MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 33995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_002971	TAA	2	6	615484	615489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654011
10502	NC_002971	TAT	2	6	615582	615587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654011
10503	NC_002971	ATTCC	2	10	615617	615626	20 %	40 %	0 %	40 %	29654011
10504	NC_002971	GAC	2	6	615646	615651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654011
10505	NC_002971	T	6	6	615692	615697	0 %	100 %	0 %	0 %	29654011
10506	NC_002971	AAC	2	6	615766	615771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29654011
10507	NC_002971	ATC	2	6	615912	615917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919016
10508	NC_002971	ACGG	2	8	615919	615926	25 %	0 %	50 %	25 %	215919016
10509	NC_002971	AAT	3	9	615927	615935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215919016
10510	NC_002971	TCC	2	6	615963	615968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215919016
10511	NC_002971	GCATT	2	10	615997	616006	20 %	40 %	20 %	20 %	215919016
10512	NC_002971	T	7	7	616048	616054	0 %	100 %	0 %	0 %	215919016
10513	NC_002971	CCG	2	6	616066	616071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215919016
10514	NC_002971	ATA	2	6	616076	616081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215919016
10515	NC_002971	CAT	2	6	616091	616096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215919016
10516	NC_002971	AGA	2	6	616130	616135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215919016
10517	NC_002971	GCG	2	6	616252	616257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215919016
10518	NC_002971	AATA	2	8	616275	616282	75 %	25 %	0 %	0 %	215919016
10519	NC_002971	ATTGCG	2	12	616290	616301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	215919016
10520	NC_002971	T	6	6	616334	616339	0 %	100 %	0 %	0 %	215919016
10521	NC_002971	TTGAT	2	10	616345	616354	20 %	60 %	20 %	0 %	215919016
10522	NC_002971	CTT	2	6	616361	616366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919016
10523	NC_002971	AAC	2	6	616381	616386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215919016
10524	NC_002971	AC	3	6	616401	616406	50 %	0 %	0 %	50 %	215919016
10525	NC_002971	TGAAT	2	10	616432	616441	40 %	40 %	20 %	0 %	29654013
10526	NC_002971	TGT	2	6	616535	616540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29654013
10527	NC_002971	ATG	2	6	616552	616557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654013
10528	NC_002971	AAT	2	6	616581	616586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654013
10529	NC_002971	CTA	2	6	616640	616645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654013
10530	NC_002971	CTGC	2	8	616699	616706	0 %	25 %	25 %	50 %	29654013
10531	NC_002971	ATC	2	6	616731	616736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654013
10532	NC_002971	TGAG	2	8	616767	616774	25 %	25 %	50 %	0 %	29654013
10533	NC_002971	TCC	2	6	616807	616812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29654013
10534	NC_002971	GAT	2	6	616824	616829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654013
10535	NC_002971	TTAGTA	2	12	616849	616860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	29654013
10536	NC_002971	TCA	2	6	616933	616938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29654013
10537	NC_002971	GAGC	2	8	616976	616983	25 %	0 %	50 %	25 %	29654013
10538	NC_002971	CGA	2	6	617009	617014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29654013
10539	NC_002971	GTTG	2	8	617040	617047	0 %	50 %	50 %	0 %	29654013
10540	NC_002971	AT	3	6	617059	617064	50 %	50 %	0 %	0 %	29654013
10541	NC_002971	AGG	2	6	617365	617370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29654014
10542	NC_002971	T	6	6	617447	617452	0 %	100 %	0 %	0 %	29654014
10543	NC_002971	GAT	2	6	617456	617461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654014
10544	NC_002971	TTG	2	6	617493	617498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29654014
10545	NC_002971	ATG	2	6	617580	617585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654014
10546	NC_002971	AATT	2	8	617620	617627	50 %	50 %	0 %	0 %	29654014
10547	NC_002971	CTT	2	6	617691	617696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29654014
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10549	NC_002971	AATA	2	8	617771	617778	75 %	25 %	0 %	0 %	29654014
10550	NC_002971	TG	3	6	617787	617792	0 %	50 %	50 %	0 %	29654014
10551	NC_002971	TTA	2	6	617798	617803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654014
10552	NC_002971	TAA	4	12	617920	617931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29654014
10553	NC_002971	TG	3	6	617985	617990	0 %	50 %	50 %	0 %	29654014
10554	NC_002971	TTA	2	6	618005	618010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654014
10555	NC_002971	GTT	2	6	618011	618016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29654014
10556	NC_002971	A	6	6	618024	618029	100 %	0 %	0 %	0 %	29654014
10557	NC_002971	GA	3	6	618036	618041	50 %	0 %	50 %	0 %	29654014
10558	NC_002971	AAAT	2	8	618061	618068	75 %	25 %	0 %	0 %	29654014
10559	NC_002971	AGA	3	9	618106	618114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29654014
10560	NC_002971	GACG	2	8	618154	618161	25 %	0 %	50 %	25 %	29654014
10561	NC_002971	CGAAG	2	10	618214	618223	40 %	0 %	40 %	20 %	29654014
10562	NC_002971	AGA	2	6	618232	618237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29654014
10563	NC_002971	CAA	2	6	618295	618300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29654014
10564	NC_002971	TGA	2	6	618344	618349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29654014
10565	NC_002971	GGA	2	6	618373	618378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215919017
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10567	NC_002971	ATT	2	6	618626	618631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215919017
10568	NC_002971	GC	5	10	618671	618680	0 %	0 %	50 %	50 %	215919017
10569	NC_002971	A	6	6	618691	618696	100 %	0 %	0 %	0 %	215919017
10570	NC_002971	CTT	2	6	618710	618715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215919017
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10592	NC_002971	CG	3	6	619910	619915	0 %	0 %	50 %	50 %	29654016
10593	NC_002971	ATGAA	2	10	619920	619929	60 %	20 %	20 %	0 %	29654016
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10604	NC_002971	TTAA	2	8	620249	620256	50 %	50 %	0 %	0 %	29654016
10605	NC_002971	ACA	2	6	620322	620327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29654016
10606	NC_002971	TGT	2	6	620338	620343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29654016
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10609	NC_002971	TTA	2	6	620629	620634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29654016
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10613	NC_002971	GCTT	2	8	620740	620747	0 %	50 %	25 %	25 %	29654016
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10620	NC_002971	T	6	6	620986	620991	0 %	100 %	0 %	0 %	29654017
10621	NC_002971	GGC	2	6	621081	621086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29654017
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