MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_004552	T	6	6	509353	509358	0 %	100 %	0 %	0 %	62185071
9002	NC_004552	GCT	2	6	509570	509575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185072
9003	NC_004552	TGCA	2	8	509587	509594	25 %	25 %	25 %	25 %	62185072
9004	NC_004552	A	6	6	509598	509603	100 %	0 %	0 %	0 %	62185072
9005	NC_004552	TC	3	6	509625	509630	0 %	50 %	0 %	50 %	62185072
9006	NC_004552	GCT	2	6	509670	509675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185072
9007	NC_004552	TC	3	6	509682	509687	0 %	50 %	0 %	50 %	62185072
9008	NC_004552	AGC	2	6	509740	509745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185072
9009	NC_004552	TCT	2	6	509825	509830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185072
9010	NC_004552	TTA	2	6	509855	509860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185072
9011	NC_004552	GTT	2	6	509934	509939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185072
9012	NC_004552	CAT	2	6	510055	510060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185073
9013	NC_004552	CTG	2	6	510084	510089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185073
9014	NC_004552	AAT	2	6	510095	510100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185073
9015	NC_004552	CAA	2	6	510171	510176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185073
9016	NC_004552	CTC	2	6	510186	510191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185073
9017	NC_004552	AAG	2	6	510236	510241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185073
9018	NC_004552	A	6	6	510332	510337	100 %	0 %	0 %	0 %	62185073
9019	NC_004552	CAT	2	6	510379	510384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185073
9020	NC_004552	AGA	2	6	510409	510414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185073
9021	NC_004552	AGA	2	6	510457	510462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185073
9022	NC_004552	TTC	2	6	510475	510480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185073
9023	NC_004552	AG	3	6	510552	510557	50 %	0 %	50 %	0 %	62185073
9024	NC_004552	ACC	2	6	510625	510630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62185073
9025	NC_004552	AAC	2	6	510631	510636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185073
9026	NC_004552	TGT	2	6	510665	510670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185073
9027	NC_004552	TCT	2	6	510791	510796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185073
9028	NC_004552	AGA	2	6	510799	510804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185073
9029	NC_004552	CAT	2	6	510807	510812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185073
9030	NC_004552	T	8	8	510919	510926	0 %	100 %	0 %	0 %	62185073
9031	NC_004552	TCT	2	6	510946	510951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185073
9032	NC_004552	TCT	2	6	510974	510979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185073
9033	NC_004552	T	6	6	510979	510984	0 %	100 %	0 %	0 %	62185073
9034	NC_004552	TGC	2	6	510997	511002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185073
9035	NC_004552	CTT	2	6	511071	511076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185073
9036	NC_004552	TGC	3	9	511090	511098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185073
9037	NC_004552	CAC	2	6	511131	511136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62185073
9038	NC_004552	CTC	2	6	511149	511154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185073
9039	NC_004552	TGC	2	6	511159	511164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185073
9040	NC_004552	TTC	2	6	511206	511211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185074
9041	NC_004552	AGG	2	6	511333	511338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185074
9042	NC_004552	GGA	2	6	511349	511354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185074
9043	NC_004552	AGATT	2	10	511386	511395	40 %	40 %	20 %	0 %	62185074
9044	NC_004552	GTTT	2	8	511436	511443	0 %	75 %	25 %	0 %	62185074
9045	NC_004552	ATC	2	6	511457	511462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185074
9046	NC_004552	AGTA	2	8	511481	511488	50 %	25 %	25 %	0 %	62185074
9047	NC_004552	AGA	2	6	511543	511548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185074
9048	NC_004552	ACGT	2	8	511549	511556	25 %	25 %	25 %	25 %	62185074
9049	NC_004552	CTT	2	6	511704	511709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185074
9050	NC_004552	GAA	2	6	511795	511800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185074
9051	NC_004552	GAA	2	6	511812	511817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185074
9052	NC_004552	GCT	2	6	511850	511855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185074
9053	NC_004552	GCA	2	6	511907	511912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185074
9054	NC_004552	TTCA	2	8	512014	512021	25 %	50 %	0 %	25 %	62185074
9055	NC_004552	GAA	2	6	512022	512027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185074
9056	NC_004552	TTG	2	6	512167	512172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185074
9057	NC_004552	AGT	2	6	512226	512231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185074
9058	NC_004552	GCT	2	6	512255	512260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185074
9059	NC_004552	GCA	2	6	512267	512272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185074
9060	NC_004552	TGT	2	6	512281	512286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185074
9061	NC_004552	ATT	2	6	512317	512322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185074
9062	NC_004552	TTC	2	6	512324	512329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185074
9063	NC_004552	AG	4	8	512363	512370	50 %	0 %	50 %	0 %	62185074
9064	NC_004552	A	6	6	512401	512406	100 %	0 %	0 %	0 %	62185074
9065	NC_004552	TGC	2	6	512422	512427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185074
9066	NC_004552	TAAC	2	8	512457	512464	50 %	25 %	0 %	25 %	62185074
9067	NC_004552	CAG	2	6	512529	512534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185074
9068	NC_004552	GATA	2	8	512581	512588	50 %	25 %	25 %	0 %	62185074
9069	NC_004552	AGC	2	6	512605	512610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185074
9070	NC_004552	CCATG	2	10	512622	512631	20 %	20 %	20 %	40 %	62185074
9071	NC_004552	ACC	2	6	512653	512658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62185074
9072	NC_004552	TTAA	2	8	512666	512673	50 %	50 %	0 %	0 %	62185074
9073	NC_004552	TTG	2	6	512782	512787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185074
9074	NC_004552	ATCA	2	8	512791	512798	50 %	25 %	0 %	25 %	62185074
9075	NC_004552	GC	3	6	512804	512809	0 %	0 %	50 %	50 %	62185074
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9079	NC_004552	ATA	2	6	512936	512941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185074
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9081	NC_004552	ACG	2	6	512966	512971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185074
9082	NC_004552	AAG	2	6	513013	513018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185074
9083	NC_004552	GAA	2	6	513032	513037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185074
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9087	NC_004552	ATC	2	6	513164	513169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185074
9088	NC_004552	GAT	2	6	513199	513204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185074
9089	NC_004552	ATC	2	6	513221	513226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185074
9090	NC_004552	TTG	2	6	513254	513259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185074
9091	NC_004552	GGTT	2	8	513334	513341	0 %	50 %	50 %	0 %	62185075
9092	NC_004552	TAT	2	6	513350	513355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185075
9093	NC_004552	TGA	2	6	513515	513520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185075
9094	NC_004552	AATT	2	8	513536	513543	50 %	50 %	0 %	0 %	62185075
9095	NC_004552	AAT	2	6	513552	513557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185075
9096	NC_004552	TA	3	6	513582	513587	50 %	50 %	0 %	0 %	62185075
9097	NC_004552	TTTGA	2	10	513639	513648	20 %	60 %	20 %	0 %	62185075
9098	NC_004552	GAG	2	6	513649	513654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185075
9099	NC_004552	CGG	2	6	513688	513693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62185075
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9101	NC_004552	A	7	7	513820	513826	100 %	0 %	0 %	0 %	62185075
9102	NC_004552	GCA	2	6	513952	513957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185075
9103	NC_004552	TAA	2	6	513981	513986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185075
9104	NC_004552	T	6	6	514042	514047	0 %	100 %	0 %	0 %	62185075
9105	NC_004552	ACA	2	6	514087	514092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185075
9106	NC_004552	AAG	2	6	514142	514147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185075
9107	NC_004552	CTT	2	6	514217	514222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185075
9108	NC_004552	A	6	6	514260	514265	100 %	0 %	0 %	0 %	62185075
9109	NC_004552	GATA	2	8	514270	514277	50 %	25 %	25 %	0 %	62185075
9110	NC_004552	GGAA	2	8	514314	514321	50 %	0 %	50 %	0 %	62185075
9111	NC_004552	T	6	6	514347	514352	0 %	100 %	0 %	0 %	62185075
9112	NC_004552	T	6	6	514391	514396	0 %	100 %	0 %	0 %	62185075
9113	NC_004552	CTT	2	6	514850	514855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185076
9114	NC_004552	GAGTCA	2	12	514938	514949	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	62185076
9115	NC_004552	TTG	2	6	514976	514981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185076
9116	NC_004552	TC	4	8	515037	515044	0 %	50 %	0 %	50 %	62185076
9117	NC_004552	TGT	2	6	515073	515078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185076
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9119	NC_004552	ATG	3	9	515093	515101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185076
9120	NC_004552	AGAT	2	8	515120	515127	50 %	25 %	25 %	0 %	62185076
9121	NC_004552	TGA	2	6	515133	515138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185076
9122	NC_004552	CAA	2	6	515186	515191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185076
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9124	NC_004552	TCT	2	6	515314	515319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185076
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