MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_000117	CTG	2	6	811876	811881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605438
16003	NC_000117	TCT	2	6	811914	811919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605438
16004	NC_000117	TAA	2	6	812033	812038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605438
16005	NC_000117	T	7	7	812125	812131	0 %	100 %	0 %	0 %	15605438
16006	NC_000117	CG	3	6	812132	812137	0 %	0 %	50 %	50 %	15605438
16007	NC_000117	TTG	2	6	812203	812208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605438
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16009	NC_000117	AGA	2	6	812435	812440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605439
16010	NC_000117	CTT	2	6	812473	812478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605439
16011	NC_000117	TC	4	8	812496	812503	0 %	50 %	0 %	50 %	15605439
16012	NC_000117	T	6	6	812518	812523	0 %	100 %	0 %	0 %	15605439
16013	NC_000117	T	6	6	812567	812572	0 %	100 %	0 %	0 %	15605439
16014	NC_000117	CAG	2	6	812587	812592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605439
16015	NC_000117	CCT	2	6	812628	812633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605439
16016	NC_000117	ATC	2	6	812646	812651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605439
16017	NC_000117	ATA	2	6	812698	812703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605439
16018	NC_000117	CTG	2	6	812791	812796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605439
16019	NC_000117	AT	3	6	812799	812804	50 %	50 %	0 %	0 %	15605439
16020	NC_000117	TGA	2	6	812818	812823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605439
16021	NC_000117	TAG	2	6	812839	812844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605439
16022	NC_000117	AATA	2	8	812947	812954	75 %	25 %	0 %	0 %	15605439
16023	NC_000117	CGC	2	6	812968	812973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605439
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16027	NC_000117	T	6	6	813201	813206	0 %	100 %	0 %	0 %	15605440
16028	NC_000117	CAA	2	6	813257	813262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605440
16029	NC_000117	ATC	2	6	813277	813282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605440
16030	NC_000117	CATC	2	8	813335	813342	25 %	25 %	0 %	50 %	15605440
16031	NC_000117	AT	3	6	813343	813348	50 %	50 %	0 %	0 %	15605440
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16033	NC_000117	CCTT	2	8	813422	813429	0 %	50 %	0 %	50 %	15605440
16034	NC_000117	CTT	2	6	813443	813448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605440
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16038	NC_000117	CTT	2	6	813632	813637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605440
16039	NC_000117	TTC	2	6	813670	813675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605440
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16042	NC_000117	ATTT	2	8	813899	813906	25 %	75 %	0 %	0 %	15605440
16043	NC_000117	TCA	2	6	813934	813939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605440
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16046	NC_000117	TCT	2	6	814054	814059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605440
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16048	NC_000117	GAG	2	6	814192	814197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605440
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16050	NC_000117	AAAC	2	8	814266	814273	75 %	0 %	0 %	25 %	15605440
16051	NC_000117	CAA	2	6	814313	814318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605440
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16054	NC_000117	T	8	8	814363	814370	0 %	100 %	0 %	0 %	15605440
16055	NC_000117	CTT	2	6	814385	814390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605440
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16057	NC_000117	ACACA	2	10	814436	814445	60 %	0 %	0 %	40 %	15605440
16058	NC_000117	TCT	2	6	814456	814461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605440
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16061	NC_000117	TCTT	2	8	815182	815189	0 %	75 %	0 %	25 %	15605441
16062	NC_000117	GAG	2	6	815195	815200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605441
16063	NC_000117	GAG	2	6	815246	815251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605441
16064	NC_000117	TGC	2	6	815302	815307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605441
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16067	NC_000117	A	7	7	815394	815400	100 %	0 %	0 %	0 %	15605441
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16073	NC_000117	AGA	2	6	815788	815793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605441
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16108	NC_000117	GTT	2	6	817319	817324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605441
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16115	NC_000117	GA	3	6	817745	817750	50 %	0 %	50 %	0 %	15605441
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16122	NC_000117	TGG	2	6	818129	818134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605441
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