MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 33995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002971	T	6	6	725287	725292	0 %	100 %	0 %	0 %	29654111
12502	NC_002971	AAG	2	6	725310	725315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29654111
12503	NC_002971	ATT	3	9	725356	725364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654111
12504	NC_002971	TGC	2	6	725413	725418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654111
12505	NC_002971	CCTTA	2	10	725431	725440	20 %	40 %	0 %	40 %	29654111
12506	NC_002971	TAT	3	9	725449	725457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654111
12507	NC_002971	AAAT	2	8	726639	726646	75 %	25 %	0 %	0 %	29654112
12508	NC_002971	TGC	2	6	726658	726663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654112
12509	NC_002971	CCA	2	6	726677	726682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29654112
12510	NC_002971	TTTA	2	8	726989	726996	25 %	75 %	0 %	0 %	215919043
12511	NC_002971	ATT	2	6	727007	727012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919043
12512	NC_002971	TTA	2	6	727076	727081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919043
12513	NC_002971	C	6	6	727181	727186	0 %	0 %	0 %	100 %	215919043
12514	NC_002971	GAA	2	6	727242	727247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215919043
12515	NC_002971	GCT	2	6	727259	727264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215919043
12516	NC_002971	GCTT	2	8	727463	727470	0 %	50 %	25 %	25 %	215919043
12517	NC_002971	CAC	2	6	727529	727534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215919043
12518	NC_002971	GCA	2	6	727545	727550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215919043
12519	NC_002971	CCT	2	6	727596	727601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215919043
12520	NC_002971	GGA	2	6	727686	727691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215919043
12521	NC_002971	TAT	2	6	727746	727751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919043
12522	NC_002971	CAAA	2	8	727752	727759	75 %	0 %	0 %	25 %	215919043
12523	NC_002971	A	6	6	727757	727762	100 %	0 %	0 %	0 %	215919043
12524	NC_002971	TGAA	2	8	727786	727793	50 %	25 %	25 %	0 %	215919043
12525	NC_002971	AAC	2	6	727828	727833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919043
12526	NC_002971	TCA	2	6	727841	727846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919043
12527	NC_002971	CTA	2	6	727855	727860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919043
12528	NC_002971	TAGAA	2	10	727868	727877	60 %	20 %	20 %	0 %	215919043
12529	NC_002971	GCT	2	6	727884	727889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215919043
12530	NC_002971	A	6	6	727953	727958	100 %	0 %	0 %	0 %	215919043
12531	NC_002971	ATG	2	6	727960	727965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215919043
12532	NC_002971	CTG	2	6	727969	727974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215919043
12533	NC_002971	AGC	2	6	727997	728002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215919043
12534	NC_002971	CAA	2	6	728004	728009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919043
12535	NC_002971	T	7	7	728012	728018	0 %	100 %	0 %	0 %	215919043
12536	NC_002971	TGC	2	6	728069	728074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215919043
12537	NC_002971	CTGC	2	8	728103	728110	0 %	25 %	25 %	50 %	215919043
12538	NC_002971	ATG	2	6	728134	728139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215919043
12539	NC_002971	A	6	6	728246	728251	100 %	0 %	0 %	0 %	215919044
12540	NC_002971	TCA	2	6	728354	728359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919044
12541	NC_002971	GA	3	6	728362	728367	50 %	0 %	50 %	0 %	215919044
12542	NC_002971	GCG	2	6	728384	728389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215919044
12543	NC_002971	TTAT	2	8	728441	728448	25 %	75 %	0 %	0 %	215919044
12544	NC_002971	ATT	2	6	728487	728492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919044
12545	NC_002971	TTA	2	6	728532	728537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919044
12546	NC_002971	AAT	2	6	728538	728543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215919044
12547	NC_002971	CT	3	6	728560	728565	0 %	50 %	0 %	50 %	215919044
12548	NC_002971	ATT	2	6	728584	728589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919044
12549	NC_002971	TGA	2	6	728597	728602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215919044
12550	NC_002971	ATG	2	6	728617	728622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215919044
12551	NC_002971	ATTTA	2	10	728647	728656	40 %	60 %	0 %	0 %	215919044
12552	NC_002971	T	6	6	728722	728727	0 %	100 %	0 %	0 %	215919044
12553	NC_002971	ATTTTT	2	12	728763	728774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	215919044
12554	NC_002971	TTC	2	6	728777	728782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919044
12555	NC_002971	AAGCG	2	10	728852	728861	40 %	0 %	40 %	20 %	215919044
12556	NC_002971	TCA	2	6	728888	728893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919044
12557	NC_002971	A	8	8	728965	728972	100 %	0 %	0 %	0 %	215919044
12558	NC_002971	TCT	2	6	728985	728990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919044
12559	NC_002971	TGA	2	6	729001	729006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215919044
12560	NC_002971	ATT	2	6	729020	729025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919044
12561	NC_002971	GGT	2	6	729043	729048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215919044
12562	NC_002971	AAC	2	6	729098	729103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919044
12563	NC_002971	ACG	2	6	729114	729119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215919044
12564	NC_002971	TCT	2	6	729122	729127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919044
12565	NC_002971	TGT	2	6	729200	729205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215919044
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12567	NC_002971	GTT	2	6	729248	729253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215919044
12568	NC_002971	TTGC	2	8	729271	729278	0 %	50 %	25 %	25 %	215919044
12569	NC_002971	TTA	2	6	729281	729286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919044
12570	NC_002971	CTG	2	6	729334	729339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215919044
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12573	NC_002971	CAA	2	6	729612	729617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919044
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12579	NC_002971	CGT	2	6	729845	729850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654116
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12587	NC_002971	T	6	6	730222	730227	0 %	100 %	0 %	0 %	29654116
12588	NC_002971	GCA	2	6	730263	730268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654116
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12591	NC_002971	CTTG	2	8	730555	730562	0 %	50 %	25 %	25 %	29654116
12592	NC_002971	CAA	2	6	730564	730569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29654116
12593	NC_002971	CTT	2	6	730574	730579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29654116
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12596	NC_002971	TATC	2	8	730641	730648	25 %	50 %	0 %	25 %	29654116
12597	NC_002971	GTC	2	6	730682	730687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654116
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12600	NC_002971	AGGA	2	8	730856	730863	50 %	0 %	50 %	0 %	29654116
12601	NC_002971	ATTGC	2	10	730866	730875	20 %	40 %	20 %	20 %	29654116
12602	NC_002971	AC	3	6	730933	730938	50 %	0 %	0 %	50 %	29654116
12603	NC_002971	GCT	2	6	731068	731073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29654116
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12605	NC_002971	CAA	2	6	731116	731121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29654116
12606	NC_002971	CCG	2	6	731125	731130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29654116
12607	NC_002971	TC	3	6	731131	731136	0 %	50 %	0 %	50 %	29654116
12608	NC_002971	ACCCA	2	10	731148	731157	40 %	0 %	0 %	60 %	29654116
12609	NC_002971	TCT	2	6	731199	731204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29654116
12610	NC_002971	GAA	2	6	731287	731292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29654116
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12612	NC_002971	AGA	2	6	731358	731363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29654116
12613	NC_002971	TAATT	2	10	731385	731394	40 %	60 %	0 %	0 %	29654116
12614	NC_002971	ACA	2	6	731409	731414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29654116
12615	NC_002971	TTGC	2	8	731431	731438	0 %	50 %	25 %	25 %	29654116
12616	NC_002971	TG	4	8	731496	731503	0 %	50 %	50 %	0 %	29654116
12617	NC_002971	GAAAAA	2	12	731539	731550	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	29654116
12618	NC_002971	A	8	8	731586	731593	100 %	0 %	0 %	0 %	29654116
12619	NC_002971	AAAG	2	8	731745	731752	75 %	0 %	25 %	0 %	29654116
12620	NC_002971	ATTTT	2	10	731806	731815	20 %	80 %	0 %	0 %	29654116
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12991	NC_002971	T	7	7	754660	754666	0 %	100 %	0 %	0 %	215919049
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