MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 33995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002971	A	6	6	241904	241909	100 %	0 %	0 %	0 %	29653622
4002	NC_002971	AG	3	6	241915	241920	50 %	0 %	50 %	0 %	29653622
4003	NC_002971	TAAA	2	8	241970	241977	75 %	25 %	0 %	0 %	29653622
4004	NC_002971	GGT	2	6	242010	242015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653622
4005	NC_002971	TA	3	6	242021	242026	50 %	50 %	0 %	0 %	29653622
4006	NC_002971	TGA	2	6	242160	242165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653622
4007	NC_002971	TGGTTT	2	12	242286	242297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653622
4008	NC_002971	GA	3	6	242314	242319	50 %	0 %	50 %	0 %	29653622
4009	NC_002971	ATC	3	9	242403	242411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653623
4010	NC_002971	GTC	2	6	242430	242435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653623
4011	NC_002971	GCT	2	6	242454	242459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653623
4012	NC_002971	CCG	3	9	242524	242532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653623
4013	NC_002971	AAT	2	6	242562	242567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653623
4014	NC_002971	TA	3	6	242631	242636	50 %	50 %	0 %	0 %	29653623
4015	NC_002971	AAAG	2	8	242688	242695	75 %	0 %	25 %	0 %	29653623
4016	NC_002971	ACGTT	2	10	242768	242777	20 %	40 %	20 %	20 %	29653623
4017	NC_002971	TTTA	2	8	242847	242854	25 %	75 %	0 %	0 %	29653623
4018	NC_002971	ATT	2	6	242978	242983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653624
4019	NC_002971	T	7	7	242982	242988	0 %	100 %	0 %	0 %	29653624
4020	NC_002971	TAAAT	2	10	243002	243011	60 %	40 %	0 %	0 %	29653624
4021	NC_002971	ATC	2	6	243097	243102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653624
4022	NC_002971	AGG	2	6	243130	243135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653624
4023	NC_002971	AAAT	2	8	243165	243172	75 %	25 %	0 %	0 %	29653624
4024	NC_002971	A	7	7	243186	243192	100 %	0 %	0 %	0 %	29653624
4025	NC_002971	GCC	2	6	243241	243246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653624
4026	NC_002971	ACAA	2	8	243374	243381	75 %	0 %	0 %	25 %	29653624
4027	NC_002971	A	6	6	243412	243417	100 %	0 %	0 %	0 %	29653624
4028	NC_002971	ATA	2	6	243458	243463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653624
4029	NC_002971	A	7	7	243463	243469	100 %	0 %	0 %	0 %	29653624
4030	NC_002971	T	7	7	243485	243491	0 %	100 %	0 %	0 %	29653624
4031	NC_002971	CAT	2	6	243511	243516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653624
4032	NC_002971	ATA	2	6	243536	243541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653624
4033	NC_002971	AAGTA	2	10	243545	243554	60 %	20 %	20 %	0 %	29653624
4034	NC_002971	AATGC	2	10	243628	243637	40 %	20 %	20 %	20 %	29653624
4035	NC_002971	ACC	2	6	243752	243757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653624
4036	NC_002971	AGA	2	6	243764	243769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653624
4037	NC_002971	AAGC	2	8	243789	243796	50 %	0 %	25 %	25 %	29653624
4038	NC_002971	A	6	6	243804	243809	100 %	0 %	0 %	0 %	29653624
4039	NC_002971	TGA	2	6	243834	243839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653624
4040	NC_002971	CCA	2	6	243888	243893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653624
4041	NC_002971	TGC	2	6	243954	243959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653624
4042	NC_002971	AAT	2	6	243994	243999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653624
4043	NC_002971	CAGTAA	2	12	244045	244056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29653624
4044	NC_002971	A	7	7	244117	244123	100 %	0 %	0 %	0 %	29653624
4045	NC_002971	ATA	2	6	244247	244252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653624
4046	NC_002971	GCC	2	6	244253	244258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653624
4047	NC_002971	TG	3	6	244285	244290	0 %	50 %	50 %	0 %	29653624
4048	NC_002971	TCA	2	6	244421	244426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653625
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4051	NC_002971	GCAA	2	8	244479	244486	50 %	0 %	25 %	25 %	29653625
4052	NC_002971	AG	3	6	244498	244503	50 %	0 %	50 %	0 %	29653625
4053	NC_002971	T	7	7	244508	244514	0 %	100 %	0 %	0 %	29653625
4054	NC_002971	CAA	2	6	244579	244584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653625
4055	NC_002971	TAT	2	6	244675	244680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653625
4056	NC_002971	A	6	6	244713	244718	100 %	0 %	0 %	0 %	29653625
4057	NC_002971	CA	3	6	244747	244752	50 %	0 %	0 %	50 %	29653625
4058	NC_002971	CAGG	2	8	244783	244790	25 %	0 %	50 %	25 %	29653625
4059	NC_002971	CCAAT	2	10	244797	244806	40 %	20 %	0 %	40 %	29653625
4060	NC_002971	ACA	3	9	244843	244851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653625
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4062	NC_002971	TCC	2	6	244955	244960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653625
4063	NC_002971	A	7	7	244984	244990	100 %	0 %	0 %	0 %	29653625
4064	NC_002971	TA	3	6	245025	245030	50 %	50 %	0 %	0 %	29653625
4065	NC_002971	CAATT	2	10	245383	245392	40 %	40 %	0 %	20 %	29653626
4066	NC_002971	GAA	2	6	245417	245422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653626
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4092	NC_002971	CCTG	2	8	246656	246663	0 %	25 %	25 %	50 %	29653626
4093	NC_002971	T	6	6	246699	246704	0 %	100 %	0 %	0 %	29653626
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4097	NC_002971	AACG	2	8	246945	246952	50 %	0 %	25 %	25 %	29653626
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4100	NC_002971	CGCT	2	8	247128	247135	0 %	25 %	25 %	50 %	29653626
4101	NC_002971	A	7	7	247158	247164	100 %	0 %	0 %	0 %	29653626
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4103	NC_002971	CT	3	6	247205	247210	0 %	50 %	0 %	50 %	29653626
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4108	NC_002971	GCAAC	2	10	247365	247374	40 %	0 %	20 %	40 %	29653626
4109	NC_002971	ATT	2	6	247511	247516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653626
4110	NC_002971	CG	5	10	247534	247543	0 %	0 %	50 %	50 %	29653626
4111	NC_002971	GTTTTA	2	12	247561	247572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29653626
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4113	NC_002971	A	6	6	247718	247723	100 %	0 %	0 %	0 %	29653626
4114	NC_002971	ATG	2	6	247729	247734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653626
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4117	NC_002971	T	6	6	247767	247772	0 %	100 %	0 %	0 %	29653626
4118	NC_002971	GA	3	6	247912	247917	50 %	0 %	50 %	0 %	29653626
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4375	NC_002971	GTA	2	6	262156	262161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653646
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