MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_002491	TGT	2	6	1221715	1221720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836601
22502	NC_002491	CCT	2	6	1221754	1221759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836601
22503	NC_002491	TCT	2	6	1221775	1221780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836601
22504	NC_002491	TGG	2	6	1221792	1221797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836601
22505	NC_002491	ATA	2	6	1221810	1221815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836601
22506	NC_002491	ACAATT	2	12	1221816	1221827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15836601
22507	NC_002491	TCA	3	9	1222308	1222316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836602
22508	NC_002491	TCT	3	9	1222329	1222337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836602
22509	NC_002491	T	6	6	1222416	1222421	0 %	100 %	0 %	0 %	15836602
22510	NC_002491	AGA	2	6	1222471	1222476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836602
22511	NC_002491	ATC	2	6	1222490	1222495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836602
22512	NC_002491	ACG	2	6	1222569	1222574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836602
22513	NC_002491	TG	3	6	1222616	1222621	0 %	50 %	50 %	0 %	15836602
22514	NC_002491	TAGAA	2	10	1222625	1222634	60 %	20 %	20 %	0 %	15836602
22515	NC_002491	GCCAT	2	10	1222761	1222770	20 %	20 %	20 %	40 %	15836602
22516	NC_002491	T	7	7	1222781	1222787	0 %	100 %	0 %	0 %	15836602
22517	NC_002491	CGT	2	6	1222859	1222864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836602
22518	NC_002491	AGA	2	6	1222919	1222924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836602
22519	NC_002491	T	6	6	1222954	1222959	0 %	100 %	0 %	0 %	15836602
22520	NC_002491	TTC	2	6	1223132	1223137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836602
22521	NC_002491	T	7	7	1223151	1223157	0 %	100 %	0 %	0 %	15836602
22522	NC_002491	AGC	2	6	1223192	1223197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836602
22523	NC_002491	CT	3	6	1223264	1223269	0 %	50 %	0 %	50 %	15836602
22524	NC_002491	CTT	2	6	1223419	1223424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836602
22525	NC_002491	TCA	2	6	1223445	1223450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836602
22526	NC_002491	TAG	2	6	1223497	1223502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836602
22527	NC_002491	AGC	2	6	1223519	1223524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836602
22528	NC_002491	TCC	2	6	1223525	1223530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836602
22529	NC_002491	CTT	2	6	1223542	1223547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836602
22530	NC_002491	GTT	2	6	1223574	1223579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836602
22531	NC_002491	TCT	2	6	1223580	1223585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836602
22532	NC_002491	GTT	3	9	1223586	1223594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836602
22533	NC_002491	CA	3	6	1223623	1223628	50 %	0 %	0 %	50 %	15836602
22534	NC_002491	ATT	2	6	1223642	1223647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836602
22535	NC_002491	A	7	7	1224319	1224325	100 %	0 %	0 %	0 %	15836603
22536	NC_002491	TG	3	6	1224329	1224334	0 %	50 %	50 %	0 %	15836603
22537	NC_002491	TCA	2	6	1224344	1224349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836603
22538	NC_002491	GCA	2	6	1224388	1224393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836603
22539	NC_002491	AAAGAA	2	12	1224396	1224407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15836603
22540	NC_002491	A	6	6	1224456	1224461	100 %	0 %	0 %	0 %	15836603
22541	NC_002491	ATCA	2	8	1224581	1224588	50 %	25 %	0 %	25 %	15836603
22542	NC_002491	AACG	2	8	1224595	1224602	50 %	0 %	25 %	25 %	15836603
22543	NC_002491	GAA	2	6	1224610	1224615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836603
22544	NC_002491	TCT	2	6	1224721	1224726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836603
22545	NC_002491	ATCT	2	8	1224776	1224783	25 %	50 %	0 %	25 %	15836603
22546	NC_002491	T	6	6	1224854	1224859	0 %	100 %	0 %	0 %	15836603
22547	NC_002491	GA	3	6	1224881	1224886	50 %	0 %	50 %	0 %	15836603
22548	NC_002491	ATT	2	6	1224912	1224917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836603
22549	NC_002491	A	7	7	1224940	1224946	100 %	0 %	0 %	0 %	15836603
22550	NC_002491	T	6	6	1225055	1225060	0 %	100 %	0 %	0 %	15836603
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22552	NC_002491	TA	3	6	1225383	1225388	50 %	50 %	0 %	0 %	15836604
22553	NC_002491	AGC	2	6	1225390	1225395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836604
22554	NC_002491	GCAG	2	8	1225432	1225439	25 %	0 %	50 %	25 %	15836604
22555	NC_002491	AG	3	6	1225454	1225459	50 %	0 %	50 %	0 %	15836604
22556	NC_002491	AG	3	6	1225541	1225546	50 %	0 %	50 %	0 %	15836604
22557	NC_002491	GAA	2	6	1225571	1225576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836604
22558	NC_002491	AG	3	6	1225583	1225588	50 %	0 %	50 %	0 %	15836604
22559	NC_002491	TTTCT	2	10	1225614	1225623	0 %	80 %	0 %	20 %	15836604
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22563	NC_002491	A	7	7	1225854	1225860	100 %	0 %	0 %	0 %	15836604
22564	NC_002491	TGTT	2	8	1225866	1225873	0 %	75 %	25 %	0 %	15836604
22565	NC_002491	CT	3	6	1225876	1225881	0 %	50 %	0 %	50 %	15836604
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22571	NC_002491	A	6	6	1226006	1226011	100 %	0 %	0 %	0 %	15836604
22572	NC_002491	ATTT	2	8	1226018	1226025	25 %	75 %	0 %	0 %	15836604
22573	NC_002491	AGC	2	6	1226052	1226057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836604

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.