MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004552	GTT	2	6	25528	25533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
502	NC_004552	AG	3	6	25596	25601	50 %	0 %	50 %	0 %	62184663
503	NC_004552	CTT	3	9	25634	25642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184663
504	NC_004552	TGT	2	6	25730	25735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
505	NC_004552	TCA	2	6	25781	25786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184663
506	NC_004552	CCA	2	6	25801	25806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184663
507	NC_004552	A	6	6	25851	25856	100 %	0 %	0 %	0 %	62184663
508	NC_004552	TCT	2	6	25903	25908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184663
509	NC_004552	ATT	2	6	26025	26030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184663
510	NC_004552	TTG	2	6	26040	26045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
511	NC_004552	AGA	2	6	26109	26114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184663
512	NC_004552	AGG	2	6	26280	26285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184663
513	NC_004552	GTT	2	6	26301	26306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
514	NC_004552	AAC	2	6	26314	26319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184663
515	NC_004552	GCTG	2	8	26407	26414	0 %	25 %	50 %	25 %	62184663
516	NC_004552	TAAA	2	8	26459	26466	75 %	25 %	0 %	0 %	62184663
517	NC_004552	TA	3	6	26499	26504	50 %	50 %	0 %	0 %	62184663
518	NC_004552	AGA	2	6	26508	26513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184663
519	NC_004552	TTA	2	6	26669	26674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184664
520	NC_004552	ATC	2	6	26711	26716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
521	NC_004552	A	6	6	26744	26749	100 %	0 %	0 %	0 %	62184664
522	NC_004552	TAC	2	6	26757	26762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
523	NC_004552	CCA	2	6	26788	26793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184664
524	NC_004552	TTA	2	6	26795	26800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184664
525	NC_004552	TGA	2	6	26881	26886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184664
526	NC_004552	AGA	2	6	26929	26934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
527	NC_004552	CTG	2	6	27027	27032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184664
528	NC_004552	GTA	2	6	27036	27041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184664
529	NC_004552	AGA	2	6	27058	27063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
530	NC_004552	ACA	2	6	27085	27090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
531	NC_004552	TTA	2	6	27104	27109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184664
532	NC_004552	CTGG	2	8	27158	27165	0 %	25 %	50 %	25 %	62184664
533	NC_004552	AGC	2	6	27262	27267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184664
534	NC_004552	CAG	2	6	27435	27440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184664
535	NC_004552	AGA	3	9	27535	27543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
536	NC_004552	AC	3	6	27598	27603	50 %	0 %	0 %	50 %	62184664
537	NC_004552	TA	3	6	27723	27728	50 %	50 %	0 %	0 %	62184664
538	NC_004552	CTG	2	6	27741	27746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184664
539	NC_004552	TGT	3	9	27760	27768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184664
540	NC_004552	TCC	2	6	27833	27838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184664
541	NC_004552	AGT	2	6	27890	27895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184664
542	NC_004552	CAAT	2	8	27930	27937	50 %	25 %	0 %	25 %	62184664
543	NC_004552	CAA	2	6	27965	27970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
544	NC_004552	ATG	2	6	27981	27986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184664
545	NC_004552	AAC	2	6	28000	28005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
546	NC_004552	TA	3	6	28022	28027	50 %	50 %	0 %	0 %	62184664
547	NC_004552	TTG	2	6	28047	28052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184664
548	NC_004552	CTA	2	6	28068	28073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
549	NC_004552	ACA	2	6	28076	28081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
550	NC_004552	CCT	2	6	28155	28160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184664
551	NC_004552	AAG	2	6	28233	28238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
552	NC_004552	CAA	2	6	28259	28264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
553	NC_004552	AGAT	2	8	28428	28435	50 %	25 %	25 %	0 %	62184664
554	NC_004552	ATCG	2	8	28559	28566	25 %	25 %	25 %	25 %	62184664
555	NC_004552	T	6	6	28588	28593	0 %	100 %	0 %	0 %	62184664
556	NC_004552	CTG	2	6	28725	28730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184664
557	NC_004552	AAAT	2	8	28780	28787	75 %	25 %	0 %	0 %	62184664
558	NC_004552	A	7	7	28801	28807	100 %	0 %	0 %	0 %	62184664
559	NC_004552	CAT	2	6	28912	28917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
560	NC_004552	GTGA	2	8	29003	29010	25 %	25 %	50 %	0 %	62184664
561	NC_004552	GAA	2	6	29048	29053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
562	NC_004552	GGCA	2	8	29058	29065	25 %	0 %	50 %	25 %	62184664
563	NC_004552	AGA	2	6	29080	29085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
564	NC_004552	G	6	6	29123	29128	0 %	0 %	100 %	0 %	62184664
565	NC_004552	CTA	2	6	29145	29150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
566	NC_004552	ATCAG	2	10	29155	29164	40 %	20 %	20 %	20 %	62184664
567	NC_004552	GCA	2	6	29227	29232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184664
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570	NC_004552	AGGG	2	8	29390	29397	25 %	0 %	75 %	0 %	62184665
571	NC_004552	CAA	2	6	29420	29425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184665
572	NC_004552	TGT	2	6	29490	29495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184665
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578	NC_004552	GAA	2	6	29650	29655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184666
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581	NC_004552	AATACC	2	12	29731	29742	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	62184666
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583	NC_004552	AG	3	6	29884	29889	50 %	0 %	50 %	0 %	62184666
584	NC_004552	T	6	6	29899	29904	0 %	100 %	0 %	0 %	62184666
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591	NC_004552	CGT	2	6	30234	30239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184666
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593	NC_004552	T	6	6	30263	30268	0 %	100 %	0 %	0 %	62184666
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595	NC_004552	GC	3	6	30351	30356	0 %	0 %	50 %	50 %	62184667
596	NC_004552	CCG	2	6	30447	30452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184667
597	NC_004552	TCA	2	6	30466	30471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184667
598	NC_004552	T	7	7	30632	30638	0 %	100 %	0 %	0 %	62184667
599	NC_004552	AGG	2	6	30650	30655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184667
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601	NC_004552	AACG	2	8	30806	30813	50 %	0 %	25 %	25 %	62184668
602	NC_004552	AGC	2	6	30952	30957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184668
603	NC_004552	C	6	6	31009	31014	0 %	0 %	0 %	100 %	62184668
604	NC_004552	GA	3	6	31067	31072	50 %	0 %	50 %	0 %	62184668
605	NC_004552	CGCA	2	8	31081	31088	25 %	0 %	25 %	50 %	62184668
606	NC_004552	TTG	2	6	31103	31108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184668
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609	NC_004552	AG	3	6	31159	31164	50 %	0 %	50 %	0 %	62184668
610	NC_004552	GA	4	8	31197	31204	50 %	0 %	50 %	0 %	62184668
611	NC_004552	T	6	6	31213	31218	0 %	100 %	0 %	0 %	62184668
612	NC_004552	TAA	2	6	31224	31229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184668
613	NC_004552	CAG	3	9	31242	31250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184668
614	NC_004552	GAA	2	6	31293	31298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184668
615	NC_004552	CA	3	6	31302	31307	50 %	0 %	0 %	50 %	62184668
616	NC_004552	CTG	2	6	31311	31316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184668
617	NC_004552	GTTT	2	8	31370	31377	0 %	75 %	25 %	0 %	62184668
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619	NC_004552	GCG	2	6	31520	31525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184668
620	NC_004552	TCT	2	6	31541	31546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184668
621	NC_004552	ATC	2	6	31577	31582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184668
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626	NC_004552	CTT	2	6	32208	32213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184669
627	NC_004552	ATTT	2	8	32394	32401	25 %	75 %	0 %	0 %	62184670
628	NC_004552	TGAT	2	8	32404	32411	25 %	50 %	25 %	0 %	62184670
629	NC_004552	TTGT	2	8	32420	32427	0 %	75 %	25 %	0 %	62184670
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631	NC_004552	TAT	2	6	32443	32448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184670
632	NC_004552	TAT	2	6	32459	32464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184670
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