MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 22573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002491	ATG	2	6	16	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835536
2	NC_002491	CCT	2	6	32	37	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835536
3	NC_002491	AGC	2	6	42	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835536
4	NC_002491	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835536
5	NC_002491	AGCA	2	8	98	105	50 %	0 %	25 %	25 %	15835536
6	NC_002491	ATA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835536
7	NC_002491	CA	3	6	168	173	50 %	0 %	0 %	50 %	15835536
8	NC_002491	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835536
9	NC_002491	ATTTA	2	10	187	196	40 %	60 %	0 %	0 %	15835536
10	NC_002491	AG	3	6	248	253	50 %	0 %	50 %	0 %	15835536
11	NC_002491	AAT	2	6	265	270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835536
12	NC_002491	GAA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835537
13	NC_002491	CTT	2	6	667	672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835537
14	NC_002491	AAG	2	6	697	702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835537
15	NC_002491	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835537
16	NC_002491	GTA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835537
17	NC_002491	GA	3	6	776	781	50 %	0 %	50 %	0 %	15835537
18	NC_002491	T	7	7	972	978	0 %	100 %	0 %	0 %	15835538
19	NC_002491	ATAGA	2	10	980	989	60 %	20 %	20 %	0 %	15835538
20	NC_002491	AGGT	2	8	1004	1011	25 %	25 %	50 %	0 %	15835538
21	NC_002491	ATA	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835538
22	NC_002491	ACA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835538
23	NC_002491	ACC	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835538
24	NC_002491	TGT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835538
25	NC_002491	AGAA	2	8	1212	1219	75 %	0 %	25 %	0 %	15835538
26	NC_002491	A	6	6	1222	1227	100 %	0 %	0 %	0 %	15835538
27	NC_002491	CAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835538
28	NC_002491	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835538
29	NC_002491	GGA	2	6	1414	1419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835538
30	NC_002491	GCA	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835538
31	NC_002491	AGA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835538
32	NC_002491	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835538
33	NC_002491	AG	3	6	1609	1614	50 %	0 %	50 %	0 %	15835538
34	NC_002491	TGA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835538
35	NC_002491	TCT	2	6	1721	1726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835538
36	NC_002491	GAAGGA	2	12	1744	1755	50 %	0 %	50 %	0 %	15835538
37	NC_002491	TGTGGA	2	12	1764	1775	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15835538
38	NC_002491	TA	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	15835538
39	NC_002491	CTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835538
40	NC_002491	TC	3	6	1914	1919	0 %	50 %	0 %	50 %	15835538
41	NC_002491	TGTCT	2	10	1974	1983	0 %	60 %	20 %	20 %	15835538
42	NC_002491	GA	3	6	1987	1992	50 %	0 %	50 %	0 %	15835538
43	NC_002491	TAT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835538
44	NC_002491	GTGC	2	8	2023	2030	0 %	25 %	50 %	25 %	15835538
45	NC_002491	AGG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835538
46	NC_002491	CAA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835538
47	NC_002491	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835538
48	NC_002491	AGG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835538
49	NC_002491	TC	3	6	2593	2598	0 %	50 %	0 %	50 %	15835539
50	NC_002491	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835539
51	NC_002491	GAG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835539
52	NC_002491	AGA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835539
53	NC_002491	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835539
54	NC_002491	GAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835539
55	NC_002491	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835539
56	NC_002491	CTAC	2	8	3133	3140	25 %	25 %	0 %	50 %	15835539
57	NC_002491	GAAAA	2	10	3153	3162	80 %	0 %	20 %	0 %	15835539
58	NC_002491	A	7	7	3159	3165	100 %	0 %	0 %	0 %	15835539
59	NC_002491	AG	3	6	3185	3190	50 %	0 %	50 %	0 %	15835539
60	NC_002491	TA	3	6	3252	3257	50 %	50 %	0 %	0 %	15835539
61	NC_002491	T	6	6	3378	3383	0 %	100 %	0 %	0 %	15835539
62	NC_002491	ATG	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835539
63	NC_002491	GAG	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835539
64	NC_002491	GCT	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835539
65	NC_002491	GGT	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835539
66	NC_002491	CAG	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835539
67	NC_002491	CTC	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835539
68	NC_002491	GAAC	2	8	3800	3807	50 %	0 %	25 %	25 %	15835539
69	NC_002491	T	6	6	4158	4163	0 %	100 %	0 %	0 %	15835540
70	NC_002491	CTT	2	6	4191	4196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
71	NC_002491	CTA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835540
72	NC_002491	AGA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835540
73	NC_002491	TAAA	2	8	4341	4348	75 %	25 %	0 %	0 %	15835540
74	NC_002491	ATC	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835540
75	NC_002491	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835540
76	NC_002491	AAGG	2	8	4436	4443	50 %	0 %	50 %	0 %	15835540
77	NC_002491	TTG	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835540
78	NC_002491	CT	3	6	4502	4507	0 %	50 %	0 %	50 %	15835540
79	NC_002491	A	6	6	4555	4560	100 %	0 %	0 %	0 %	15835540
80	NC_002491	TAG	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835540
81	NC_002491	TTC	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
82	NC_002491	TGATAT	2	12	4816	4827	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15835540
83	NC_002491	ACT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835540
84	NC_002491	AGGG	2	8	4887	4894	25 %	0 %	75 %	0 %	15835540
85	NC_002491	CTGT	2	8	4896	4903	0 %	50 %	25 %	25 %	15835540
86	NC_002491	AGT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835540
87	NC_002491	GAAA	2	8	4976	4983	75 %	0 %	25 %	0 %	15835540
88	NC_002491	AGG	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835540
89	NC_002491	AAT	2	6	5060	5065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835540
90	NC_002491	AT	3	6	5064	5069	50 %	50 %	0 %	0 %	15835540
91	NC_002491	CAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835540
92	NC_002491	CATC	2	8	5197	5204	25 %	25 %	0 %	50 %	15835540
93	NC_002491	TTA	2	6	5442	5447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835540
94	NC_002491	GATA	2	8	5566	5573	50 %	25 %	25 %	0 %	15835540
95	NC_002491	CAG	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835540
96	NC_002491	TTA	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835540
97	NC_002491	CT	3	6	5726	5731	0 %	50 %	0 %	50 %	15835540
98	NC_002491	CTG	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835540
99	NC_002491	TTC	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
100	NC_002491	ATAAA	2	10	5868	5877	80 %	20 %	0 %	0 %	15835540
101	NC_002491	AAG	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835540
102	NC_002491	ACAG	2	8	5989	5996	50 %	0 %	25 %	25 %	15835540
103	NC_002491	TTC	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
104	NC_002491	AAT	2	6	6101	6106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835540
105	NC_002491	TAG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835540
106	NC_002491	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835540
107	NC_002491	TC	3	6	6289	6294	0 %	50 %	0 %	50 %	15835540
108	NC_002491	AAG	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835540
109	NC_002491	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
110	NC_002491	T	6	6	6331	6336	0 %	100 %	0 %	0 %	15835540
111	NC_002491	CCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835540
112	NC_002491	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835540
113	NC_002491	GGAG	2	8	6437	6444	25 %	0 %	75 %	0 %	15835540
114	NC_002491	GAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835540
115	NC_002491	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835540
116	NC_002491	GCA	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835540
117	NC_002491	GCC	2	6	6840	6845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15835540
118	NC_002491	TATAA	2	10	6860	6869	60 %	40 %	0 %	0 %	15835540
119	NC_002491	CT	3	6	7259	7264	0 %	50 %	0 %	50 %	15835541
120	NC_002491	T	6	6	7516	7521	0 %	100 %	0 %	0 %	15835542
121	NC_002491	CT	3	6	7562	7567	0 %	50 %	0 %	50 %	15835542
122	NC_002491	TC	3	6	7575	7580	0 %	50 %	0 %	50 %	15835542
123	NC_002491	ATT	2	6	7650	7655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835542
124	NC_002491	GGT	2	6	7665	7670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835542
125	NC_002491	TTC	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
126	NC_002491	TG	3	6	7752	7757	0 %	50 %	50 %	0 %	15835542
127	NC_002491	TGCT	2	8	7759	7766	0 %	50 %	25 %	25 %	15835542
128	NC_002491	TTC	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
129	NC_002491	GAA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
130	NC_002491	TATTTC	2	12	7859	7870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15835542
131	NC_002491	ATT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835542
132	NC_002491	GTG	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835542
133	NC_002491	TTC	2	6	8045	8050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
134	NC_002491	GTGCTT	2	12	8065	8076	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15835542
135	NC_002491	TG	3	6	8082	8087	0 %	50 %	50 %	0 %	15835542
136	NC_002491	TGCT	2	8	8089	8096	0 %	50 %	25 %	25 %	15835542
137	NC_002491	TTC	2	6	8110	8115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
138	NC_002491	GAA	2	6	8117	8122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
139	NC_002491	TAG	2	6	8137	8142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835542
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403	NC_002491	TTC	2	6	21435	21440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835550
404	NC_002491	GCT	2	6	21497	21502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835550
405	NC_002491	CCT	2	6	21640	21645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835551
406	NC_002491	AAAG	2	8	21647	21654	75 %	0 %	25 %	0 %	15835551
407	NC_002491	CTT	2	6	21727	21732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835551
408	NC_002491	TAA	2	6	21779	21784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835551
409	NC_002491	GAGC	2	8	21820	21827	25 %	0 %	50 %	25 %	15835551
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431	NC_002491	CT	3	6	22934	22939	0 %	50 %	0 %	50 %	15835551
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433	NC_002491	ACG	2	6	23039	23044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835551
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435	NC_002491	TGC	2	6	23117	23122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835551
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497	NC_002491	TGC	2	6	27342	27347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835555
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499	NC_002491	TC	3	6	27361	27366	0 %	50 %	0 %	50 %	15835555
500	NC_002491	TA	3	6	27382	27387	50 %	50 %	0 %	0 %	15835555

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