MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002491	AGC	3	9	546817	546825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836003
10002	NC_002491	TGA	2	6	546829	546834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836003
10003	NC_002491	TC	3	6	546847	546852	0 %	50 %	0 %	50 %	15836003
10004	NC_002491	A	7	7	546927	546933	100 %	0 %	0 %	0 %	15836003
10005	NC_002491	A	7	7	546981	546987	100 %	0 %	0 %	0 %	15836003
10006	NC_002491	GAA	2	6	547007	547012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836003
10007	NC_002491	TCT	2	6	547031	547036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836003
10008	NC_002491	TCCT	2	8	547081	547088	0 %	50 %	0 %	50 %	15836003
10009	NC_002491	GAG	2	6	547101	547106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836003
10010	NC_002491	TCC	2	6	547204	547209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836003
10011	NC_002491	ACT	2	6	547385	547390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836004
10012	NC_002491	TTG	2	6	547428	547433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836004
10013	NC_002491	ATC	2	6	547611	547616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836004
10014	NC_002491	CGT	2	6	547630	547635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836004
10015	NC_002491	AAG	2	6	547666	547671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836004
10016	NC_002491	CTG	2	6	547778	547783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836004
10017	NC_002491	GATG	2	8	547809	547816	25 %	25 %	50 %	0 %	15836004
10018	NC_002491	CTAC	2	8	547834	547841	25 %	25 %	0 %	50 %	15836004
10019	NC_002491	TAA	2	6	547859	547864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836004
10020	NC_002491	TCC	2	6	547867	547872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836004
10021	NC_002491	AGG	2	6	547878	547883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836004
10022	NC_002491	TGA	2	6	547888	547893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836004
10023	NC_002491	AAG	2	6	547914	547919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836004
10024	NC_002491	TGC	2	6	548004	548009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836004
10025	NC_002491	GAA	2	6	548041	548046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836004
10026	NC_002491	CTGAT	2	10	548078	548087	20 %	40 %	20 %	20 %	15836004
10027	NC_002491	CTC	2	6	548165	548170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836004
10028	NC_002491	A	6	6	548182	548187	100 %	0 %	0 %	0 %	15836004
10029	NC_002491	GAA	2	6	548188	548193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836004
10030	NC_002491	GAA	2	6	548200	548205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836004
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10032	NC_002491	CTTT	2	8	548227	548234	0 %	75 %	0 %	25 %	15836004
10033	NC_002491	GTT	2	6	548266	548271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836004
10034	NC_002491	ATC	2	6	548274	548279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836004
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10036	NC_002491	AAG	2	6	548362	548367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836004
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10038	NC_002491	GAA	2	6	548380	548385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836004
10039	NC_002491	CTC	2	6	548390	548395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836004
10040	NC_002491	T	7	7	548618	548624	0 %	100 %	0 %	0 %	15836004
10041	NC_002491	TC	3	6	548748	548753	0 %	50 %	0 %	50 %	15836004
10042	NC_002491	ACT	2	6	548781	548786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836004
10043	NC_002491	ACT	2	6	548790	548795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836004
10044	NC_002491	ACTT	2	8	548829	548836	25 %	50 %	0 %	25 %	15836004
10045	NC_002491	AGG	2	6	548862	548867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836004
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10050	NC_002491	AGC	2	6	549201	549206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836005
10051	NC_002491	CAA	2	6	549215	549220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836005
10052	NC_002491	TCA	2	6	549310	549315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836005
10053	NC_002491	TCC	2	6	549372	549377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836005
10054	NC_002491	AAG	2	6	549426	549431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836005
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10057	NC_002491	T	6	6	549549	549554	0 %	100 %	0 %	0 %	15836005
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10059	NC_002491	CTT	2	6	549647	549652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836005
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10063	NC_002491	GCA	2	6	549817	549822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836005
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10065	NC_002491	TTC	2	6	549900	549905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836005
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10089	NC_002491	CT	3	6	551323	551328	0 %	50 %	0 %	50 %	15836006
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10094	NC_002491	GAA	2	6	551615	551620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836006
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10101	NC_002491	TAGC	2	8	552355	552362	25 %	25 %	25 %	25 %	15836006
10102	NC_002491	CCT	2	6	552401	552406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836006
10103	NC_002491	TCCA	2	8	552475	552482	25 %	25 %	0 %	50 %	15836006
10104	NC_002491	GAT	2	6	552485	552490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836006
10105	NC_002491	GGA	2	6	552541	552546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836006
10106	NC_002491	CT	3	6	552731	552736	0 %	50 %	0 %	50 %	15836006
10107	NC_002491	A	6	6	552844	552849	100 %	0 %	0 %	0 %	15836006
10108	NC_002491	AGG	2	6	552870	552875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836006
10109	NC_002491	TGA	2	6	552910	552915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836006
10110	NC_002491	AC	3	6	552917	552922	50 %	0 %	0 %	50 %	15836006
10111	NC_002491	GTG	2	6	552990	552995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836006
10112	NC_002491	GAA	2	6	553060	553065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836006
10113	NC_002491	GTC	2	6	553109	553114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836006
10114	NC_002491	GGAT	2	8	553141	553148	25 %	25 %	50 %	0 %	15836006
10115	NC_002491	CTAT	2	8	553170	553177	25 %	50 %	0 %	25 %	15836007
10116	NC_002491	AAAG	2	8	553235	553242	75 %	0 %	25 %	0 %	15836007
10117	NC_002491	AG	3	6	553255	553260	50 %	0 %	50 %	0 %	15836007
10118	NC_002491	GC	3	6	553285	553290	0 %	0 %	50 %	50 %	15836007
10119	NC_002491	GAA	2	6	553301	553306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836007
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10121	NC_002491	AGGA	2	8	553453	553460	50 %	0 %	50 %	0 %	15836007
10122	NC_002491	CTA	2	6	553464	553469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836007
10123	NC_002491	GA	3	6	553520	553525	50 %	0 %	50 %	0 %	15836007
10124	NC_002491	C	6	6	553541	553546	0 %	0 %	0 %	100 %	15836007
10125	NC_002491	GGA	2	6	553566	553571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836007
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10226	NC_002491	AT	3	6	559809	559814	50 %	50 %	0 %	0 %	15836012
10227	NC_002491	GATC	2	8	559841	559848	25 %	25 %	25 %	25 %	15836012
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10232	NC_002491	GTTC	2	8	560186	560193	0 %	50 %	25 %	25 %	15836012
10233	NC_002491	GGA	2	6	560209	560214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836012
10234	NC_002491	TTG	2	6	560358	560363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836013
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10236	NC_002491	AGG	2	6	560430	560435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836013
10237	NC_002491	TTG	2	6	560447	560452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836013
10238	NC_002491	CAA	2	6	560453	560458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836013
10239	NC_002491	AGA	2	6	560634	560639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836013
10240	NC_002491	ACC	2	6	560686	560691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836013
10241	NC_002491	ATA	2	6	560715	560720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836013
10242	NC_002491	T	7	7	560793	560799	0 %	100 %	0 %	0 %	15836013
10243	NC_002491	TTGC	2	8	560844	560851	0 %	50 %	25 %	25 %	15836013
10244	NC_002491	AGG	2	6	560928	560933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836013
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10246	NC_002491	AAAT	2	8	561017	561024	75 %	25 %	0 %	0 %	15836013
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10372	NC_002491	CT	3	6	567543	567548	0 %	50 %	0 %	50 %	15836018
10373	NC_002491	GA	3	6	567592	567597	50 %	0 %	50 %	0 %	15836018
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10375	NC_002491	TGC	2	6	567659	567664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836018
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10384	NC_002491	CCG	2	6	568096	568101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836018
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