MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1

Total Repeats: 3850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_001988	ATC	2	6	173032	173037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004863
3502	NC_001988	T	6	6	173089	173094	0 %	100 %	0 %	0 %	15004863
3503	NC_001988	ATTG	2	8	173111	173118	25 %	50 %	25 %	0 %	15004863
3504	NC_001988	ACTT	2	8	173148	173155	25 %	50 %	0 %	25 %	15004863
3505	NC_001988	TA	3	6	173158	173163	50 %	50 %	0 %	0 %	15004863
3506	NC_001988	GTT	2	6	173186	173191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004863
3507	NC_001988	T	7	7	173236	173242	0 %	100 %	0 %	0 %	15004863
3508	NC_001988	ATGC	2	8	173280	173287	25 %	25 %	25 %	25 %	15004863
3509	NC_001988	CTG	3	9	173307	173315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004863
3510	NC_001988	ATC	2	6	173359	173364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004863
3511	NC_001988	TAC	2	6	173371	173376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004863
3512	NC_001988	TTG	2	6	173388	173393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004863
3513	NC_001988	GTAA	2	8	173441	173448	50 %	25 %	25 %	0 %	15004863
3514	NC_001988	GCT	2	6	173561	173566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004863
3515	NC_001988	GCT	2	6	173621	173626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004863
3516	NC_001988	TGA	2	6	173641	173646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004863
3517	NC_001988	GTCT	2	8	173701	173708	0 %	50 %	25 %	25 %	15004863
3518	NC_001988	CAT	2	6	173766	173771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004863
3519	NC_001988	TAT	2	6	173772	173777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004863
3520	NC_001988	TTAAA	2	10	173808	173817	60 %	40 %	0 %	0 %	15004863
3521	NC_001988	T	8	8	173855	173862	0 %	100 %	0 %	0 %	15004863
3522	NC_001988	T	6	6	173865	173870	0 %	100 %	0 %	0 %	15004863
3523	NC_001988	TTA	2	6	174196	174201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004864
3524	NC_001988	TCAAA	2	10	174273	174282	60 %	20 %	0 %	20 %	15004864
3525	NC_001988	TAA	2	6	174309	174314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004864
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3527	NC_001988	CTTT	2	8	174436	174443	0 %	75 %	0 %	25 %	15004864
3528	NC_001988	TTA	2	6	174451	174456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004864
3529	NC_001988	ATTAA	2	10	174463	174472	60 %	40 %	0 %	0 %	15004864
3530	NC_001988	ATG	2	6	174488	174493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004864
3531	NC_001988	T	6	6	174552	174557	0 %	100 %	0 %	0 %	15004864
3532	NC_001988	TAC	2	6	174616	174621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004864
3533	NC_001988	A	6	6	174736	174741	100 %	0 %	0 %	0 %	15004864
3534	NC_001988	GAA	2	6	174745	174750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004864
3535	NC_001988	AT	3	6	174797	174802	50 %	50 %	0 %	0 %	15004864
3536	NC_001988	AAAG	2	8	174818	174825	75 %	0 %	25 %	0 %	15004864
3537	NC_001988	TAA	2	6	174876	174881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004864
3538	NC_001988	AAT	2	6	174883	174888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004864
3539	NC_001988	GAT	2	6	174931	174936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004864
3540	NC_001988	A	6	6	174974	174979	100 %	0 %	0 %	0 %	15004864
3541	NC_001988	ATG	2	6	175010	175015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004864
3542	NC_001988	GAT	2	6	175108	175113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004864
3543	NC_001988	A	7	7	175114	175120	100 %	0 %	0 %	0 %	15004864
3544	NC_001988	AAG	2	6	175859	175864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004865
3545	NC_001988	A	8	8	175868	175875	100 %	0 %	0 %	0 %	15004865
3546	NC_001988	TGA	2	6	175902	175907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004865
3547	NC_001988	GCA	2	6	175921	175926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004865
3548	NC_001988	GCA	2	6	175930	175935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004865
3549	NC_001988	AGC	2	6	175962	175967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004865
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3551	NC_001988	A	6	6	176057	176062	100 %	0 %	0 %	0 %	15004865
3552	NC_001988	GCT	2	6	176131	176136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004865
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3554	NC_001988	TTTTC	2	10	176210	176219	0 %	80 %	0 %	20 %	15004865
3555	NC_001988	A	7	7	176235	176241	100 %	0 %	0 %	0 %	15004865
3556	NC_001988	AGC	2	6	176253	176258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004865
3557	NC_001988	GTG	2	6	176288	176293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15004865
3558	NC_001988	ATA	2	6	176305	176310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004865
3559	NC_001988	AACT	2	8	176336	176343	50 %	25 %	0 %	25 %	15004865
3560	NC_001988	TGG	2	6	176382	176387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15004865
3561	NC_001988	TTC	2	6	176412	176417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15004865
3562	NC_001988	TAA	2	6	176459	176464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004865
3563	NC_001988	TGA	2	6	176466	176471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004865
3564	NC_001988	ATTAT	2	10	176503	176512	40 %	60 %	0 %	0 %	15004865
3565	NC_001988	AT	3	6	176575	176580	50 %	50 %	0 %	0 %	15004865
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3567	NC_001988	TA	3	6	176617	176622	50 %	50 %	0 %	0 %	15004865
3568	NC_001988	AGC	2	6	176715	176720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004865
3569	NC_001988	TGGC	2	8	176723	176730	0 %	25 %	50 %	25 %	15004865
3570	NC_001988	CCT	2	6	176774	176779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15004865
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3572	NC_001988	TATG	2	8	176829	176836	25 %	50 %	25 %	0 %	15004865
3573	NC_001988	TGA	2	6	176850	176855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004865
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3575	NC_001988	TAA	2	6	176879	176884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004865
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3578	NC_001988	ATAG	2	8	176947	176954	50 %	25 %	25 %	0 %	15004865
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3584	NC_001988	A	7	7	177238	177244	100 %	0 %	0 %	0 %	15004865
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3587	NC_001988	A	7	7	177378	177384	100 %	0 %	0 %	0 %	15004865
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3592	NC_001988	AT	3	6	177541	177546	50 %	50 %	0 %	0 %	15004865
3593	NC_001988	CTG	2	6	177596	177601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15004865
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3596	NC_001988	AG	3	6	177901	177906	50 %	0 %	50 %	0 %	15004865
3597	NC_001988	AGA	2	6	178038	178043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004865
3598	NC_001988	TAA	2	6	178046	178051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004865
3599	NC_001988	TA	3	6	178144	178149	50 %	50 %	0 %	0 %	15004865
3600	NC_001988	GGA	2	6	178156	178161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15004865
3601	NC_001988	TGA	2	6	178167	178172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004865
3602	NC_001988	TTAA	2	8	178189	178196	50 %	50 %	0 %	0 %	15004865
3603	NC_001988	A	7	7	178212	178218	100 %	0 %	0 %	0 %	15004865
3604	NC_001988	GGA	2	6	178260	178265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15004865
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3606	NC_001988	GAT	2	6	178309	178314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15004865
3607	NC_001988	TA	3	6	178369	178374	50 %	50 %	0 %	0 %	15004865
3608	NC_001988	A	6	6	178384	178389	100 %	0 %	0 %	0 %	15004865
3609	NC_001988	AAT	2	6	178470	178475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004866
3610	NC_001988	T	6	6	178533	178538	0 %	100 %	0 %	0 %	15004866
3611	NC_001988	CCAA	2	8	178552	178559	50 %	0 %	0 %	50 %	15004866
3612	NC_001988	T	6	6	178569	178574	0 %	100 %	0 %	0 %	15004866
3613	NC_001988	AAT	2	6	178657	178662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004866
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3616	NC_001988	GCA	2	6	178694	178699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15004866
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3619	NC_001988	CT	3	6	178747	178752	0 %	50 %	0 %	50 %	15004866
3620	NC_001988	GGT	2	6	178801	178806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15004866
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3622	NC_001988	TTGA	2	8	178834	178841	25 %	50 %	25 %	0 %	15004866
3623	NC_001988	GAAA	2	8	178847	178854	75 %	0 %	25 %	0 %	15004866
3624	NC_001988	A	7	7	178852	178858	100 %	0 %	0 %	0 %	15004866
3625	NC_001988	ATTA	2	8	178914	178921	50 %	50 %	0 %	0 %	15004866
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.