MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_003366	TAA	2	6	2851981	2851986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311472
64003	NC_003366	CTT	2	6	2852022	2852027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311472
64004	NC_003366	T	6	6	2852070	2852075	0 %	100 %	0 %	0 %	18311472
64005	NC_003366	TTC	2	6	2852100	2852105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311472
64006	NC_003366	TTA	2	6	2852202	2852207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311472
64007	NC_003366	CTA	2	6	2852232	2852237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311472
64008	NC_003366	TAAC	2	8	2852315	2852322	50 %	25 %	0 %	25 %	18311472
64009	NC_003366	TTCT	2	8	2852337	2852344	0 %	75 %	0 %	25 %	18311472
64010	NC_003366	TAT	2	6	2852368	2852373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311472
64011	NC_003366	TCT	2	6	2852384	2852389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311472
64012	NC_003366	CTG	2	6	2852493	2852498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311472
64013	NC_003366	ATT	2	6	2852732	2852737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311473
64014	NC_003366	TCA	2	6	2852770	2852775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311473
64015	NC_003366	CT	3	6	2852796	2852801	0 %	50 %	0 %	50 %	18311473
64016	NC_003366	TAC	2	6	2852913	2852918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311473
64017	NC_003366	CAA	2	6	2853157	2853162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311474
64018	NC_003366	TGTT	2	8	2853196	2853203	0 %	75 %	25 %	0 %	18311474
64019	NC_003366	TAT	2	6	2853211	2853216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311474
64020	NC_003366	TAA	2	6	2853260	2853265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311474
64021	NC_003366	CCG	2	6	2853288	2853293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311474
64022	NC_003366	TGT	2	6	2853363	2853368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311474
64023	NC_003366	TTACT	2	10	2853421	2853430	20 %	60 %	0 %	20 %	18311474
64024	NC_003366	TCT	2	6	2853434	2853439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311474
64025	NC_003366	TTA	2	6	2853445	2853450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311474
64026	NC_003366	TTA	2	6	2853511	2853516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311474
64027	NC_003366	TAATA	2	10	2853551	2853560	60 %	40 %	0 %	0 %	18311474
64028	NC_003366	TTA	2	6	2853571	2853576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311474
64029	NC_003366	A	6	6	2853609	2853614	100 %	0 %	0 %	0 %	18311474
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64031	NC_003366	TTC	2	6	2853659	2853664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311474
64032	NC_003366	CTTT	2	8	2853671	2853678	0 %	75 %	0 %	25 %	18311474
64033	NC_003366	T	6	6	2853676	2853681	0 %	100 %	0 %	0 %	18311474
64034	NC_003366	AT	3	6	2853702	2853707	50 %	50 %	0 %	0 %	18311474
64035	NC_003366	CCA	2	6	2853714	2853719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311474
64036	NC_003366	GCA	2	6	2853720	2853725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311474
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64038	NC_003366	TTA	2	6	2853852	2853857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311474
64039	NC_003366	CTA	2	6	2853894	2853899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311474
64040	NC_003366	TA	3	6	2854256	2854261	50 %	50 %	0 %	0 %	161485639
64041	NC_003366	TTA	2	6	2854292	2854297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161485639
64042	NC_003366	TAA	2	6	2854306	2854311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485639
64043	NC_003366	A	6	6	2854310	2854315	100 %	0 %	0 %	0 %	161485639
64044	NC_003366	TTCAT	2	10	2854317	2854326	20 %	60 %	0 %	20 %	161485639
64045	NC_003366	TGG	2	6	2854333	2854338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161485639
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64048	NC_003366	TA	3	6	2854500	2854505	50 %	50 %	0 %	0 %	161485639
64049	NC_003366	GCA	2	6	2854508	2854513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485639
64050	NC_003366	AAT	2	6	2854534	2854539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485639
64051	NC_003366	ACT	4	12	2854646	2854657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485639
64052	NC_003366	TGG	2	6	2854711	2854716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161485639
64053	NC_003366	ATT	2	6	2854727	2854732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161485639
64054	NC_003366	TTC	2	6	2854808	2854813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161485639
64055	NC_003366	AAT	2	6	2854825	2854830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485639
64056	NC_003366	ATG	2	6	2854920	2854925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485639
64057	NC_003366	AT	3	6	2854927	2854932	50 %	50 %	0 %	0 %	161485639
64058	NC_003366	TGA	3	9	2854945	2854953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485639
64059	NC_003366	TAA	2	6	2855008	2855013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485639
64060	NC_003366	GAA	2	6	2855084	2855089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485639
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64062	NC_003366	TCTT	2	8	2855101	2855108	0 %	75 %	0 %	25 %	161485639
64063	NC_003366	GGA	2	6	2855216	2855221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161485639
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64114	NC_003366	AGAA	2	8	2857987	2857994	75 %	0 %	25 %	0 %	18311478
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