MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_002491	TCAGGG	2	12	866804	866815	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15836302
16003	NC_002491	TGAT	2	8	866858	866865	25 %	50 %	25 %	0 %	15836302
16004	NC_002491	TAA	2	6	866992	866997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836302
16005	NC_002491	CTA	2	6	867030	867035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836302
16006	NC_002491	TCT	2	6	867691	867696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836303
16007	NC_002491	TGA	3	9	867699	867707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836303
16008	NC_002491	GATT	2	8	867731	867738	25 %	50 %	25 %	0 %	15836303
16009	NC_002491	AGA	3	9	867747	867755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836303
16010	NC_002491	ATGCT	2	10	867782	867791	20 %	40 %	20 %	20 %	15836303
16011	NC_002491	CGT	2	6	867815	867820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836303
16012	NC_002491	CTCTA	2	10	867874	867883	20 %	40 %	0 %	40 %	15836303
16013	NC_002491	AAT	2	6	867928	867933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836303
16014	NC_002491	GA	3	6	868136	868141	50 %	0 %	50 %	0 %	15836303
16015	NC_002491	TAT	2	6	868151	868156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836303
16016	NC_002491	TTTAGG	2	12	868167	868178	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15836303
16017	NC_002491	T	6	6	868233	868238	0 %	100 %	0 %	0 %	15836303
16018	NC_002491	TGC	2	6	868322	868327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836303
16019	NC_002491	TTTAAC	2	12	868451	868462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15836303
16020	NC_002491	TGA	2	6	868492	868497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836304
16021	NC_002491	T	6	6	868514	868519	0 %	100 %	0 %	0 %	15836304
16022	NC_002491	GCAG	2	8	868529	868536	25 %	0 %	50 %	25 %	15836304
16023	NC_002491	TTG	2	6	868785	868790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836304
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16025	NC_002491	TAA	2	6	868858	868863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836304
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16027	NC_002491	GA	3	6	868965	868970	50 %	0 %	50 %	0 %	15836304
16028	NC_002491	CTT	2	6	868983	868988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836304
16029	NC_002491	A	6	6	869085	869090	100 %	0 %	0 %	0 %	15836304
16030	NC_002491	GCT	2	6	869138	869143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836304
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16032	NC_002491	AG	3	6	869203	869208	50 %	0 %	50 %	0 %	15836304
16033	NC_002491	ATA	2	6	869222	869227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836304
16034	NC_002491	TCA	2	6	869247	869252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836304
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16036	NC_002491	GAG	2	6	869294	869299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836304
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16038	NC_002491	T	6	6	869391	869396	0 %	100 %	0 %	0 %	15836304
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16043	NC_002491	TA	3	6	869541	869546	50 %	50 %	0 %	0 %	15836304
16044	NC_002491	TTC	2	6	869620	869625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836304
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16046	NC_002491	A	7	7	869647	869653	100 %	0 %	0 %	0 %	15836304
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16051	NC_002491	CGT	2	6	869935	869940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836305
16052	NC_002491	TCT	2	6	869941	869946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836305
16053	NC_002491	GCC	2	6	869964	869969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836305
16054	NC_002491	AG	3	6	869971	869976	50 %	0 %	50 %	0 %	15836305
16055	NC_002491	TTC	2	6	869997	870002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836305
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16057	NC_002491	ATC	3	9	870090	870098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836305
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16059	NC_002491	TGT	2	6	870154	870159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836305
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16061	NC_002491	CTT	2	6	870347	870352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836305
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16102	NC_002491	TCCTC	2	10	872397	872406	0 %	40 %	0 %	60 %	15836306
16103	NC_002491	GCT	2	6	872421	872426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836306
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16105	NC_002491	GTT	2	6	872443	872448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836306
16106	NC_002491	TAA	2	6	872477	872482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836306
16107	NC_002491	ATGA	2	8	872516	872523	50 %	25 %	25 %	0 %	15836306
16108	NC_002491	CTGT	2	8	872535	872542	0 %	50 %	25 %	25 %	15836307
16109	NC_002491	A	6	6	872547	872552	100 %	0 %	0 %	0 %	15836307
16110	NC_002491	ACT	2	6	872600	872605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836307
16111	NC_002491	CTTC	2	8	872612	872619	0 %	50 %	0 %	50 %	15836307
16112	NC_002491	T	6	6	872659	872664	0 %	100 %	0 %	0 %	15836307
16113	NC_002491	TGTT	2	8	872849	872856	0 %	75 %	25 %	0 %	15836308
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16119	NC_002491	GAT	2	6	873055	873060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836308
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16121	NC_002491	A	6	6	873265	873270	100 %	0 %	0 %	0 %	15836308
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16496	NC_002491	T	8	8	894067	894074	0 %	100 %	0 %	0 %	15836325
16497	NC_002491	GGA	2	6	894108	894113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836325
16498	NC_002491	A	6	6	894149	894154	100 %	0 %	0 %	0 %	15836325
16499	NC_002491	GAG	2	6	894172	894177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836325
16500	NC_002491	GGGAAT	2	12	894181	894192	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15836325

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