MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_003366	ATA	2	6	2830424	2830429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311454
63502	NC_003366	TG	3	6	2830455	2830460	0 %	50 %	50 %	0 %	18311454
63503	NC_003366	T	6	6	2830490	2830495	0 %	100 %	0 %	0 %	18311454
63504	NC_003366	TTC	2	6	2830498	2830503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311454
63505	NC_003366	TC	3	6	2830516	2830521	0 %	50 %	0 %	50 %	18311454
63506	NC_003366	TTC	2	6	2830555	2830560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311454
63507	NC_003366	TTC	2	6	2830621	2830626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311454
63508	NC_003366	TAA	2	6	2830702	2830707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311454
63509	NC_003366	GTA	2	6	2830731	2830736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311454
63510	NC_003366	ACC	2	6	2830753	2830758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311454
63511	NC_003366	CTA	2	6	2830767	2830772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311454
63512	NC_003366	TTC	2	6	2830829	2830834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311454
63513	NC_003366	ACT	2	6	2831081	2831086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311455
63514	NC_003366	ATC	2	6	2831092	2831097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311455
63515	NC_003366	TCC	2	6	2831107	2831112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311455
63516	NC_003366	GTA	2	6	2831201	2831206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311455
63517	NC_003366	CAT	2	6	2831217	2831222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311455
63518	NC_003366	ACTA	2	8	2831251	2831258	50 %	25 %	0 %	25 %	18311455
63519	NC_003366	TTAC	2	8	2831270	2831277	25 %	50 %	0 %	25 %	18311455
63520	NC_003366	TTC	2	6	2831305	2831310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311455
63521	NC_003366	CT	3	6	2831361	2831366	0 %	50 %	0 %	50 %	18311455
63522	NC_003366	TA	3	6	2831415	2831420	50 %	50 %	0 %	0 %	18311455
63523	NC_003366	T	6	6	2831508	2831513	0 %	100 %	0 %	0 %	18311455
63524	NC_003366	TAT	2	6	2831542	2831547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63525	NC_003366	ACTTT	2	10	2831558	2831567	20 %	60 %	0 %	20 %	18311455
63526	NC_003366	TA	3	6	2831614	2831619	50 %	50 %	0 %	0 %	18311455
63527	NC_003366	ATATGA	2	12	2831641	2831652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18311455
63528	NC_003366	TAG	2	6	2831679	2831684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311455
63529	NC_003366	CTT	2	6	2831721	2831726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311455
63530	NC_003366	CA	3	6	2831739	2831744	50 %	0 %	0 %	50 %	18311455
63531	NC_003366	TAT	2	6	2831745	2831750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63532	NC_003366	T	6	6	2831792	2831797	0 %	100 %	0 %	0 %	18311455
63533	NC_003366	TTA	2	6	2831811	2831816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63534	NC_003366	GAA	2	6	2831820	2831825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311455
63535	NC_003366	TTAATT	2	12	2831873	2831884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63536	NC_003366	T	7	7	2831947	2831953	0 %	100 %	0 %	0 %	18311455
63537	NC_003366	T	6	6	2831958	2831963	0 %	100 %	0 %	0 %	18311455
63538	NC_003366	TTC	2	6	2832057	2832062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311455
63539	NC_003366	ATT	2	6	2832187	2832192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63540	NC_003366	TTA	2	6	2832204	2832209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63541	NC_003366	TGA	2	6	2832233	2832238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311455
63542	NC_003366	TC	3	6	2832242	2832247	0 %	50 %	0 %	50 %	18311455
63543	NC_003366	AT	3	6	2832257	2832262	50 %	50 %	0 %	0 %	18311455
63544	NC_003366	T	6	6	2832323	2832328	0 %	100 %	0 %	0 %	18311455
63545	NC_003366	ATT	2	6	2832355	2832360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63546	NC_003366	T	6	6	2832505	2832510	0 %	100 %	0 %	0 %	18311455
63547	NC_003366	CCAA	2	8	2832536	2832543	50 %	0 %	0 %	50 %	18311455
63548	NC_003366	ATT	2	6	2832562	2832567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63549	NC_003366	TAT	2	6	2832592	2832597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63550	NC_003366	CT	3	6	2832640	2832645	0 %	50 %	0 %	50 %	18311455
63551	NC_003366	TAA	2	6	2832786	2832791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311455
63552	NC_003366	GCT	2	6	2832800	2832805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311455
63553	NC_003366	TTCCAA	2	12	2832840	2832851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311455
63554	NC_003366	TAA	2	6	2832856	2832861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311455
63555	NC_003366	ATAA	2	8	2832866	2832873	75 %	25 %	0 %	0 %	18311455
63556	NC_003366	A	6	6	2832902	2832907	100 %	0 %	0 %	0 %	18311455
63557	NC_003366	TATT	2	8	2832915	2832922	25 %	75 %	0 %	0 %	18311455
63558	NC_003366	TCT	2	6	2832923	2832928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311455
63559	NC_003366	ATA	2	6	2832955	2832960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311455
63560	NC_003366	TA	3	6	2832959	2832964	50 %	50 %	0 %	0 %	18311455
63561	NC_003366	CTA	2	6	2833026	2833031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311455
63562	NC_003366	AAAC	2	8	2833041	2833048	75 %	0 %	0 %	25 %	18311455
63563	NC_003366	TTTA	2	8	2833093	2833100	25 %	75 %	0 %	0 %	18311455
63564	NC_003366	ATT	2	6	2833136	2833141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63565	NC_003366	TTA	2	6	2833166	2833171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311455
63566	NC_003366	CTA	2	6	2833188	2833193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311455
63567	NC_003366	TGA	2	6	2833207	2833212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311455
63568	NC_003366	AT	4	8	2833215	2833222	50 %	50 %	0 %	0 %	18311455
63569	NC_003366	TTTC	2	8	2833223	2833230	0 %	75 %	0 %	25 %	18311455
63570	NC_003366	ACT	2	6	2833283	2833288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311455
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63572	NC_003366	ATA	2	6	2833343	2833348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311455
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63575	NC_003366	ATATT	2	10	2834748	2834757	40 %	60 %	0 %	0 %	18311456
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63579	NC_003366	GTTTT	2	10	2834853	2834862	0 %	80 %	20 %	0 %	18311456
63580	NC_003366	CTTT	2	8	2834870	2834877	0 %	75 %	0 %	25 %	18311456
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63587	NC_003366	CT	3	6	2835015	2835020	0 %	50 %	0 %	50 %	18311456
63588	NC_003366	AT	3	6	2835053	2835058	50 %	50 %	0 %	0 %	18311456
63589	NC_003366	TTCC	2	8	2835074	2835081	0 %	50 %	0 %	50 %	18311456
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63593	NC_003366	T	6	6	2835231	2835236	0 %	100 %	0 %	0 %	18311457
63594	NC_003366	ATT	2	6	2835245	2835250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311457
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63602	NC_003366	TAT	2	6	2835586	2835591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311457
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63607	NC_003366	ATAC	2	8	2835786	2835793	50 %	25 %	0 %	25 %	18311458
63608	NC_003366	ATACAA	2	12	2835828	2835839	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	18311458
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63611	NC_003366	ATTTT	2	10	2835887	2835896	20 %	80 %	0 %	0 %	18311458
63612	NC_003366	CAAA	2	8	2835927	2835934	75 %	0 %	0 %	25 %	18311458
63613	NC_003366	ATT	3	9	2835941	2835949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311458
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63981	NC_003366	TAT	2	6	2851275	2851280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311472
63982	NC_003366	ATC	2	6	2851330	2851335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311472
63983	NC_003366	T	6	6	2851354	2851359	0 %	100 %	0 %	0 %	18311472
63984	NC_003366	CAT	2	6	2851365	2851370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311472
63985	NC_003366	ACA	2	6	2851379	2851384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311472
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