MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 22542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	AGA	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752297
2	NC_002179	CAG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752297
3	NC_002179	TTG	2	6	264	269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752297
4	NC_002179	ATT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752297
5	NC_002179	TGA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752297
6	NC_002179	CTC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752297
7	NC_002179	A	6	6	530	535	100 %	0 %	0 %	0 %	16752297
8	NC_002179	AC	3	6	588	593	50 %	0 %	0 %	50 %	16752297
9	NC_002179	ATG	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752297
10	NC_002179	ATG	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752297
11	NC_002179	ATG	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752297
12	NC_002179	CTT	2	6	802	807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752297
13	NC_002179	A	6	6	861	866	100 %	0 %	0 %	0 %	16752297
14	NC_002179	TCT	2	6	912	917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752297
15	NC_002179	GAG	3	9	924	932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752297
16	NC_002179	CAA	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752297
17	NC_002179	GGTT	2	8	1071	1078	0 %	50 %	50 %	0 %	16752297
18	NC_002179	AG	3	6	1120	1125	50 %	0 %	50 %	0 %	16752297
19	NC_002179	ATT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752297
20	NC_002179	CAC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752298
21	NC_002179	AAT	2	6	1460	1465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752298
22	NC_002179	GA	3	6	1533	1538	50 %	0 %	50 %	0 %	16752298
23	NC_002179	AAC	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752298
24	NC_002179	TTG	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752298
25	NC_002179	TAAT	2	8	1696	1703	50 %	50 %	0 %	0 %	16752298
26	NC_002179	GATT	2	8	1729	1736	25 %	50 %	25 %	0 %	16752298
27	NC_002179	AGCT	2	8	1747	1754	25 %	25 %	25 %	25 %	16752298
28	NC_002179	GTA	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752298
29	NC_002179	TTC	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752298
30	NC_002179	CTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752298
31	NC_002179	GTAG	2	8	2007	2014	25 %	25 %	50 %	0 %	16752298
32	NC_002179	CTT	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752298
33	NC_002179	AG	3	6	2119	2124	50 %	0 %	50 %	0 %	16752298
34	NC_002179	TGA	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752298
35	NC_002179	TC	3	6	2184	2189	0 %	50 %	0 %	50 %	16752298
36	NC_002179	GTT	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752298
37	NC_002179	GA	3	6	2286	2291	50 %	0 %	50 %	0 %	16752298
38	NC_002179	ATG	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752298
39	NC_002179	CGT	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752298
40	NC_002179	ACT	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752298
41	NC_002179	T	8	8	2710	2717	0 %	100 %	0 %	0 %	16752299
42	NC_002179	T	8	8	2722	2729	0 %	100 %	0 %	0 %	16752299
43	NC_002179	TTTTG	2	10	2743	2752	0 %	80 %	20 %	0 %	16752299
44	NC_002179	AAG	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752299
45	NC_002179	GCCA	2	8	2857	2864	25 %	0 %	25 %	50 %	16752299
46	NC_002179	GA	3	6	2873	2878	50 %	0 %	50 %	0 %	16752299
47	NC_002179	ATT	2	6	2889	2894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752299
48	NC_002179	CTGT	2	8	2927	2934	0 %	50 %	25 %	25 %	16752299
49	NC_002179	T	6	6	2972	2977	0 %	100 %	0 %	0 %	16752299
50	NC_002179	AGG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752299
51	NC_002179	TAT	2	6	3059	3064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752299
52	NC_002179	TAT	2	6	3093	3098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752299
53	NC_002179	T	6	6	3098	3103	0 %	100 %	0 %	0 %	16752299
54	NC_002179	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
55	NC_002179	GAG	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752300
56	NC_002179	TTG	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
57	NC_002179	AAAGT	2	10	3361	3370	60 %	20 %	20 %	0 %	16752300
58	NC_002179	CGT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752300
59	NC_002179	A	6	6	3428	3433	100 %	0 %	0 %	0 %	16752300
60	NC_002179	TTC	2	6	3461	3466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752300
61	NC_002179	AATT	2	8	3467	3474	50 %	50 %	0 %	0 %	16752300
62	NC_002179	T	6	6	3505	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	16752300
63	NC_002179	GAA	2	6	3550	3555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
64	NC_002179	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
65	NC_002179	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	16752300
66	NC_002179	ATGCAT	2	12	3637	3648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16752300
67	NC_002179	CAG	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752300
68	NC_002179	TTTC	2	8	3764	3771	0 %	75 %	0 %	25 %	16752300
69	NC_002179	GCG	2	6	3803	3808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16752300
70	NC_002179	ACG	2	6	3822	3827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752300
71	NC_002179	GTT	2	6	3880	3885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
72	NC_002179	AGTT	2	8	3938	3945	25 %	50 %	25 %	0 %	16752300
73	NC_002179	GGT	2	6	3977	3982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752300
74	NC_002179	CTAAGA	2	12	3992	4003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16752300
75	NC_002179	TC	3	6	4133	4138	0 %	50 %	0 %	50 %	16752300
76	NC_002179	TTA	2	6	4151	4156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752300
77	NC_002179	TAA	2	6	4239	4244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752300
78	NC_002179	AG	3	6	4259	4264	50 %	0 %	50 %	0 %	16752300
79	NC_002179	CTT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752300
80	NC_002179	TA	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	16752300
81	NC_002179	AGA	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
82	NC_002179	GTC	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752300
83	NC_002179	TTG	2	6	4373	4378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
84	NC_002179	CTTC	2	8	4418	4425	0 %	50 %	0 %	50 %	16752300
85	NC_002179	CAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752300
86	NC_002179	TTC	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752300
87	NC_002179	ACC	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752300
88	NC_002179	TA	3	6	4487	4492	50 %	50 %	0 %	0 %	16752300
89	NC_002179	AAAGA	2	10	4530	4539	80 %	0 %	20 %	0 %	16752300
90	NC_002179	ATG	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752300
91	NC_002179	TGTT	2	8	4580	4587	0 %	75 %	25 %	0 %	16752300
92	NC_002179	A	6	6	4722	4727	100 %	0 %	0 %	0 %	16752300
93	NC_002179	ACT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752300
94	NC_002179	TGG	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752300
95	NC_002179	GAT	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752300
96	NC_002179	TCCCT	2	10	4789	4798	0 %	40 %	0 %	60 %	16752300
97	NC_002179	ATTACT	2	12	4809	4820	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16752300
98	NC_002179	CCA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752300
99	NC_002179	TCT	3	9	4843	4851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752300
100	NC_002179	GTT	2	6	4882	4887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
101	NC_002179	A	6	6	4899	4904	100 %	0 %	0 %	0 %	16752300
102	NC_002179	AGA	3	9	4920	4928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
103	NC_002179	TTG	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
104	NC_002179	AGAGA	2	10	5082	5091	60 %	0 %	40 %	0 %	16752300
105	NC_002179	AAG	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
106	NC_002179	GAA	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
107	NC_002179	CTTT	2	8	5278	5285	0 %	75 %	0 %	25 %	16752300
108	NC_002179	GAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
109	NC_002179	AAGGA	2	10	5345	5354	60 %	0 %	40 %	0 %	16752300
110	NC_002179	GAA	2	6	5386	5391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
111	NC_002179	AT	3	6	5533	5538	50 %	50 %	0 %	0 %	16752301
112	NC_002179	T	7	7	5542	5548	0 %	100 %	0 %	0 %	16752301
113	NC_002179	CGG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16752301
114	NC_002179	CTTGT	2	10	5677	5686	0 %	60 %	20 %	20 %	16752301
115	NC_002179	GAA	3	9	5714	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752301
116	NC_002179	AGATG	2	10	5767	5776	40 %	20 %	40 %	0 %	16752301
117	NC_002179	AGG	2	6	5833	5838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752301
118	NC_002179	CTT	2	6	5867	5872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752301
119	NC_002179	TC	3	6	5940	5945	0 %	50 %	0 %	50 %	16752301
120	NC_002179	TTA	2	6	5974	5979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752301
121	NC_002179	GAAG	2	8	6028	6035	50 %	0 %	50 %	0 %	16752301
122	NC_002179	GTT	2	6	6066	6071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752301
123	NC_002179	GAAA	2	8	6133	6140	75 %	0 %	25 %	0 %	16752301
124	NC_002179	T	6	6	6155	6160	0 %	100 %	0 %	0 %	16752301
125	NC_002179	GCT	2	6	6251	6256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752301
126	NC_002179	TCA	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752301
127	NC_002179	TGA	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752301
128	NC_002179	AGA	2	6	6355	6360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752301
129	NC_002179	A	6	6	6360	6365	100 %	0 %	0 %	0 %	16752301
130	NC_002179	CAC	2	6	6384	6389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752301
131	NC_002179	AGA	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752301
132	NC_002179	AG	3	6	6473	6478	50 %	0 %	50 %	0 %	16752301
133	NC_002179	AAC	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752301
134	NC_002179	ACA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752301
135	NC_002179	GAA	2	6	6645	6650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752301
136	NC_002179	A	7	7	6672	6678	100 %	0 %	0 %	0 %	16752301
137	NC_002179	A	7	7	6735	6741	100 %	0 %	0 %	0 %	16752302
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139	NC_002179	TC	3	6	6779	6784	0 %	50 %	0 %	50 %	16752302
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288	NC_002179	GTT	2	6	13515	13520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752304
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292	NC_002179	T	6	6	13743	13748	0 %	100 %	0 %	0 %	16752304
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309	NC_002179	CTT	2	6	14373	14378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752305
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395	NC_002179	AGATA	2	10	18826	18835	60 %	20 %	20 %	0 %	16752309
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405	NC_002179	ATA	2	6	19267	19272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752309
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499	NC_002179	GTGAT	2	10	24618	24627	20 %	40 %	40 %	0 %	16752312
500	NC_002179	A	6	6	24696	24701	100 %	0 %	0 %	0 %	16752312

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