MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 33995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002971	GA	3	6	215729	215734	50 %	0 %	50 %	0 %	29653584
3502	NC_002971	AC	3	6	215762	215767	50 %	0 %	0 %	50 %	29653584
3503	NC_002971	AGA	2	6	215807	215812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
3504	NC_002971	GTTC	2	8	215814	215821	0 %	50 %	25 %	25 %	29653584
3505	NC_002971	GTGAA	2	10	215833	215842	40 %	20 %	40 %	0 %	29653584
3506	NC_002971	A	6	6	215841	215846	100 %	0 %	0 %	0 %	29653584
3507	NC_002971	ATTA	2	8	215856	215863	50 %	50 %	0 %	0 %	29653584
3508	NC_002971	ATT	2	6	215891	215896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653584
3509	NC_002971	AGA	2	6	216209	216214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
3510	NC_002971	CCTA	2	8	216217	216224	25 %	25 %	0 %	50 %	29653584
3511	NC_002971	AGA	2	6	216233	216238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
3512	NC_002971	GAT	2	6	216246	216251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653584
3513	NC_002971	A	6	6	216369	216374	100 %	0 %	0 %	0 %	29653584
3514	NC_002971	GAT	2	6	216434	216439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653584
3515	NC_002971	CCG	2	6	216462	216467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653584
3516	NC_002971	TGG	2	6	216494	216499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653584
3517	NC_002971	AAC	2	6	216552	216557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653584
3518	NC_002971	GTT	2	6	216569	216574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653584
3519	NC_002971	CAT	2	6	216593	216598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653584
3520	NC_002971	AAG	2	6	216625	216630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
3521	NC_002971	CGGC	2	8	216653	216660	0 %	0 %	50 %	50 %	29653584
3522	NC_002971	CCG	2	6	216686	216691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653584
3523	NC_002971	ATT	2	6	216769	216774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653584
3524	NC_002971	TCG	2	6	216790	216795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653584
3525	NC_002971	GAA	2	6	216833	216838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
3526	NC_002971	GCT	2	6	216912	216917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653584
3527	NC_002971	GAA	2	6	216963	216968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
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3529	NC_002971	TGG	2	6	217048	217053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653584
3530	NC_002971	GC	3	6	217164	217169	0 %	0 %	50 %	50 %	29653584
3531	NC_002971	TGA	2	6	217174	217179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653584
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3533	NC_002971	GTG	2	6	217242	217247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653584
3534	NC_002971	TTA	2	6	217256	217261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653584
3535	NC_002971	AAG	2	6	217318	217323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
3536	NC_002971	AAG	2	6	217384	217389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
3537	NC_002971	AGA	2	6	217415	217420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
3538	NC_002971	CCG	3	9	217441	217449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653584
3539	NC_002971	TAT	2	6	217459	217464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653584
3540	NC_002971	A	6	6	217518	217523	100 %	0 %	0 %	0 %	29653584
3541	NC_002971	ACC	2	6	217572	217577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653584
3542	NC_002971	GTC	2	6	217659	217664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653584
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3545	NC_002971	TGAT	2	8	217771	217778	25 %	50 %	25 %	0 %	29653584
3546	NC_002971	GAT	2	6	217814	217819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653584
3547	NC_002971	A	6	6	217822	217827	100 %	0 %	0 %	0 %	29653584
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3549	NC_002971	ATG	2	6	217896	217901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653584
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3551	NC_002971	GC	3	6	218061	218066	0 %	0 %	50 %	50 %	29653584
3552	NC_002971	GTC	2	6	218148	218153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653584
3553	NC_002971	ATG	2	6	218190	218195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653584
3554	NC_002971	GC	3	6	218436	218441	0 %	0 %	50 %	50 %	29653584
3555	NC_002971	GTT	2	6	218448	218453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653584
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3557	NC_002971	GCC	2	6	218481	218486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653584
3558	NC_002971	TGC	2	6	218543	218548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653584
3559	NC_002971	AAT	2	6	218568	218573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653584
3560	NC_002971	GTGAAC	2	12	218695	218706	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	29653584
3561	NC_002971	CGA	2	6	218876	218881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653584
3562	NC_002971	CCA	2	6	218914	218919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653584
3563	NC_002971	ATG	3	9	218977	218985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653584
3564	NC_002971	CGGG	2	8	218998	219005	0 %	0 %	75 %	25 %	29653584
3565	NC_002971	CTT	2	6	219023	219028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653584
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3567	NC_002971	GAAG	2	8	219050	219057	50 %	0 %	50 %	0 %	29653584
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3570	NC_002971	AATT	2	8	219286	219293	50 %	50 %	0 %	0 %	29653584
3571	NC_002971	TTC	2	6	219382	219387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653584
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3573	NC_002971	GAA	2	6	219582	219587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653584
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3575	NC_002971	A	6	6	219603	219608	100 %	0 %	0 %	0 %	29653584
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3583	NC_002971	GCGA	2	8	219888	219895	25 %	0 %	50 %	25 %	29653584
3584	NC_002971	CCGCA	2	10	219931	219940	20 %	0 %	20 %	60 %	29653584
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3588	NC_002971	AATC	2	8	220321	220328	50 %	25 %	0 %	25 %	215918920
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3591	NC_002971	ACT	2	6	220430	220435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918920
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3594	NC_002971	CGTT	2	8	220588	220595	0 %	50 %	25 %	25 %	215918920
3595	NC_002971	CGTG	2	8	220603	220610	0 %	25 %	50 %	25 %	215918920
3596	NC_002971	CGG	2	6	220623	220628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918920
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3600	NC_002971	GA	3	6	220728	220733	50 %	0 %	50 %	0 %	29653586
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3603	NC_002971	GC	3	6	220833	220838	0 %	0 %	50 %	50 %	29653586
3604	NC_002971	TGT	2	6	220843	220848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653586
3605	NC_002971	AAAT	2	8	220864	220871	75 %	25 %	0 %	0 %	29653586
3606	NC_002971	GCGG	2	8	220913	220920	0 %	0 %	75 %	25 %	29653586
3607	NC_002971	A	6	6	220924	220929	100 %	0 %	0 %	0 %	29653586
3608	NC_002971	TGA	2	6	220954	220959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653586
3609	NC_002971	GC	4	8	220964	220971	0 %	0 %	50 %	50 %	29653586
3610	NC_002971	TCGCG	2	10	221033	221042	0 %	20 %	40 %	40 %	29653586
3611	NC_002971	GC	3	6	221084	221089	0 %	0 %	50 %	50 %	29653586
3612	NC_002971	A	6	6	221142	221147	100 %	0 %	0 %	0 %	29653586
3613	NC_002971	GGC	2	6	221198	221203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653586
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3618	NC_002971	TGGAT	2	10	221439	221448	20 %	40 %	40 %	0 %	29653587
3619	NC_002971	CTA	2	6	221490	221495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653587
3620	NC_002971	GCTGTC	2	12	221615	221626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653587
3621	NC_002971	CAA	2	6	221713	221718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653587
3622	NC_002971	CG	3	6	221726	221731	0 %	0 %	50 %	50 %	29653587
3623	NC_002971	GGT	2	6	221749	221754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653587
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3625	NC_002971	GAA	2	6	221816	221821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653587
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3998	NC_002971	TGA	2	6	241755	241760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653622
3999	NC_002971	GTT	2	6	241782	241787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653622
4000	NC_002971	ACTC	2	8	241848	241855	25 %	25 %	0 %	50 %	29653622

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