MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_002491	AGG	2	6	628203	628208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836074
11502	NC_002491	TC	3	6	628245	628250	0 %	50 %	0 %	50 %	15836074
11503	NC_002491	T	6	6	628251	628256	0 %	100 %	0 %	0 %	15836074
11504	NC_002491	TATG	2	8	628260	628267	25 %	50 %	25 %	0 %	15836074
11505	NC_002491	GAT	2	6	628353	628358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836074
11506	NC_002491	TCA	2	6	628424	628429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836074
11507	NC_002491	TCT	2	6	628494	628499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836074
11508	NC_002491	CTTTG	2	10	628543	628552	0 %	60 %	20 %	20 %	15836074
11509	NC_002491	CTT	2	6	628606	628611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836074
11510	NC_002491	GGTTA	2	10	628835	628844	20 %	40 %	40 %	0 %	15836074
11511	NC_002491	TG	3	6	628858	628863	0 %	50 %	50 %	0 %	15836074
11512	NC_002491	AAG	2	6	628864	628869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836074
11513	NC_002491	TTC	2	6	628959	628964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836075
11514	NC_002491	GAA	2	6	628976	628981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836075
11515	NC_002491	ATC	2	6	628983	628988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836075
11516	NC_002491	TTTA	2	8	628992	628999	25 %	75 %	0 %	0 %	15836075
11517	NC_002491	TCTT	2	8	629014	629021	0 %	75 %	0 %	25 %	15836075
11518	NC_002491	TGA	2	6	629035	629040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836075
11519	NC_002491	TCT	2	6	629071	629076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836075
11520	NC_002491	TC	4	8	629088	629095	0 %	50 %	0 %	50 %	15836075
11521	NC_002491	GAA	2	6	629147	629152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836075
11522	NC_002491	TGA	2	6	629176	629181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836075
11523	NC_002491	AAG	2	6	629464	629469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836075
11524	NC_002491	TTTCCT	2	12	629473	629484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836075
11525	NC_002491	TCC	2	6	629490	629495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836075
11526	NC_002491	CTGA	2	8	629636	629643	25 %	25 %	25 %	25 %	15836075
11527	NC_002491	TGG	2	6	629702	629707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836075
11528	NC_002491	GCC	2	6	629724	629729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836075
11529	NC_002491	CCA	2	6	629734	629739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836075
11530	NC_002491	CCT	2	6	629755	629760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836075
11531	NC_002491	CAA	2	6	629789	629794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836075
11532	NC_002491	AAC	2	6	629965	629970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836076
11533	NC_002491	TAC	2	6	630001	630006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836076
11534	NC_002491	ATC	2	6	630034	630039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836076
11535	NC_002491	ACGACC	2	12	630040	630051	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15836076
11536	NC_002491	CT	3	6	630081	630086	0 %	50 %	0 %	50 %	15836076
11537	NC_002491	ACGA	2	8	630088	630095	50 %	0 %	25 %	25 %	15836076
11538	NC_002491	GAT	2	6	630288	630293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836077
11539	NC_002491	T	6	6	630304	630309	0 %	100 %	0 %	0 %	15836077
11540	NC_002491	ACT	2	6	630323	630328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836077
11541	NC_002491	AG	3	6	630395	630400	50 %	0 %	50 %	0 %	15836077
11542	NC_002491	CTT	2	6	630444	630449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836077
11543	NC_002491	ATCA	2	8	630481	630488	50 %	25 %	0 %	25 %	15836077
11544	NC_002491	TTGC	2	8	630511	630518	0 %	50 %	25 %	25 %	15836077
11545	NC_002491	GCCCAA	2	12	631007	631018	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15836078
11546	NC_002491	GGT	2	6	631095	631100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836078
11547	NC_002491	TAA	2	6	631190	631195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836078
11548	NC_002491	ATT	2	6	631197	631202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836078
11549	NC_002491	TGA	2	6	631217	631222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836078
11550	NC_002491	GAG	2	6	631266	631271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836078
11551	NC_002491	GAAG	2	8	631326	631333	50 %	0 %	50 %	0 %	15836078
11552	NC_002491	CAA	2	6	631519	631524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836079
11553	NC_002491	GAGG	2	8	631544	631551	25 %	0 %	75 %	0 %	15836079
11554	NC_002491	TCT	2	6	631575	631580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836079
11555	NC_002491	CCCT	2	8	631634	631641	0 %	25 %	0 %	75 %	15836079
11556	NC_002491	AAG	2	6	631679	631684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836079
11557	NC_002491	TC	5	10	631707	631716	0 %	50 %	0 %	50 %	15836079
11558	NC_002491	AGTTTT	2	12	631734	631745	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15836079
11559	NC_002491	ATA	2	6	631778	631783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836079
11560	NC_002491	A	6	6	631811	631816	100 %	0 %	0 %	0 %	15836079
11561	NC_002491	ATT	2	6	631823	631828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836079
11562	NC_002491	TAGA	2	8	631930	631937	50 %	25 %	25 %	0 %	15836079
11563	NC_002491	GAG	2	6	632097	632102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836079
11564	NC_002491	AC	3	6	632134	632139	50 %	0 %	0 %	50 %	15836079
11565	NC_002491	CAT	2	6	632188	632193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836079
11566	NC_002491	T	8	8	632305	632312	0 %	100 %	0 %	0 %	15836079
11567	NC_002491	CT	3	6	632695	632700	0 %	50 %	0 %	50 %	15836080
11568	NC_002491	T	6	6	632704	632709	0 %	100 %	0 %	0 %	15836080
11569	NC_002491	ACA	2	6	632774	632779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836080
11570	NC_002491	CAA	2	6	632805	632810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836080
11571	NC_002491	CTG	2	6	632814	632819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836080
11572	NC_002491	ACGAAT	2	12	632857	632868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15836080
11573	NC_002491	T	6	6	632868	632873	0 %	100 %	0 %	0 %	15836080
11574	NC_002491	TGC	2	6	632879	632884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836080
11575	NC_002491	CTT	2	6	632900	632905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836081
11576	NC_002491	TCT	2	6	632913	632918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836081
11577	NC_002491	T	6	6	632923	632928	0 %	100 %	0 %	0 %	15836081
11578	NC_002491	CGA	2	6	633087	633092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836081
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11581	NC_002491	T	6	6	633314	633319	0 %	100 %	0 %	0 %	15836081
11582	NC_002491	AT	3	6	633354	633359	50 %	50 %	0 %	0 %	15836081
11583	NC_002491	ACC	2	6	633461	633466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836081
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11586	NC_002491	CTGTC	2	10	633626	633635	0 %	40 %	20 %	40 %	15836081
11587	NC_002491	TTG	2	6	633643	633648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836081
11588	NC_002491	TCT	3	9	633666	633674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836081
11589	NC_002491	CA	3	6	633796	633801	50 %	0 %	0 %	50 %	15836081
11590	NC_002491	T	6	6	633920	633925	0 %	100 %	0 %	0 %	15836081
11591	NC_002491	T	6	6	633956	633961	0 %	100 %	0 %	0 %	15836081
11592	NC_002491	GCT	2	6	634035	634040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836081
11593	NC_002491	GATT	2	8	634090	634097	25 %	50 %	25 %	0 %	15836081
11594	NC_002491	GTT	2	6	634156	634161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836081
11595	NC_002491	GATT	2	8	634201	634208	25 %	50 %	25 %	0 %	15836081
11596	NC_002491	TCA	2	6	634285	634290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836081
11597	NC_002491	TAG	2	6	634315	634320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836081
11598	NC_002491	TTC	2	6	634325	634330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836081
11599	NC_002491	TCGC	2	8	634339	634346	0 %	25 %	25 %	50 %	15836081
11600	NC_002491	TTC	2	6	634388	634393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836081
11601	NC_002491	ATC	2	6	634412	634417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836081
11602	NC_002491	GA	3	6	634438	634443	50 %	0 %	50 %	0 %	15836081
11603	NC_002491	GCA	2	6	634539	634544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836081
11604	NC_002491	TTTA	2	8	634571	634578	25 %	75 %	0 %	0 %	15836081
11605	NC_002491	AAT	2	6	634739	634744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836081
11606	NC_002491	AGA	2	6	634765	634770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836081
11607	NC_002491	AGT	2	6	634772	634777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836081
11608	NC_002491	GCA	2	6	634779	634784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836081
11609	NC_002491	TTC	2	6	634870	634875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836081
11610	NC_002491	TTCT	2	8	634891	634898	0 %	75 %	0 %	25 %	15836081
11611	NC_002491	GTT	2	6	634905	634910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836081
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11613	NC_002491	TTG	2	6	635084	635089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408843729
11614	NC_002491	TGTT	2	8	635095	635102	0 %	75 %	25 %	0 %	408843729
11615	NC_002491	TAC	2	6	635156	635161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408843729
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11618	NC_002491	GAAC	2	8	635257	635264	50 %	0 %	25 %	25 %	408843729
11619	NC_002491	T	6	6	635331	635336	0 %	100 %	0 %	0 %	408843729
11620	NC_002491	TTC	2	6	635383	635388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408843729
11621	NC_002491	CAT	2	6	635394	635399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408843729
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11992	NC_002491	TTG	2	6	656840	656845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836098
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11994	NC_002491	T	6	6	656971	656976	0 %	100 %	0 %	0 %	15836098
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