MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000117	GAG	2	6	154071	154076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604856
3002	NC_000117	ATT	2	6	154166	154171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604856
3003	NC_000117	AGA	2	6	154226	154231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604856
3004	NC_000117	TTC	2	6	154291	154296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604856
3005	NC_000117	ATA	2	6	154324	154329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604856
3006	NC_000117	ATC	2	6	154372	154377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604856
3007	NC_000117	GCA	2	6	154385	154390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604856
3008	NC_000117	CTG	2	6	154459	154464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604856
3009	NC_000117	GAA	2	6	154488	154493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604856
3010	NC_000117	GAG	2	6	154554	154559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604856
3011	NC_000117	A	6	6	154657	154662	100 %	0 %	0 %	0 %	15604856
3012	NC_000117	TGT	2	6	154673	154678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604856
3013	NC_000117	CCTCAT	2	12	154749	154760	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15604856
3014	NC_000117	AGGC	2	8	154779	154786	25 %	0 %	50 %	25 %	15604856
3015	NC_000117	GAGT	2	8	154867	154874	25 %	25 %	50 %	0 %	15604856
3016	NC_000117	CAC	2	6	155019	155024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604857
3017	NC_000117	TTCTT	2	10	155047	155056	0 %	80 %	0 %	20 %	15604857
3018	NC_000117	GACT	2	8	155075	155082	25 %	25 %	25 %	25 %	15604857
3019	NC_000117	GTA	2	6	155129	155134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604857
3020	NC_000117	TGT	2	6	155198	155203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604857
3021	NC_000117	TA	3	6	155227	155232	50 %	50 %	0 %	0 %	15604857
3022	NC_000117	TGG	3	9	155262	155270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604857
3023	NC_000117	TTG	2	6	155320	155325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604857
3024	NC_000117	GAT	2	6	155377	155382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604857
3025	NC_000117	CG	3	6	155446	155451	0 %	0 %	50 %	50 %	15604857
3026	NC_000117	TTA	2	6	155473	155478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604857
3027	NC_000117	GGA	2	6	155559	155564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604857
3028	NC_000117	T	7	7	155632	155638	0 %	100 %	0 %	0 %	15604857
3029	NC_000117	GAA	2	6	155647	155652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604857
3030	NC_000117	AGG	2	6	155711	155716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604857
3031	NC_000117	AAAG	2	8	155793	155800	75 %	0 %	25 %	0 %	15604857
3032	NC_000117	ATT	2	6	156135	156140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604858
3033	NC_000117	AT	3	6	156144	156149	50 %	50 %	0 %	0 %	15604858
3034	NC_000117	CTT	2	6	156182	156187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604858
3035	NC_000117	TGGAGA	2	12	156207	156218	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15604858
3036	NC_000117	GCTT	2	8	156250	156257	0 %	50 %	25 %	25 %	15604858
3037	NC_000117	GCA	2	6	156280	156285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604858
3038	NC_000117	TAGA	2	8	156302	156309	50 %	25 %	25 %	0 %	15604858
3039	NC_000117	AG	3	6	156377	156382	50 %	0 %	50 %	0 %	15604858
3040	NC_000117	CCCA	2	8	156430	156437	25 %	0 %	0 %	75 %	15604858
3041	NC_000117	CTT	2	6	156451	156456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604858
3042	NC_000117	ATG	2	6	156487	156492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604858
3043	NC_000117	TAA	2	6	156535	156540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604858
3044	NC_000117	T	7	7	156544	156550	0 %	100 %	0 %	0 %	15604858
3045	NC_000117	AGA	2	6	156600	156605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604858
3046	NC_000117	A	6	6	156636	156641	100 %	0 %	0 %	0 %	15604858
3047	NC_000117	GAA	3	9	156703	156711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604858
3048	NC_000117	GT	3	6	156766	156771	0 %	50 %	50 %	0 %	15604858
3049	NC_000117	AGC	2	6	156777	156782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604858
3050	NC_000117	TCT	2	6	156790	156795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604858
3051	NC_000117	AG	3	6	156805	156810	50 %	0 %	50 %	0 %	15604858
3052	NC_000117	AGG	2	6	156878	156883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604858
3053	NC_000117	AG	3	6	156906	156911	50 %	0 %	50 %	0 %	15604858
3054	NC_000117	AG	3	6	156923	156928	50 %	0 %	50 %	0 %	15604858
3055	NC_000117	AG	3	6	156988	156993	50 %	0 %	50 %	0 %	15604858
3056	NC_000117	ATC	2	6	156999	157004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604858
3057	NC_000117	GGA	2	6	157033	157038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604858
3058	NC_000117	ATA	2	6	157069	157074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604858
3059	NC_000117	A	6	6	157077	157082	100 %	0 %	0 %	0 %	15604858
3060	NC_000117	ACAT	2	8	157093	157100	50 %	25 %	0 %	25 %	15604858
3061	NC_000117	ATT	2	6	157291	157296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604859
3062	NC_000117	T	7	7	157333	157339	0 %	100 %	0 %	0 %	15604859
3063	NC_000117	CTTG	2	8	157476	157483	0 %	50 %	25 %	25 %	15604859
3064	NC_000117	GA	3	6	157492	157497	50 %	0 %	50 %	0 %	15604859
3065	NC_000117	GCA	2	6	157545	157550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604859
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3067	NC_000117	CTCCAT	2	12	157577	157588	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15604859
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3069	NC_000117	GAT	2	6	157681	157686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604859
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3073	NC_000117	ATG	2	6	157853	157858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604859
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3090	NC_000117	TGA	2	6	159421	159426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604861
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3097	NC_000117	TAG	2	6	159637	159642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604861
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3105	NC_000117	ATAC	2	8	160026	160033	50 %	25 %	0 %	25 %	15604862
3106	NC_000117	AGG	2	6	160052	160057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604862
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3108	NC_000117	CT	3	6	160165	160170	0 %	50 %	0 %	50 %	15604862
3109	NC_000117	GA	3	6	160175	160180	50 %	0 %	50 %	0 %	15604862
3110	NC_000117	ATT	2	6	160195	160200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604862
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3112	NC_000117	AC	3	6	160315	160320	50 %	0 %	0 %	50 %	15604862
3113	NC_000117	A	8	8	160360	160367	100 %	0 %	0 %	0 %	15604862
3114	NC_000117	ATG	2	6	160441	160446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604862
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3121	NC_000117	TGG	2	6	160939	160944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604863
3122	NC_000117	TC	3	6	161266	161271	0 %	50 %	0 %	50 %	15604863
3123	NC_000117	A	6	6	161284	161289	100 %	0 %	0 %	0 %	15604863
3124	NC_000117	CTG	2	6	161352	161357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604863
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