62185213
12238	NC_004552	GCA	2	6	690160	690165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185213
12239	NC_004552	TACG	2	8	690185	690192	25 %	25 %	25 %	25 %	62185213
12240	NC_004552	GAA	2	6	690227	690232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185213
12241	NC_004552	TCT	2	6	690244	690249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
12242	NC_004552	AAGG	2	8	690250	690257	50 %	0 %	50 %	0 %	62185213
12243	NC_004552	ATTC	2	8	690323	690330	25 %	50 %	0 %	25 %	62185213
12244	NC_004552	AGT	2	6	690333	690338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185213
12245	NC_004552	CAATG	2	10	690344	690353	40 %	20 %	20 %	20 %	62185213
12246	NC_004552	TAA	2	6	690381	690386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185213
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12492	NC_004552	A	8	8	705677	705684	100 %	0 %	0 %	0 %	62185227
12493	NC_004552	AAG	2	6	705862	705867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185227
12494	NC_004552	ATCAA	2	10	706024	706033	60 %	20 %	0 %	20 %	62185227
12495	NC_004552	A	7	7	706032	706038	100 %	0 %	0 %	0 %	62185227
12496	NC_004552	CGA	2	6	706081	706086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185227
12497	NC_004552	ATG	2	6	706099	706104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185227
12498	NC_004552	TGT	2	6	706202	706207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185227
12499	NC_004552	TG	3	6	706275	706280	0 %	50 %	50 %	0 %	62185227
12500	NC_004552	AGA	2	6	706283	706288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185227

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