MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_003366	TTA	2	6	2897421	2897426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311511
65003	NC_003366	TCA	2	6	2897430	2897435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311511
65004	NC_003366	TCT	2	6	2897451	2897456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311511
65005	NC_003366	TTA	2	6	2897488	2897493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311511
65006	NC_003366	AGT	2	6	2897510	2897515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311511
65007	NC_003366	T	6	6	2897515	2897520	0 %	100 %	0 %	0 %	18311511
65008	NC_003366	TTC	2	6	2897540	2897545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311511
65009	NC_003366	T	6	6	2897614	2897619	0 %	100 %	0 %	0 %	18311511
65010	NC_003366	T	7	7	2897660	2897666	0 %	100 %	0 %	0 %	18311511
65011	NC_003366	TCT	2	6	2897816	2897821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
65012	NC_003366	CAT	2	6	2897877	2897882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311512
65013	NC_003366	CTT	3	9	2897904	2897912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
65014	NC_003366	AT	3	6	2897915	2897920	50 %	50 %	0 %	0 %	18311512
65015	NC_003366	CTT	2	6	2897949	2897954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
65016	NC_003366	TC	3	6	2897966	2897971	0 %	50 %	0 %	50 %	18311512
65017	NC_003366	CAT	2	6	2897979	2897984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311512
65018	NC_003366	ATA	2	6	2898022	2898027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311512
65019	NC_003366	TCT	2	6	2898047	2898052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
65020	NC_003366	ATT	2	6	2898088	2898093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311512
65021	NC_003366	ATTT	2	8	2898103	2898110	25 %	75 %	0 %	0 %	18311512
65022	NC_003366	TAT	2	6	2898142	2898147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311512
65023	NC_003366	CTT	2	6	2898168	2898173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
65024	NC_003366	TAA	2	6	2898242	2898247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311512
65025	NC_003366	TAT	3	9	2898300	2898308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311512
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65028	NC_003366	AGC	2	6	2898481	2898486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311512
65029	NC_003366	T	6	6	2898488	2898493	0 %	100 %	0 %	0 %	18311512
65030	NC_003366	CTT	3	9	2898504	2898512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
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65033	NC_003366	TCA	2	6	2898623	2898628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311512
65034	NC_003366	TCTAAA	2	12	2898641	2898652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	18311512
65035	NC_003366	TTC	2	6	2898706	2898711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
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65037	NC_003366	TCTT	2	8	2898781	2898788	0 %	75 %	0 %	25 %	18311512
65038	NC_003366	TA	3	6	2898808	2898813	50 %	50 %	0 %	0 %	18311512
65039	NC_003366	TCA	2	6	2898821	2898826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311512
65040	NC_003366	ATTT	2	8	2898835	2898842	25 %	75 %	0 %	0 %	18311512
65041	NC_003366	TTC	2	6	2898865	2898870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
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65043	NC_003366	CTG	2	6	2898927	2898932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311512
65044	NC_003366	TAA	2	6	2898964	2898969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311512
65045	NC_003366	TCT	2	6	2898977	2898982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311512
65046	NC_003366	TAA	2	6	2898991	2898996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311512
65047	NC_003366	TC	3	6	2898999	2899004	0 %	50 %	0 %	50 %	18311512
65048	NC_003366	AAACT	2	10	2899017	2899026	60 %	20 %	0 %	20 %	18311512
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65050	NC_003366	TTA	2	6	2899236	2899241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311513
65051	NC_003366	T	6	6	2899296	2899301	0 %	100 %	0 %	0 %	18311513
65052	NC_003366	TTG	2	6	2899347	2899352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311513
65053	NC_003366	TTA	2	6	2899400	2899405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311513
65054	NC_003366	TCT	2	6	2899412	2899417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311513
65055	NC_003366	AGT	2	6	2899440	2899445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311513
65056	NC_003366	TTA	2	6	2899536	2899541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311513
65057	NC_003366	TG	3	6	2899602	2899607	0 %	50 %	50 %	0 %	18311513
65058	NC_003366	TTG	2	6	2899659	2899664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311513
65059	NC_003366	T	6	6	2899677	2899682	0 %	100 %	0 %	0 %	18311513
65060	NC_003366	GTA	2	6	2899700	2899705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311513
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65071	NC_003366	TC	3	6	2900438	2900443	0 %	50 %	0 %	50 %	18311513
65072	NC_003366	CATT	2	8	2900463	2900470	25 %	50 %	0 %	25 %	18311513
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