MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 96621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003910	CTTA	2	8	228469	228476	25 %	50 %	0 %	25 %	71282649
4002	NC_003910	CTG	2	6	228504	228509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71282649
4003	NC_003910	CAT	2	6	228545	228550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71282649
4004	NC_003910	GTG	2	6	228639	228644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71282649
4005	NC_003910	ATTGA	2	10	228647	228656	40 %	40 %	20 %	0 %	71282649
4006	NC_003910	GAAA	2	8	228898	228905	75 %	0 %	25 %	0 %	71281522
4007	NC_003910	CCA	2	6	228935	228940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281522
4008	NC_003910	ATC	2	6	228968	228973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281522
4009	NC_003910	TGGCT	2	10	228988	228997	0 %	40 %	40 %	20 %	71281522
4010	NC_003910	ATT	2	6	229019	229024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281522
4011	NC_003910	ATG	2	6	229032	229037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281522
4012	NC_003910	T	7	7	229076	229082	0 %	100 %	0 %	0 %	71281522
4013	NC_003910	TGTC	2	8	229099	229106	0 %	50 %	25 %	25 %	71281522
4014	NC_003910	GTA	2	6	229116	229121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281522
4015	NC_003910	TGA	2	6	229159	229164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281522
4016	NC_003910	A	6	6	229166	229171	100 %	0 %	0 %	0 %	71281522
4017	NC_003910	GCG	2	6	229259	229264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71280851
4018	NC_003910	TGT	2	6	229339	229344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280851
4019	NC_003910	AGTTTC	2	12	229466	229477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71280417
4020	NC_003910	ATT	3	9	229478	229486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280417
4021	NC_003910	CAG	2	6	229499	229504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71280417
4022	NC_003910	GCA	2	6	229509	229514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71280417
4023	NC_003910	CAT	2	6	229530	229535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71280417
4024	NC_003910	AGCA	2	8	229553	229560	50 %	0 %	25 %	25 %	71280417
4025	NC_003910	ATA	2	6	229609	229614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280417
4026	NC_003910	GTG	2	6	229623	229628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71280417
4027	NC_003910	CAA	2	6	229662	229667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71280417
4028	NC_003910	TGA	2	6	229700	229705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280417
4029	NC_003910	A	7	7	229804	229810	100 %	0 %	0 %	0 %	71280417
4030	NC_003910	ATT	2	6	229822	229827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280417
4031	NC_003910	ATT	2	6	229869	229874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280417
4032	NC_003910	AAAC	2	8	229947	229954	75 %	0 %	0 %	25 %	71280417
4033	NC_003910	TAT	2	6	229960	229965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280417
4034	NC_003910	ATG	2	6	230038	230043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280417
4035	NC_003910	TTG	2	6	230077	230082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280417
4036	NC_003910	CAA	2	6	230091	230096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71280417
4037	NC_003910	GATT	2	8	230105	230112	25 %	50 %	25 %	0 %	71280417
4038	NC_003910	AAG	2	6	230254	230259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71280417
4039	NC_003910	A	6	6	230341	230346	100 %	0 %	0 %	0 %	71280417
4040	NC_003910	ATG	2	6	230356	230361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280417
4041	NC_003910	CGG	2	6	230425	230430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71280417
4042	NC_003910	TAT	2	6	230454	230459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280417
4043	NC_003910	GAT	2	6	230490	230495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280417
4044	NC_003910	CAA	2	6	230663	230668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71280036
4045	NC_003910	CGT	2	6	230721	230726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71280036
4046	NC_003910	AAC	2	6	230745	230750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71280036
4047	NC_003910	T	7	7	230783	230789	0 %	100 %	0 %	0 %	71279356
4048	NC_003910	T	6	6	230838	230843	0 %	100 %	0 %	0 %	71279356
4049	NC_003910	TAA	2	6	230854	230859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278890
4050	NC_003910	CTA	2	6	230889	230894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278890
4051	NC_003910	TAA	2	6	231169	231174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278890
4052	NC_003910	GTTA	2	8	231196	231203	25 %	50 %	25 %	0 %	71278890
4053	NC_003910	A	7	7	231272	231278	100 %	0 %	0 %	0 %	71278890
4054	NC_003910	ATT	2	6	231307	231312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278890
4055	NC_003910	CTG	2	6	231364	231369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278890
4056	NC_003910	TAA	2	6	231414	231419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278890
4057	NC_003910	AAT	2	6	231460	231465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278890
4058	NC_003910	AAT	2	6	231582	231587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4059	NC_003910	AAT	2	6	231601	231606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4060	NC_003910	ATGA	2	8	231622	231629	50 %	25 %	25 %	0 %	71278210
4061	NC_003910	CTT	2	6	231660	231665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278210
4062	NC_003910	A	6	6	231697	231702	100 %	0 %	0 %	0 %	71278210
4063	NC_003910	TAA	2	6	231766	231771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4064	NC_003910	AAT	2	6	231925	231930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4065	NC_003910	TAA	2	6	231937	231942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4066	NC_003910	AAT	2	6	231986	231991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4067	NC_003910	CCG	2	6	232013	232018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71278210
4068	NC_003910	A	6	6	232097	232102	100 %	0 %	0 %	0 %	71278210
4069	NC_003910	AAT	2	6	232132	232137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4070	NC_003910	GCAG	2	8	232199	232206	25 %	0 %	50 %	25 %	71278210
4071	NC_003910	T	6	6	232242	232247	0 %	100 %	0 %	0 %	71278210
4072	NC_003910	AGA	2	6	232279	232284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278210
4073	NC_003910	TAA	2	6	232285	232290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4074	NC_003910	CCAA	2	8	232358	232365	50 %	0 %	0 %	50 %	71278210
4075	NC_003910	CAA	2	6	232386	232391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278210
4076	NC_003910	TAA	2	6	232412	232417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278210
4077	NC_003910	TGG	2	6	232457	232462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278210
4078	NC_003910	ATTA	2	8	232501	232508	50 %	50 %	0 %	0 %	71278210
4079	NC_003910	AG	3	6	232519	232524	50 %	0 %	50 %	0 %	71280042
4080	NC_003910	GCA	2	6	232584	232589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71280042
4081	NC_003910	TG	3	6	232597	232602	0 %	50 %	50 %	0 %	71280042
4082	NC_003910	TAA	2	6	232667	232672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280042
4083	NC_003910	TAA	2	6	232676	232681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280042
4084	NC_003910	ATG	2	6	232764	232769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280042
4085	NC_003910	CT	3	6	232836	232841	0 %	50 %	0 %	50 %	71280042
4086	NC_003910	AATCA	2	10	232853	232862	60 %	20 %	0 %	20 %	71280042
4087	NC_003910	TGC	2	6	232931	232936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71280042
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4089	NC_003910	ATA	2	6	232983	232988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280042
4090	NC_003910	T	7	7	233053	233059	0 %	100 %	0 %	0 %	71280042
4091	NC_003910	ATA	2	6	233083	233088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280042
4092	NC_003910	CCG	2	6	233115	233120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71280042
4093	NC_003910	A	6	6	233272	233277	100 %	0 %	0 %	0 %	71280042
4094	NC_003910	ATC	2	6	233328	233333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71280042
4095	NC_003910	CAG	3	9	233383	233391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71280042
4096	NC_003910	AAC	3	9	233498	233506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71280042
4097	NC_003910	TG	3	6	233547	233552	0 %	50 %	50 %	0 %	71280042
4098	NC_003910	TTC	2	6	233605	233610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281015
4099	NC_003910	GTT	2	6	233648	233653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281015
4100	NC_003910	GTT	2	6	233780	233785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281015
4101	NC_003910	TTG	2	6	233790	233795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281015
4102	NC_003910	A	6	6	233801	233806	100 %	0 %	0 %	0 %	71281015
4103	NC_003910	TAT	2	6	233867	233872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281015
4104	NC_003910	ATA	2	6	233929	233934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281015
4105	NC_003910	TAA	2	6	233997	234002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281015
4106	NC_003910	TAA	2	6	234060	234065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281015
4107	NC_003910	ACG	2	6	234105	234110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281015
4108	NC_003910	TTA	2	6	234175	234180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281015
4109	NC_003910	ATC	2	6	234186	234191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281015
4110	NC_003910	TATT	2	8	234194	234201	25 %	75 %	0 %	0 %	71281015
4111	NC_003910	GAA	2	6	234291	234296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281438
4112	NC_003910	GCAA	2	8	234325	234332	50 %	0 %	25 %	25 %	71281438
4113	NC_003910	AGC	2	6	234362	234367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281438
4114	NC_003910	CGG	2	6	234397	234402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71281438
4115	NC_003910	T	8	8	234423	234430	0 %	100 %	0 %	0 %	71281438
4116	NC_003910	TCT	2	6	234444	234449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281438
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4120	NC_003910	AAT	2	6	234596	234601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281438
4121	NC_003910	AAC	2	6	234722	234727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281438
4122	NC_003910	ATC	2	6	234788	234793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281438
4123	NC_003910	CTTT	2	8	234834	234841	0 %	75 %	0 %	25 %	71281438
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4125	NC_003910	CTT	2	6	235023	235028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281438
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4500	NC_003910	ATA	2	6	255618	255623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278325

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