MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_002491	TCC	2	6	601945	601950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836052
11002	NC_002491	TC	3	6	601981	601986	0 %	50 %	0 %	50 %	15836052
11003	NC_002491	CGA	2	6	601994	601999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836052
11004	NC_002491	ATT	2	6	602002	602007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836052
11005	NC_002491	TGA	2	6	602015	602020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836052
11006	NC_002491	AG	4	8	602041	602048	50 %	0 %	50 %	0 %	15836052
11007	NC_002491	CTTC	2	8	602049	602056	0 %	50 %	0 %	50 %	15836052
11008	NC_002491	AGC	2	6	602071	602076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836052
11009	NC_002491	CAT	2	6	602101	602106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836052
11010	NC_002491	GTT	3	9	602192	602200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836052
11011	NC_002491	TCA	2	6	602234	602239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836052
11012	NC_002491	GAA	2	6	602354	602359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836052
11013	NC_002491	CAT	2	6	602445	602450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836052
11014	NC_002491	ACGT	2	8	602488	602495	25 %	25 %	25 %	25 %	15836052
11015	NC_002491	AAG	2	6	602547	602552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836052
11016	NC_002491	TTC	3	9	602578	602586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836052
11017	NC_002491	GCA	2	6	602717	602722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836052
11018	NC_002491	AC	3	6	602744	602749	50 %	0 %	0 %	50 %	15836052
11019	NC_002491	CTTC	2	8	602804	602811	0 %	50 %	0 %	50 %	15836052
11020	NC_002491	GAA	2	6	602861	602866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836052
11021	NC_002491	ATC	2	6	602882	602887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836052
11022	NC_002491	TCA	2	6	602915	602920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836052
11023	NC_002491	TC	3	6	602926	602931	0 %	50 %	0 %	50 %	15836052
11024	NC_002491	GGAA	2	8	602938	602945	50 %	0 %	50 %	0 %	15836052
11025	NC_002491	GCT	2	6	602969	602974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836052
11026	NC_002491	CAA	2	6	603037	603042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836052
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11028	NC_002491	ACC	2	6	603056	603061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836052
11029	NC_002491	A	6	6	603332	603337	100 %	0 %	0 %	0 %	15836053
11030	NC_002491	ATT	2	6	603359	603364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836053
11031	NC_002491	CT	3	6	603377	603382	0 %	50 %	0 %	50 %	15836053
11032	NC_002491	TTCC	2	8	603427	603434	0 %	50 %	0 %	50 %	15836053
11033	NC_002491	CTTCT	2	10	603497	603506	0 %	60 %	0 %	40 %	15836053
11034	NC_002491	ACCT	2	8	603532	603539	25 %	25 %	0 %	50 %	15836053
11035	NC_002491	CCA	2	6	603554	603559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836053
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11037	NC_002491	TC	3	6	603570	603575	0 %	50 %	0 %	50 %	15836053
11038	NC_002491	GTA	2	6	603598	603603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836053
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11040	NC_002491	T	6	6	603732	603737	0 %	100 %	0 %	0 %	15836053
11041	NC_002491	A	8	8	603775	603782	100 %	0 %	0 %	0 %	15836053
11042	NC_002491	A	7	7	603799	603805	100 %	0 %	0 %	0 %	15836053
11043	NC_002491	A	6	6	603866	603871	100 %	0 %	0 %	0 %	15836053
11044	NC_002491	AAGG	2	8	603884	603891	50 %	0 %	50 %	0 %	15836053
11045	NC_002491	CTT	2	6	604047	604052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836054
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11047	NC_002491	ACC	2	6	604181	604186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836054
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11049	NC_002491	GTC	2	6	604310	604315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836054
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11052	NC_002491	TGG	2	6	604568	604573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836055
11053	NC_002491	CTT	2	6	604656	604661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836055
11054	NC_002491	ACC	2	6	604667	604672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836055
11055	NC_002491	TCT	2	6	604690	604695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836055
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11058	NC_002491	A	7	7	604886	604892	100 %	0 %	0 %	0 %	15836055
11059	NC_002491	ATC	2	6	604906	604911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836055
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11061	NC_002491	CT	3	6	604960	604965	0 %	50 %	0 %	50 %	15836055
11062	NC_002491	GCAA	2	8	605012	605019	50 %	0 %	25 %	25 %	15836055
11063	NC_002491	AGT	2	6	605073	605078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836055
11064	NC_002491	AGAAA	2	10	605133	605142	80 %	0 %	20 %	0 %	15836055
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11074	NC_002491	AAAG	2	8	605913	605920	75 %	0 %	25 %	0 %	15836056
11075	NC_002491	AGAA	2	8	605927	605934	75 %	0 %	25 %	0 %	15836056
11076	NC_002491	GA	3	6	606029	606034	50 %	0 %	50 %	0 %	15836056
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11079	NC_002491	CAAA	2	8	606140	606147	75 %	0 %	0 %	25 %	15836056
11080	NC_002491	AAGC	2	8	606190	606197	50 %	0 %	25 %	25 %	15836056
11081	NC_002491	TC	3	6	606218	606223	0 %	50 %	0 %	50 %	15836056
11082	NC_002491	AGCTT	2	10	606232	606241	20 %	40 %	20 %	20 %	15836056
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11089	NC_002491	GTT	3	9	606409	606417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836056
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11093	NC_002491	CGT	4	12	606580	606591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836056
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11096	NC_002491	ACT	2	6	607123	607128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836057
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11101	NC_002491	CGTA	2	8	607461	607468	25 %	25 %	25 %	25 %	15836057
11102	NC_002491	A	6	6	607508	607513	100 %	0 %	0 %	0 %	15836057
11103	NC_002491	ATTAA	2	10	607553	607562	60 %	40 %	0 %	0 %	15836057
11104	NC_002491	GA	3	6	607607	607612	50 %	0 %	50 %	0 %	15836057
11105	NC_002491	CAC	2	6	607707	607712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836057
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11107	NC_002491	A	7	7	607866	607872	100 %	0 %	0 %	0 %	15836057
11108	NC_002491	T	6	6	607896	607901	0 %	100 %	0 %	0 %	15836057
11109	NC_002491	ATTGC	2	10	607908	607917	20 %	40 %	20 %	20 %	15836057
11110	NC_002491	A	9	9	607940	607948	100 %	0 %	0 %	0 %	15836057
11111	NC_002491	CTT	2	6	607956	607961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836057
11112	NC_002491	ATC	2	6	608000	608005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836057
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11116	NC_002491	ATTT	2	8	608321	608328	25 %	75 %	0 %	0 %	15836058
11117	NC_002491	AGAT	2	8	608343	608350	50 %	25 %	25 %	0 %	15836058
11118	NC_002491	TACT	2	8	608369	608376	25 %	50 %	0 %	25 %	15836058
11119	NC_002491	AAC	3	9	608409	608417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836058
11120	NC_002491	CCTT	2	8	608419	608426	0 %	50 %	0 %	50 %	15836058
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11122	NC_002491	AAG	2	6	608581	608586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836058
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11124	NC_002491	AAC	2	6	608637	608642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836058
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11126	NC_002491	TTG	2	6	608760	608765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836058
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11141	NC_002491	CCATG	2	10	609883	609892	20 %	20 %	20 %	40 %	15836059
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11241	NC_002491	A	7	7	615606	615612	100 %	0 %	0 %	0 %	15836066
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