MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002491	T	6	6	326210	326215	0 %	100 %	0 %	0 %	15835824
6002	NC_002491	ATC	2	6	326222	326227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835824
6003	NC_002491	GCA	2	6	326229	326234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835824
6004	NC_002491	GAT	2	6	326265	326270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835824
6005	NC_002491	ATAA	2	8	326277	326284	75 %	25 %	0 %	0 %	15835824
6006	NC_002491	GCT	2	6	326340	326345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835824
6007	NC_002491	TGTTT	2	10	326360	326369	0 %	80 %	20 %	0 %	15835824
6008	NC_002491	GGAT	2	8	326415	326422	25 %	25 %	50 %	0 %	15835824
6009	NC_002491	TCT	2	6	326492	326497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835824
6010	NC_002491	TGC	2	6	326595	326600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835824
6011	NC_002491	AAC	2	6	326620	326625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835824
6012	NC_002491	A	6	6	326670	326675	100 %	0 %	0 %	0 %	15835825
6013	NC_002491	TGC	2	6	326765	326770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835825
6014	NC_002491	GGT	2	6	326781	326786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835825
6015	NC_002491	T	6	6	326810	326815	0 %	100 %	0 %	0 %	15835825
6016	NC_002491	ATT	2	6	326838	326843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835825
6017	NC_002491	CT	3	6	326850	326855	0 %	50 %	0 %	50 %	15835825
6018	NC_002491	TTAA	2	8	326892	326899	50 %	50 %	0 %	0 %	15835825
6019	NC_002491	A	6	6	326910	326915	100 %	0 %	0 %	0 %	15835825
6020	NC_002491	CTA	2	6	326966	326971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835825
6021	NC_002491	TAT	2	6	327006	327011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835825
6022	NC_002491	CT	3	6	327085	327090	0 %	50 %	0 %	50 %	15835825
6023	NC_002491	CACCT	2	10	327096	327105	20 %	20 %	0 %	60 %	15835825
6024	NC_002491	TAA	2	6	327164	327169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835825
6025	NC_002491	TTCT	2	8	327186	327193	0 %	75 %	0 %	25 %	15835825
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6027	NC_002491	A	8	8	327380	327387	100 %	0 %	0 %	0 %	15835825
6028	NC_002491	AGT	2	6	327392	327397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835825
6029	NC_002491	TAA	2	6	327425	327430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835825
6030	NC_002491	CTT	2	6	327475	327480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835825
6031	NC_002491	CTAC	2	8	327548	327555	25 %	25 %	0 %	50 %	15835825
6032	NC_002491	GGA	2	6	327579	327584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835825
6033	NC_002491	ACC	2	6	327594	327599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835825
6034	NC_002491	TTC	2	6	327615	327620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835825
6035	NC_002491	TTC	2	6	327644	327649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835825
6036	NC_002491	TC	3	6	327671	327676	0 %	50 %	0 %	50 %	15835825
6037	NC_002491	CAA	2	6	327727	327732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835825
6038	NC_002491	TTTA	2	8	327834	327841	25 %	75 %	0 %	0 %	15835825
6039	NC_002491	CTAAA	2	10	327865	327874	60 %	20 %	0 %	20 %	15835825
6040	NC_002491	AAG	2	6	327877	327882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835825
6041	NC_002491	GCT	2	6	327891	327896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835825
6042	NC_002491	CAA	2	6	327914	327919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835825
6043	NC_002491	TA	3	6	327930	327935	50 %	50 %	0 %	0 %	15835825
6044	NC_002491	TTC	2	6	327964	327969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835825
6045	NC_002491	GTG	2	6	328016	328021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835825
6046	NC_002491	TC	3	6	328032	328037	0 %	50 %	0 %	50 %	15835825
6047	NC_002491	TTTA	2	8	328108	328115	25 %	75 %	0 %	0 %	15835825
6048	NC_002491	ACTG	2	8	328411	328418	25 %	25 %	25 %	25 %	15835826
6049	NC_002491	TGA	2	6	328456	328461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835826
6050	NC_002491	A	6	6	328577	328582	100 %	0 %	0 %	0 %	15835826
6051	NC_002491	AATTGC	2	12	328615	328626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15835826
6052	NC_002491	TAT	2	6	328642	328647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835826
6053	NC_002491	TGC	2	6	328648	328653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835826
6054	NC_002491	TA	3	6	328692	328697	50 %	50 %	0 %	0 %	15835826
6055	NC_002491	CT	3	6	328777	328782	0 %	50 %	0 %	50 %	15835826
6056	NC_002491	ACA	2	6	328808	328813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835826
6057	NC_002491	ATA	2	6	328816	328821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835826
6058	NC_002491	AGC	2	6	328902	328907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835827
6059	NC_002491	ATG	2	6	328961	328966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835827
6060	NC_002491	TTC	2	6	328995	329000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835827
6061	NC_002491	AAC	3	9	329001	329009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835827
6062	NC_002491	CGAT	2	8	329011	329018	25 %	25 %	25 %	25 %	15835827
6063	NC_002491	TAT	2	6	329032	329037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835827
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6066	NC_002491	GAT	2	6	329099	329104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835827
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6069	NC_002491	TGT	2	6	329128	329133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835827
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6071	NC_002491	TCTAC	2	10	329192	329201	20 %	40 %	0 %	40 %	15835827
6072	NC_002491	TAT	3	9	329275	329283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835827
6073	NC_002491	ATA	2	6	329285	329290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835827
6074	NC_002491	TAT	2	6	329383	329388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835827
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6076	NC_002491	A	7	7	329460	329466	100 %	0 %	0 %	0 %	15835827
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6082	NC_002491	T	8	8	329632	329639	0 %	100 %	0 %	0 %	15835828
6083	NC_002491	GTT	2	6	329665	329670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835828
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6088	NC_002491	TATC	2	8	329845	329852	25 %	50 %	0 %	25 %	15835828
6089	NC_002491	TC	3	6	329873	329878	0 %	50 %	0 %	50 %	15835828
6090	NC_002491	C	7	7	329898	329904	0 %	0 %	0 %	100 %	15835828
6091	NC_002491	TC	3	6	329951	329956	0 %	50 %	0 %	50 %	15835828
6092	NC_002491	T	6	6	329988	329993	0 %	100 %	0 %	0 %	15835828
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6096	NC_002491	CAG	2	6	330124	330129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835828
6097	NC_002491	ATGACC	2	12	330190	330201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15835828
6098	NC_002491	CCAC	2	8	330218	330225	25 %	0 %	0 %	75 %	15835828
6099	NC_002491	TGCTT	2	10	330280	330289	0 %	60 %	20 %	20 %	15835828
6100	NC_002491	GAA	2	6	330369	330374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835828
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6103	NC_002491	AAT	2	6	330480	330485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835828
6104	NC_002491	AAC	2	6	330542	330547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835828
6105	NC_002491	GTA	2	6	330573	330578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835828
6106	NC_002491	TGA	2	6	330602	330607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835828
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6108	NC_002491	ACT	2	6	330620	330625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835828
6109	NC_002491	CAA	2	6	330641	330646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835828
6110	NC_002491	TGGTC	2	10	330703	330712	0 %	40 %	40 %	20 %	15835828
6111	NC_002491	TCT	2	6	330729	330734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835828
6112	NC_002491	CAA	2	6	330735	330740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835828
6113	NC_002491	ATC	2	6	330756	330761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835828
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6115	NC_002491	ATCT	2	8	330826	330833	25 %	50 %	0 %	25 %	15835828
6116	NC_002491	CTT	2	6	330914	330919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835828
6117	NC_002491	TCA	2	6	330950	330955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835828
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6119	NC_002491	TAA	2	6	331043	331048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835828
6120	NC_002491	CTT	2	6	331242	331247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835828
6121	NC_002491	AAG	2	6	331265	331270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835828
6122	NC_002491	ACT	2	6	331322	331327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835828
6123	NC_002491	CTT	2	6	331415	331420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835828
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6125	NC_002491	ATG	2	6	331540	331545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835828
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6130	NC_002491	GCC	2	6	331749	331754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15835828
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6500	NC_002491	TAA	2	6	351052	351057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835845

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