MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62502	NC_003366	TTC	2	6	2781331	2781336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311414
62503	NC_003366	TCC	2	6	2781358	2781363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311414
62504	NC_003366	TAT	2	6	2781381	2781386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311414
62505	NC_003366	AAG	2	6	2781402	2781407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311414
62506	NC_003366	ATT	2	6	2781419	2781424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311414
62507	NC_003366	T	8	8	2781432	2781439	0 %	100 %	0 %	0 %	18311414
62508	NC_003366	TCA	3	9	2781443	2781451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311414
62509	NC_003366	AAC	2	6	2781575	2781580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311415
62510	NC_003366	T	6	6	2781598	2781603	0 %	100 %	0 %	0 %	18311415
62511	NC_003366	ACA	2	6	2781672	2781677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311415
62512	NC_003366	AGCT	2	8	2781691	2781698	25 %	25 %	25 %	25 %	18311415
62513	NC_003366	CTG	2	6	2781745	2781750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311415
62514	NC_003366	TCC	2	6	2781770	2781775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311415
62515	NC_003366	TAC	2	6	2781776	2781781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311415
62516	NC_003366	TAT	2	6	2781799	2781804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311415
62517	NC_003366	T	8	8	2781821	2781828	0 %	100 %	0 %	0 %	18311415
62518	NC_003366	TTC	2	6	2781880	2781885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311415
62519	NC_003366	TTCC	2	8	2781946	2781953	0 %	50 %	0 %	50 %	18311415
62520	NC_003366	CTT	2	6	2781976	2781981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311415
62521	NC_003366	TTC	2	6	2782115	2782120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311415
62522	NC_003366	ATA	2	6	2782141	2782146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311415
62523	NC_003366	CCA	2	6	2782153	2782158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311415
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62525	NC_003366	T	6	6	2782230	2782235	0 %	100 %	0 %	0 %	18311415
62526	NC_003366	GAA	2	6	2782299	2782304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311415
62527	NC_003366	TTGT	2	8	2782321	2782328	0 %	75 %	25 %	0 %	18311415
62528	NC_003366	TAT	3	9	2782337	2782345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311415
62529	NC_003366	TA	3	6	2782367	2782372	50 %	50 %	0 %	0 %	18311415
62530	NC_003366	TA	3	6	2782406	2782411	50 %	50 %	0 %	0 %	18311415
62531	NC_003366	TTC	2	6	2782415	2782420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311415
62532	NC_003366	TTATTT	2	12	2782447	2782458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	18311415
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62534	NC_003366	TTC	2	6	2782469	2782474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311415
62535	NC_003366	T	7	7	2782502	2782508	0 %	100 %	0 %	0 %	18311415
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62540	NC_003366	ATT	2	6	2782760	2782765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311415
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62542	NC_003366	ACAT	2	8	2782817	2782824	50 %	25 %	0 %	25 %	18311415
62543	NC_003366	AT	3	6	2782823	2782828	50 %	50 %	0 %	0 %	18311415
62544	NC_003366	TAA	2	6	2783103	2783108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311416
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62550	NC_003366	T	7	7	2783249	2783255	0 %	100 %	0 %	0 %	18311416
62551	NC_003366	ATT	2	6	2783263	2783268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311416
62552	NC_003366	CCA	2	6	2783269	2783274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311416
62553	NC_003366	CAT	2	6	2783303	2783308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311416
62554	NC_003366	TCC	2	6	2783451	2783456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311416
62555	NC_003366	CTT	2	6	2783492	2783497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311416
62556	NC_003366	TAT	2	6	2783531	2783536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311416
62557	NC_003366	TAA	2	6	2783681	2783686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311416
62558	NC_003366	CCA	2	6	2783713	2783718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311416
62559	NC_003366	CT	3	6	2783837	2783842	0 %	50 %	0 %	50 %	18311417
62560	NC_003366	AT	4	8	2783863	2783870	50 %	50 %	0 %	0 %	18311417
62561	NC_003366	ATT	2	6	2783904	2783909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311417
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62563	NC_003366	TCA	2	6	2783988	2783993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311417
62564	NC_003366	ATT	2	6	2783997	2784002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311417
62565	NC_003366	GCT	2	6	2784006	2784011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311417
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62567	NC_003366	TCT	2	6	2784048	2784053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311417
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62572	NC_003366	TA	3	6	2784175	2784180	50 %	50 %	0 %	0 %	18311417
62573	NC_003366	T	6	6	2784181	2784186	0 %	100 %	0 %	0 %	18311417
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62601	NC_003366	TGGTC	2	10	2785458	2785467	0 %	40 %	40 %	20 %	18311420
62602	NC_003366	TTA	2	6	2785512	2785517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311420
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