MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_000117	TCT	2	6	951574	951579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605546
18503	NC_000117	AGG	2	6	951645	951650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18504	NC_000117	GCTT	2	8	951718	951725	0 %	50 %	25 %	25 %	15605546
18505	NC_000117	AGG	3	9	951726	951734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18506	NC_000117	GAGG	2	8	951793	951800	25 %	0 %	75 %	0 %	15605546
18507	NC_000117	GGA	2	6	951814	951819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18508	NC_000117	TTC	2	6	951840	951845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605546
18509	NC_000117	GGT	2	6	951850	951855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605546
18510	NC_000117	GAA	2	6	951885	951890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605546
18511	NC_000117	TC	3	6	951908	951913	0 %	50 %	0 %	50 %	15605546
18512	NC_000117	GAG	3	9	951959	951967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18513	NC_000117	ACA	2	6	952025	952030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605546
18514	NC_000117	GAG	3	9	952067	952075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18515	NC_000117	TAA	2	6	952107	952112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605546
18516	NC_000117	A	6	6	952192	952197	100 %	0 %	0 %	0 %	15605546
18517	NC_000117	CT	3	6	952210	952215	0 %	50 %	0 %	50 %	15605546
18518	NC_000117	GAG	2	6	952232	952237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18519	NC_000117	AGT	2	6	952278	952283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605546
18520	NC_000117	TGCAG	2	10	952301	952310	20 %	20 %	40 %	20 %	15605546
18521	NC_000117	GAA	3	9	952312	952320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605546
18522	NC_000117	ATT	2	6	952326	952331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605546
18523	NC_000117	GTT	2	6	952334	952339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605546
18524	NC_000117	GGA	2	6	952342	952347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18525	NC_000117	GGAT	2	8	952361	952368	25 %	25 %	50 %	0 %	15605546
18526	NC_000117	TTG	2	6	952379	952384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605546
18527	NC_000117	TAA	2	6	952407	952412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605546
18528	NC_000117	AGG	2	6	952437	952442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18529	NC_000117	GAG	3	9	952517	952525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18530	NC_000117	GAGG	2	8	952592	952599	25 %	0 %	75 %	0 %	15605546
18531	NC_000117	ACA	2	6	952676	952681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605546
18532	NC_000117	GAA	2	6	952702	952707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605546
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18534	NC_000117	CTTT	2	8	952765	952772	0 %	75 %	0 %	25 %	15605546
18535	NC_000117	TTA	2	6	952796	952801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605546
18536	NC_000117	TCT	2	6	952864	952869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605546
18537	NC_000117	GAA	2	6	952870	952875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605546
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18539	NC_000117	GGA	2	6	952900	952905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18540	NC_000117	GGC	2	6	952984	952989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15605546
18541	NC_000117	TGT	2	6	953073	953078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605546
18542	NC_000117	T	6	6	953078	953083	0 %	100 %	0 %	0 %	15605546
18543	NC_000117	TGA	2	6	953103	953108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605546
18544	NC_000117	AAC	2	6	953191	953196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605546
18545	NC_000117	GAG	2	6	953210	953215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18546	NC_000117	GGA	2	6	953260	953265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605546
18547	NC_000117	TTC	2	6	953286	953291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605546
18548	NC_000117	CTAT	2	8	953315	953322	25 %	50 %	0 %	25 %	15605546
18549	NC_000117	ACG	2	6	953387	953392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605546
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18551	NC_000117	CTG	2	6	953426	953431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605546
18552	NC_000117	AAAGT	2	10	953498	953507	60 %	20 %	20 %	0 %	15605546
18553	NC_000117	ACA	2	6	953526	953531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605546
18554	NC_000117	GCT	2	6	953611	953616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605546
18555	NC_000117	ACA	2	6	953655	953660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605546
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18559	NC_000117	CCT	2	6	953798	953803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605546
18560	NC_000117	TCT	2	6	953806	953811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605546
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18565	NC_000117	ACA	2	6	953905	953910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605546
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18606	NC_000117	TGA	2	6	956090	956095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605547
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18609	NC_000117	CGA	2	6	956259	956264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605548
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18617	NC_000117	ATTT	2	8	956518	956525	25 %	75 %	0 %	0 %	15605548
18618	NC_000117	T	8	8	956523	956530	0 %	100 %	0 %	0 %	15605548
18619	NC_000117	T	7	7	956578	956584	0 %	100 %	0 %	0 %	15605548
18620	NC_000117	GGC	2	6	956640	956645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15605548
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18992	NC_000117	TGAT	2	8	976539	976546	25 %	50 %	25 %	0 %	15605562
18993	NC_000117	CAA	2	6	976560	976565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605562
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18995	NC_000117	CTT	2	6	976725	976730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605562
18996	NC_000117	GTT	2	6	976816	976821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605562
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