MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000117	ATT	2	6	207190	207195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
4002	NC_000117	CT	3	6	207244	207249	0 %	50 %	0 %	50 %	161723223
4003	NC_000117	TTC	2	6	207333	207338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723223
4004	NC_000117	GCT	2	6	207386	207391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723223
4005	NC_000117	CCT	2	6	207411	207416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161723223
4006	NC_000117	T	7	7	207423	207429	0 %	100 %	0 %	0 %	161723223
4007	NC_000117	GAA	2	6	207432	207437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4008	NC_000117	A	7	7	207440	207446	100 %	0 %	0 %	0 %	161723223
4009	NC_000117	A	6	6	207448	207453	100 %	0 %	0 %	0 %	161723223
4010	NC_000117	TTC	2	6	207472	207477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723223
4011	NC_000117	GAA	2	6	207486	207491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4012	NC_000117	GAA	2	6	207558	207563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4013	NC_000117	TTC	2	6	207578	207583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723223
4014	NC_000117	ATT	2	6	207608	207613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
4015	NC_000117	TTAC	2	8	207647	207654	25 %	50 %	0 %	25 %	161723223
4016	NC_000117	AAC	2	6	207680	207685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161723223
4017	NC_000117	A	6	6	207705	207710	100 %	0 %	0 %	0 %	161723223
4018	NC_000117	TTA	2	6	207772	207777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
4019	NC_000117	GAA	2	6	207966	207971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4020	NC_000117	AAG	2	6	208069	208074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723223
4021	NC_000117	TGA	2	6	208076	208081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161723223
4022	NC_000117	TAT	2	6	208084	208089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723223
4023	NC_000117	GGC	2	6	208108	208113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723223
4024	NC_000117	TTA	2	6	208156	208161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604906
4025	NC_000117	ATG	2	6	208168	208173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604906
4026	NC_000117	AAG	2	6	208201	208206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604906
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4029	NC_000117	GC	3	6	208337	208342	0 %	0 %	50 %	50 %	15604906
4030	NC_000117	GTA	2	6	208368	208373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604906
4031	NC_000117	GC	3	6	208388	208393	0 %	0 %	50 %	50 %	15604906
4032	NC_000117	AGA	2	6	208463	208468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604906
4033	NC_000117	TC	3	6	208599	208604	0 %	50 %	0 %	50 %	15604906
4034	NC_000117	GAA	2	6	208626	208631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604906
4035	NC_000117	CCG	2	6	208676	208681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15604906
4036	NC_000117	TAGG	2	8	208783	208790	25 %	25 %	50 %	0 %	15604906
4037	NC_000117	CTC	2	6	208819	208824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604906
4038	NC_000117	TCT	2	6	208848	208853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604906
4039	NC_000117	CTT	3	9	208917	208925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604907
4040	NC_000117	TGT	2	6	208944	208949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604907
4041	NC_000117	AGA	2	6	209003	209008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604907
4042	NC_000117	TGA	2	6	209038	209043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604907
4043	NC_000117	CTT	2	6	209053	209058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604907
4044	NC_000117	T	6	6	209130	209135	0 %	100 %	0 %	0 %	15604907
4045	NC_000117	GCA	2	6	209200	209205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604907
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4048	NC_000117	TCC	2	6	209322	209327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604907
4049	NC_000117	AC	3	6	209344	209349	50 %	0 %	0 %	50 %	15604907
4050	NC_000117	TAG	2	6	209362	209367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604907
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4052	NC_000117	A	6	6	209439	209444	100 %	0 %	0 %	0 %	15604907
4053	NC_000117	ATAA	2	8	209480	209487	75 %	25 %	0 %	0 %	15604907
4054	NC_000117	GAG	2	6	209581	209586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604907
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4058	NC_000117	CT	3	6	209749	209754	0 %	50 %	0 %	50 %	15604907
4059	NC_000117	AGC	2	6	209771	209776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604907
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4061	NC_000117	GTA	2	6	209984	209989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604908
4062	NC_000117	TAG	2	6	210119	210124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604908
4063	NC_000117	TGT	2	6	210193	210198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604908
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4065	NC_000117	ACA	3	9	210215	210223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604908
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4069	NC_000117	CT	3	6	210303	210308	0 %	50 %	0 %	50 %	15604908
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4077	NC_000117	CA	4	8	210765	210772	50 %	0 %	0 %	50 %	15604909
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4082	NC_000117	AGC	2	6	210961	210966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604909
4083	NC_000117	CAT	2	6	210981	210986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604909
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4089	NC_000117	TAA	2	6	211158	211163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604909
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4091	NC_000117	AGTA	2	8	211247	211254	50 %	25 %	25 %	0 %	15604909
4092	NC_000117	TTC	2	6	211301	211306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604909
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4094	NC_000117	TGA	2	6	211398	211403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604909
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4099	NC_000117	TAAC	2	8	211530	211537	50 %	25 %	0 %	25 %	15604909
4100	NC_000117	TCT	2	6	211538	211543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604909
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4105	NC_000117	TTTA	2	8	211807	211814	25 %	75 %	0 %	0 %	15604909
4106	NC_000117	TTC	2	6	211827	211832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604909
4107	NC_000117	AAC	2	6	211975	211980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604909
4108	NC_000117	T	6	6	211996	212001	0 %	100 %	0 %	0 %	15604909
4109	NC_000117	CACGA	2	10	212011	212020	40 %	0 %	20 %	40 %	15604909
4110	NC_000117	ATTT	2	8	212112	212119	25 %	75 %	0 %	0 %	15604909
4111	NC_000117	AAT	2	6	212143	212148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604909
4112	NC_000117	GC	3	6	212192	212197	0 %	0 %	50 %	50 %	15604909
4113	NC_000117	AAT	2	6	212254	212259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604909
4114	NC_000117	CCT	2	6	212261	212266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604909
4115	NC_000117	AATT	2	8	212350	212357	50 %	50 %	0 %	0 %	15604909
4116	NC_000117	TTG	2	6	212382	212387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604909
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4118	NC_000117	GCA	2	6	212567	212572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604909
4119	NC_000117	CAA	2	6	212613	212618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604909
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4121	NC_000117	GAT	2	6	212899	212904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604909
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4123	NC_000117	TTTA	2	8	212911	212918	25 %	75 %	0 %	0 %	15604909
4124	NC_000117	ATT	2	6	212949	212954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604910
4125	NC_000117	TTG	2	6	213095	213100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604910
4126	NC_000117	TC	3	6	213125	213130	0 %	50 %	0 %	50 %	15604910
4127	NC_000117	TTC	2	6	213164	213169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604910
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4134	NC_000117	TTC	2	6	213369	213374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604910
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4142	NC_000117	CCAT	2	8	213652	213659	25 %	25 %	0 %	50 %	15604910
4143	NC_000117	GA	3	6	213670	213675	50 %	0 %	50 %	0 %	15604910
4144	NC_000117	T	6	6	213690	213695	0 %	100 %	0 %	0 %	15604910
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4154	NC_000117	CT	3	6	214143	214148	0 %	50 %	0 %	50 %	15604910
4155	NC_000117	CT	3	6	214151	214156	0 %	50 %	0 %	50 %	15604910
4156	NC_000117	AGC	2	6	214158	214163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604910
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4230	NC_000117	AAAG	2	8	218239	218246	75 %	0 %	25 %	0 %	15604914
4231	NC_000117	TAC	2	6	218261	218266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604914
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4245	NC_000117	A	6	6	218853	218858	100 %	0 %	0 %	0 %	15604914
4246	NC_000117	TTCC	2	8	218887	218894	0 %	50 %	0 %	50 %	15604914
4247	NC_000117	TTC	2	6	218951	218956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604914
4248	NC_000117	ATC	2	6	218976	218981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604914
4249	NC_000117	TAA	3	9	219086	219094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604914
4250	NC_000117	TA	3	6	219191	219196	50 %	50 %	0 %	0 %	15604914
4251	NC_000117	CTG	2	6	219233	219238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604914
4252	NC_000117	CTT	2	6	219254	219259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604914
4253	NC_000117	TCA	2	6	219277	219282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604914
4254	NC_000117	ATG	2	6	219788	219793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604915
4255	NC_000117	GAT	2	6	219846	219851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604915
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4257	NC_000117	AAC	2	6	219890	219895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604915
4258	NC_000117	CTC	2	6	219938	219943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604915
4259	NC_000117	T	7	7	219958	219964	0 %	100 %	0 %	0 %	15604915
4260	NC_000117	A	6	6	219968	219973	100 %	0 %	0 %	0 %	15604915
4261	NC_000117	CTC	2	6	219983	219988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604915
4262	NC_000117	CGAA	2	8	219990	219997	50 %	0 %	25 %	25 %	15604915
4263	NC_000117	ATT	2	6	220005	220010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604915
4264	NC_000117	CAA	2	6	220122	220127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604915
4265	NC_000117	AACA	2	8	220157	220164	75 %	0 %	0 %	25 %	15604915
4266	NC_000117	TGTC	2	8	220184	220191	0 %	50 %	25 %	25 %	15604915
4267	NC_000117	ACG	2	6	220303	220308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604915
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4269	NC_000117	TCTA	2	8	220371	220378	25 %	50 %	0 %	25 %	15604915
4270	NC_000117	CTT	2	6	220433	220438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604915
4271	NC_000117	CA	3	6	220442	220447	50 %	0 %	0 %	50 %	15604915
4272	NC_000117	GA	3	6	220469	220474	50 %	0 %	50 %	0 %	15604915
4273	NC_000117	TCT	2	6	220487	220492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604915
4274	NC_000117	TAGC	2	8	220535	220542	25 %	25 %	25 %	25 %	15604915
4275	NC_000117	C	6	6	220542	220547	0 %	0 %	0 %	100 %	15604915
4276	NC_000117	AAATA	2	10	220551	220560	80 %	20 %	0 %	0 %	15604915
4277	NC_000117	GAA	2	6	220565	220570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604915
4278	NC_000117	ACA	2	6	220651	220656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604915
4279	NC_000117	ACA	2	6	220666	220671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604915
4280	NC_000117	TAA	2	6	220676	220681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604915
4281	NC_000117	AAG	3	9	220703	220711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604915
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4284	NC_000117	CT	3	6	221088	221093	0 %	50 %	0 %	50 %	15604916
4285	NC_000117	GCT	2	6	221131	221136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604916
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4288	NC_000117	ATT	2	6	221196	221201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604916
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4291	NC_000117	TCG	2	6	221288	221293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604916
4292	NC_000117	CT	3	6	221324	221329	0 %	50 %	0 %	50 %	15604916
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4297	NC_000117	CTAT	2	8	221713	221720	25 %	50 %	0 %	25 %	15604917
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4301	NC_000117	GATGCA	2	12	222022	222033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15604917
4302	NC_000117	CAA	2	6	222117	222122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604917
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4304	NC_000117	GCA	2	6	222178	222183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604917
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4309	NC_000117	CTT	2	6	222341	222346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604917
4310	NC_000117	GA	4	8	222389	222396	50 %	0 %	50 %	0 %	15604917
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4314	NC_000117	TCC	2	6	222501	222506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604918
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4316	NC_000117	GAT	2	6	222561	222566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604918
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4322	NC_000117	TTA	2	6	222760	222765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604918
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4324	NC_000117	ATG	2	6	222793	222798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604918
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4333	NC_000117	AGA	2	6	223036	223041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604918
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4339	NC_000117	CTGCTT	2	12	223144	223155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15604918
4340	NC_000117	CAA	2	6	223228	223233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604918
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4342	NC_000117	AT	3	6	223261	223266	50 %	50 %	0 %	0 %	15604918
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4344	NC_000117	CCT	2	6	223366	223371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604918
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4356	NC_000117	TC	3	6	223799	223804	0 %	50 %	0 %	50 %	15604918
4357	NC_000117	A	7	7	223816	223822	100 %	0 %	0 %	0 %	15604918
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4362	NC_000117	CTA	2	6	224148	224153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604919
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4365	NC_000117	CTTT	2	8	224192	224199	0 %	75 %	0 %	25 %	15604919
4366	NC_000117	GTA	2	6	224204	224209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604919
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4372	NC_000117	TGC	2	6	224428	224433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604919
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4499	NC_000117	T	6	6	231290	231295	0 %	100 %	0 %	0 %	15604925
4500	NC_000117	GC	3	6	231449	231454	0 %	0 %	50 %	50 %	15604925

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