MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002491	CAT	2	6	81177	81182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835602
1502	NC_002491	TTA	2	6	81209	81214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835602
1503	NC_002491	GAC	2	6	81263	81268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835602
1504	NC_002491	CCT	2	6	81269	81274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835602
1505	NC_002491	TCG	2	6	81278	81283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835602
1506	NC_002491	G	6	6	81283	81288	0 %	0 %	100 %	0 %	15835602
1507	NC_002491	CAG	2	6	81292	81297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835602
1508	NC_002491	TAC	2	6	81302	81307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835602
1509	NC_002491	CTG	2	6	81328	81333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835602
1510	NC_002491	AAC	2	6	81414	81419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835602
1511	NC_002491	CAA	2	6	81420	81425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835602
1512	NC_002491	TAG	2	6	81466	81471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835602
1513	NC_002491	G	6	6	81526	81531	0 %	0 %	100 %	0 %	15835602
1514	NC_002491	ACA	2	6	81606	81611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835602
1515	NC_002491	TCT	2	6	81618	81623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835602
1516	NC_002491	TAT	2	6	81730	81735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835602
1517	NC_002491	CGG	2	6	81756	81761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15835602
1518	NC_002491	CGC	2	6	81858	81863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15835602
1519	NC_002491	C	7	7	81863	81869	0 %	0 %	0 %	100 %	15835602
1520	NC_002491	TCT	2	6	81883	81888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835602
1521	NC_002491	TTGT	2	8	81972	81979	0 %	75 %	25 %	0 %	15835602
1522	NC_002491	AGA	2	6	81984	81989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835602
1523	NC_002491	ATA	2	6	82101	82106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835602
1524	NC_002491	T	7	7	82109	82115	0 %	100 %	0 %	0 %	15835602
1525	NC_002491	TCA	2	6	82147	82152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835602
1526	NC_002491	CTT	2	6	82244	82249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835602
1527	NC_002491	TCA	2	6	82270	82275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835602
1528	NC_002491	TTC	2	6	82284	82289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835602
1529	NC_002491	GAAG	2	8	82638	82645	50 %	0 %	50 %	0 %	15835603
1530	NC_002491	AAG	2	6	82681	82686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835603
1531	NC_002491	CCT	2	6	82712	82717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835603
1532	NC_002491	TCTA	2	8	82730	82737	25 %	50 %	0 %	25 %	15835603
1533	NC_002491	TAG	3	9	82738	82746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835603
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1535	NC_002491	GAA	2	6	82947	82952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835603
1536	NC_002491	A	6	6	82955	82960	100 %	0 %	0 %	0 %	15835603
1537	NC_002491	GGAAAA	2	12	82970	82981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835603
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1539	NC_002491	GAA	2	6	83002	83007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835603
1540	NC_002491	AGA	3	9	83165	83173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835603
1541	NC_002491	TGGT	2	8	83191	83198	0 %	50 %	50 %	0 %	15835603
1542	NC_002491	TATT	2	8	83202	83209	25 %	75 %	0 %	0 %	15835603
1543	NC_002491	GCGT	2	8	83217	83224	0 %	25 %	50 %	25 %	15835603
1544	NC_002491	CGA	2	6	83246	83251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835603
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1546	NC_002491	AG	3	6	83283	83288	50 %	0 %	50 %	0 %	15835603
1547	NC_002491	A	7	7	83304	83310	100 %	0 %	0 %	0 %	15835603
1548	NC_002491	TTTTC	2	10	83330	83339	0 %	80 %	0 %	20 %	15835603
1549	NC_002491	TTCT	2	8	83361	83368	0 %	75 %	0 %	25 %	15835603
1550	NC_002491	ATG	2	6	83386	83391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835603
1551	NC_002491	T	6	6	83475	83480	0 %	100 %	0 %	0 %	15835603
1552	NC_002491	ATC	2	6	83539	83544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835603
1553	NC_002491	ATT	2	6	83546	83551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835603
1554	NC_002491	GTA	2	6	83569	83574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835603
1555	NC_002491	CTAT	2	8	83626	83633	25 %	50 %	0 %	25 %	15835603
1556	NC_002491	AAC	2	6	83674	83679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835603
1557	NC_002491	AAG	2	6	83680	83685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835603
1558	NC_002491	GCT	2	6	83706	83711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835603
1559	NC_002491	T	7	7	84007	84013	0 %	100 %	0 %	0 %	15835604
1560	NC_002491	GTTT	2	8	84026	84033	0 %	75 %	25 %	0 %	15835604
1561	NC_002491	TC	3	6	84120	84125	0 %	50 %	0 %	50 %	15835604
1562	NC_002491	A	6	6	84266	84271	100 %	0 %	0 %	0 %	15835604
1563	NC_002491	AGA	2	6	84289	84294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835604
1564	NC_002491	T	6	6	84366	84371	0 %	100 %	0 %	0 %	15835604
1565	NC_002491	TTA	2	6	84453	84458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835604
1566	NC_002491	TCC	2	6	84470	84475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835604
1567	NC_002491	TAAA	2	8	84557	84564	75 %	25 %	0 %	0 %	15835604
1568	NC_002491	A	6	6	84562	84567	100 %	0 %	0 %	0 %	15835604
1569	NC_002491	C	9	9	85012	85020	0 %	0 %	0 %	100 %	15835605
1570	NC_002491	TGT	2	6	85065	85070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835605
1571	NC_002491	GCC	2	6	85140	85145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15835605
1572	NC_002491	TGA	2	6	85158	85163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835605
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1577	NC_002491	CT	3	6	85594	85599	0 %	50 %	0 %	50 %	15835605
1578	NC_002491	CT	3	6	85746	85751	0 %	50 %	0 %	50 %	15835605
1579	NC_002491	CA	3	6	85759	85764	50 %	0 %	0 %	50 %	15835605
1580	NC_002491	GA	3	6	85789	85794	50 %	0 %	50 %	0 %	15835605
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1584	NC_002491	GTAT	2	8	86018	86025	25 %	50 %	25 %	0 %	15835605
1585	NC_002491	TTA	2	6	86073	86078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835605
1586	NC_002491	TGC	2	6	86124	86129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835605
1587	NC_002491	CTA	2	6	86248	86253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835605
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1589	NC_002491	AT	3	6	86322	86327	50 %	50 %	0 %	0 %	15835605
1590	NC_002491	ACT	2	6	86332	86337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835605
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1593	NC_002491	TTGT	2	8	86407	86414	0 %	75 %	25 %	0 %	15835605
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1598	NC_002491	CCA	2	6	87330	87335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835606
1599	NC_002491	AAAG	2	8	87348	87355	75 %	0 %	25 %	0 %	15835606
1600	NC_002491	A	8	8	87374	87381	100 %	0 %	0 %	0 %	15835606
1601	NC_002491	TAAA	2	8	87433	87440	75 %	25 %	0 %	0 %	15835606
1602	NC_002491	A	8	8	87480	87487	100 %	0 %	0 %	0 %	15835606
1603	NC_002491	CTT	2	6	87566	87571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835606
1604	NC_002491	GAA	2	6	87588	87593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835606
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1611	NC_002491	TTG	2	6	87766	87771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835607
1612	NC_002491	ATA	2	6	87791	87796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835607
1613	NC_002491	AAT	2	6	87814	87819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835607
1614	NC_002491	ATC	2	6	87820	87825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835607
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1616	NC_002491	TCAAG	2	10	87840	87849	40 %	20 %	20 %	20 %	15835607
1617	NC_002491	AGTTT	2	10	87909	87918	20 %	60 %	20 %	0 %	15835607
1618	NC_002491	AAG	2	6	87921	87926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835607
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1623	NC_002491	GC	3	6	88111	88116	0 %	0 %	50 %	50 %	15835607
1624	NC_002491	ATC	2	6	88217	88222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835607
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