MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004552	GAT	2	6	275769	275774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184894
5002	NC_004552	GCT	2	6	275794	275799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184894
5003	NC_004552	GT	3	6	275851	275856	0 %	50 %	50 %	0 %	62184894
5004	NC_004552	GCA	2	6	275923	275928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184894
5005	NC_004552	TCA	2	6	275966	275971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184894
5006	NC_004552	CT	3	6	276009	276014	0 %	50 %	0 %	50 %	62184894
5007	NC_004552	AGA	2	6	276230	276235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184895
5008	NC_004552	TCG	2	6	276258	276263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184895
5009	NC_004552	GGT	2	6	276265	276270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184895
5010	NC_004552	AAT	2	6	276298	276303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184895
5011	NC_004552	TGTT	2	8	276356	276363	0 %	75 %	25 %	0 %	62184895
5012	NC_004552	GGTT	2	8	277475	277482	0 %	50 %	50 %	0 %	62184896
5013	NC_004552	AACA	2	8	277513	277520	75 %	0 %	0 %	25 %	62184896
5014	NC_004552	GTT	2	6	277530	277535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184896
5015	NC_004552	GAA	2	6	277587	277592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184896
5016	NC_004552	CGC	2	6	277602	277607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184896
5017	NC_004552	TCT	2	6	277711	277716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184896
5018	NC_004552	AGA	2	6	277832	277837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184896
5019	NC_004552	GTT	2	6	277854	277859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184896
5020	NC_004552	AGT	2	6	277863	277868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184896
5021	NC_004552	AAT	2	6	277891	277896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184896
5022	NC_004552	CGT	2	6	278039	278044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184896
5023	NC_004552	GGT	2	6	278085	278090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184896
5024	NC_004552	ATAA	2	8	278115	278122	75 %	25 %	0 %	0 %	62184896
5025	NC_004552	CCT	2	6	278156	278161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184896
5026	NC_004552	GAA	2	6	278208	278213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184896
5027	NC_004552	AGGA	2	8	278263	278270	50 %	0 %	50 %	0 %	62184896
5028	NC_004552	TAA	2	6	278271	278276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184896
5029	NC_004552	TG	3	6	278290	278295	0 %	50 %	50 %	0 %	62184896
5030	NC_004552	TTG	2	6	278397	278402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184896
5031	NC_004552	ACA	2	6	278417	278422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184896
5032	NC_004552	AAGG	2	8	278467	278474	50 %	0 %	50 %	0 %	62184896
5033	NC_004552	GAA	3	9	278487	278495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184896
5034	NC_004552	TTCC	2	8	278504	278511	0 %	50 %	0 %	50 %	62184896
5035	NC_004552	AGA	2	6	278571	278576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184896
5036	NC_004552	CAT	2	6	278577	278582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184896
5037	NC_004552	GCT	2	6	278596	278601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184896
5038	NC_004552	GAT	2	6	278609	278614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184896
5039	NC_004552	CA	3	6	278756	278761	50 %	0 %	0 %	50 %	62184896
5040	NC_004552	GA	4	8	278762	278769	50 %	0 %	50 %	0 %	62184896
5041	NC_004552	TCAA	2	8	278776	278783	50 %	25 %	0 %	25 %	62184896
5042	NC_004552	TTG	2	6	278948	278953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184896
5043	NC_004552	AGGA	2	8	278957	278964	50 %	0 %	50 %	0 %	62184896
5044	NC_004552	GA	3	6	278966	278971	50 %	0 %	50 %	0 %	62184896
5045	NC_004552	GAAA	2	8	278976	278983	75 %	0 %	25 %	0 %	62184896
5046	NC_004552	GTAG	2	8	278998	279005	25 %	25 %	50 %	0 %	62184896
5047	NC_004552	CACT	2	8	279134	279141	25 %	25 %	0 %	50 %	62184896
5048	NC_004552	CGT	2	6	279162	279167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184896
5049	NC_004552	TCC	2	6	279181	279186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184896
5050	NC_004552	T	6	6	279215	279220	0 %	100 %	0 %	0 %	62184896
5051	NC_004552	GAG	2	6	279228	279233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184896
5052	NC_004552	AAT	2	6	279345	279350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184896
5053	NC_004552	ATCA	2	8	279384	279391	50 %	25 %	0 %	25 %	62184896
5054	NC_004552	GT	3	6	279502	279507	0 %	50 %	50 %	0 %	62184896
5055	NC_004552	AGA	2	6	279517	279522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184896
5056	NC_004552	ATA	2	6	279637	279642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184896
5057	NC_004552	CTTC	2	8	279650	279657	0 %	50 %	0 %	50 %	62184896
5058	NC_004552	GTT	2	6	279762	279767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184896
5059	NC_004552	AAGT	2	8	279772	279779	50 %	25 %	25 %	0 %	62184896
5060	NC_004552	GA	3	6	279800	279805	50 %	0 %	50 %	0 %	62184896
5061	NC_004552	CAT	2	6	279861	279866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184896
5062	NC_004552	TAT	2	6	280007	280012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184896
5063	NC_004552	TTTTG	2	10	280122	280131	0 %	80 %	20 %	0 %	62184896
5064	NC_004552	AGG	3	9	280158	280166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184896
5065	NC_004552	GTT	2	6	280175	280180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184896
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5067	NC_004552	TGG	2	6	280200	280205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184896
5068	NC_004552	GGA	2	6	280219	280224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184896
5069	NC_004552	GGAG	2	8	280261	280268	25 %	0 %	75 %	0 %	62184896
5070	NC_004552	GCG	2	6	280295	280300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184896
5071	NC_004552	GA	3	6	280316	280321	50 %	0 %	50 %	0 %	62184896
5072	NC_004552	GAG	2	6	280343	280348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184896
5073	NC_004552	GTTGT	2	10	280367	280376	0 %	60 %	40 %	0 %	62184896
5074	NC_004552	GTA	2	6	280423	280428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184896
5075	NC_004552	GTG	2	6	280433	280438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184896
5076	NC_004552	CTT	2	6	280456	280461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184896
5077	NC_004552	TTGTG	2	10	280578	280587	0 %	60 %	40 %	0 %	62184896
5078	NC_004552	AGT	2	6	280598	280603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184896
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5080	NC_004552	ATT	2	6	280713	280718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184896
5081	NC_004552	G	7	7	280741	280747	0 %	0 %	100 %	0 %	62184896
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5083	NC_004552	GTT	2	6	280942	280947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184897
5084	NC_004552	GTTG	2	8	280956	280963	0 %	50 %	50 %	0 %	62184897
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5087	NC_004552	TAG	2	6	280996	281001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184897
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5089	NC_004552	GGT	2	6	281114	281119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184897
5090	NC_004552	GAT	2	6	281289	281294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184897
5091	NC_004552	TTC	2	6	281296	281301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184897
5092	NC_004552	TTC	2	6	281315	281320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184897
5093	NC_004552	CTG	2	6	281358	281363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184897
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5095	NC_004552	TA	3	6	281497	281502	50 %	50 %	0 %	0 %	62184897
5096	NC_004552	CAA	2	6	281503	281508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184897
5097	NC_004552	AAG	2	6	281584	281589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184897
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5099	NC_004552	CCT	2	6	281627	281632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184897
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5104	NC_004552	TGT	2	6	282038	282043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184898
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5106	NC_004552	TTG	2	6	282216	282221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184898
5107	NC_004552	TTA	2	6	282269	282274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184898
5108	NC_004552	GTG	2	6	282416	282421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184898
5109	NC_004552	TTC	2	6	282492	282497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184898
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5112	NC_004552	TTC	2	6	282726	282731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184899
5113	NC_004552	TGA	2	6	282870	282875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184899
5114	NC_004552	TC	3	6	282907	282912	0 %	50 %	0 %	50 %	62184899
5115	NC_004552	TAT	2	6	283081	283086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184899
5116	NC_004552	TCAG	2	8	283265	283272	25 %	25 %	25 %	25 %	62184899
5117	NC_004552	TGC	2	6	283284	283289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184899
5118	NC_004552	AAAG	2	8	283302	283309	75 %	0 %	25 %	0 %	62184899
5119	NC_004552	ATCA	2	8	283324	283331	50 %	25 %	0 %	25 %	62184899
5120	NC_004552	ATT	2	6	283355	283360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184899
5121	NC_004552	TCGT	2	8	283402	283409	0 %	50 %	25 %	25 %	62184899
5122	NC_004552	A	8	8	283423	283430	100 %	0 %	0 %	0 %	62184900
5123	NC_004552	AGA	2	6	283437	283442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184900
5124	NC_004552	GA	3	6	283454	283459	50 %	0 %	50 %	0 %	62184900
5125	NC_004552	GAA	2	6	283561	283566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184900
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5134	NC_004552	GAT	2	6	284004	284009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184900
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5232	NC_004552	GAT	2	6	289518	289523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184904
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5241	NC_004552	AAG	2	6	290106	290111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184904
5242	NC_004552	CGGTA	2	10	290186	290195	20 %	20 %	40 %	20 %	62184904
5243	NC_004552	TGCC	2	8	290209	290216	0 %	25 %	25 %	50 %	62184904
5244	NC_004552	TGCTTG	2	12	290224	290235	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	62184904
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5247	NC_004552	T	6	6	290312	290317	0 %	100 %	0 %	0 %	62184904
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5249	NC_004552	GAA	2	6	290360	290365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184904
5250	NC_004552	TGA	2	6	290372	290377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184904
5251	NC_004552	ATC	2	6	290421	290426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184904
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5253	NC_004552	AGA	2	6	290444	290449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184904
5254	NC_004552	CTG	2	6	290503	290508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184904
5255	NC_004552	CT	4	8	290560	290567	0 %	50 %	0 %	50 %	62184904
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5282	NC_004552	AGCG	2	8	292154	292161	25 %	0 %	50 %	25 %	62184905
5283	NC_004552	TACG	2	8	292186	292193	25 %	25 %	25 %	25 %	62184905
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5362	NC_004552	GCAAA	2	10	295985	295994	60 %	0 %	20 %	20 %	62184906
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5370	NC_004552	AG	4	8	296463	296470	50 %	0 %	50 %	0 %	62184906
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5372	NC_004552	AG	3	6	296490	296495	50 %	0 %	50 %	0 %	62184906
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5495	NC_004552	AGA	2	6	304273	304278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184910
5496	NC_004552	TAA	3	9	304345	304353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184910
5497	NC_004552	TCC	2	6	304374	304379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184910
5498	NC_004552	TCTA	2	8	304438	304445	25 %	50 %	0 %	25 %	62184910
5499	NC_004552	TTAA	2	8	304472	304479	50 %	50 %	0 %	0 %	62184910
5500	NC_004552	GAA	2	6	304484	304489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184910

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